MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011777	TGAAA	2	10	313	322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011777	TTTAT	2	10	523	532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011777	TATTT	2	10	549	558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011777	TAAAA	2	10	2881	2890	80 %	20 %	0 %	0 %	218848205
5	NC_011777	ATGAT	2	10	3282	3291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011777	AAGAA	2	10	3937	3946	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011777	TACAA	2	10	4298	4307	60 %	20 %	0 %	20 %	218848367
8	NC_011777	ATTTG	2	10	6610	6619	20 %	60 %	20 %	0 %	218848402
9	NC_011777	TTCTG	2	10	7781	7790	0 %	60 %	20 %	20 %	218848296
10	NC_011777	TTACT	2	10	8299	8308	20 %	60 %	0 %	20 %	218848219
11	NC_011777	ATACG	2	10	8555	8564	40 %	20 %	20 %	20 %	218848219
12	NC_011777	GCATT	2	10	8773	8782	20 %	40 %	20 %	20 %	218848219
13	NC_011777	CATTC	2	10	9733	9742	20 %	40 %	0 %	40 %	218848219
14	NC_011777	TTTGT	2	10	10072	10081	0 %	80 %	20 %	0 %	218848300
15	NC_011777	TAAAA	2	10	14205	14214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011777	TTCCT	2	10	14499	14508	0 %	60 %	0 %	40 %	218848251
17	NC_011777	TTTTC	2	10	15694	15703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011777	TTGTT	2	10	16553	16562	0 %	80 %	20 %	0 %	218848481
19	NC_011777	CGTTC	2	10	17945	17954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011777	CACAA	2	10	19356	19365	60 %	0 %	0 %	40 %	218848209
21	NC_011777	CTTGT	2	10	23735	23744	0 %	60 %	20 %	20 %	218848447
22	NC_011777	AGTTG	2	10	24795	24804	20 %	40 %	40 %	0 %	218848447
23	NC_011777	GATAA	2	10	25648	25657	60 %	20 %	20 %	0 %	218848350
24	NC_011777	AATTA	2	10	25989	25998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011777	AGCCA	2	10	27251	27260	40 %	0 %	20 %	40 %	218848335
26	NC_011777	TCCGT	2	10	27796	27805	0 %	40 %	20 %	40 %	218848335
27	NC_011777	AAATA	2	10	28744	28753	80 %	20 %	0 %	0 %	218848335
28	NC_011777	ATTTC	2	10	31920	31929	20 %	60 %	0 %	20 %	218848368
29	NC_011777	CCTTC	2	10	34628	34637	0 %	40 %	0 %	60 %	218848280
30	NC_011777	GAAAT	2	10	36306	36315	60 %	20 %	20 %	0 %	218848449
31	NC_011777	AAGAA	2	10	37197	37206	80 %	0 %	20 %	0 %	218848342
32	NC_011777	GAAAT	2	10	39143	39152	60 %	20 %	20 %	0 %	218848191
33	NC_011777	CACAA	2	10	43850	43859	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011777	ATAAG	2	10	44466	44475	60 %	20 %	20 %	0 %	218848385
35	NC_011777	CATTC	2	10	44690	44699	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011777	TAGGA	2	10	44772	44781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011777	AAAAT	2	10	45037	45046	80 %	20 %	0 %	0 %	218848294
38	NC_011777	CACAA	2	10	45602	45611	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011777	TTTGC	2	10	46469	46478	0 %	60 %	20 %	20 %	218848381
40	NC_011777	ACAAA	2	10	48669	48678	80 %	0 %	0 %	20 %	218848260
41	NC_011777	AAAAT	2	10	48814	48823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011777	GAAGC	2	10	50669	50678	40 %	0 %	40 %	20 %	218848469
43	NC_011777	ATGGA	2	10	51257	51266	40 %	20 %	40 %	0 %	218848469
44	NC_011777	TTATT	2	10	52295	52304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011777	ATTTA	2	10	52353	52362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011777	GAAGT	2	10	52730	52739	40 %	20 %	40 %	0 %	218848427
47	NC_011777	TACGA	2	10	53868	53877	40 %	20 %	20 %	20 %	218848427
48	NC_011777	AGTAA	2	10	54109	54118	60 %	20 %	20 %	0 %	218848427
49	NC_011777	AAAGA	2	10	55699	55708	80 %	0 %	20 %	0 %	218848427
50	NC_011777	TGATT	2	10	56372	56381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011777	CTTCT	2	10	56673	56682	0 %	60 %	0 %	40 %	218848278
52	NC_011777	CTCTT	2	10	58637	58646	0 %	60 %	0 %	40 %	218848377
53	NC_011777	TTGAT	2	10	58724	58733	20 %	60 %	20 %	0 %	218848377
54	NC_011777	ATCAA	2	10	61508	61517	60 %	20 %	0 %	20 %	218848224
55	NC_011777	TAATA	2	10	61727	61736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011777	GTGAT	2	10	65381	65390	20 %	40 %	40 %	0 %	218848480
57	NC_011777	AAAAG	2	10	66734	66743	80 %	0 %	20 %	0 %	218848480
58	NC_011777	GAAAC	2	10	68599	68608	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
59	NC_011777	GAAAC	2	10	68647	68656	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
60	NC_011777	GAAAC	2	10	68695	68704	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
61	NC_011777	GAAAC	2	10	68899	68908	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
62	NC_011777	GTCAT	2	10	69959	69968	20 %	40 %	20 %	20 %	218848238
63	NC_011777	AAAAT	2	10	70919	70928	80 %	20 %	0 %	0 %	218848238
64	NC_011777	AAGGT	2	10	71017	71026	40 %	20 %	40 %	0 %	218848238
65	NC_011777	GAAAA	2	10	71038	71047	80 %	0 %	20 %	0 %	218848238
66	NC_011777	TGGGA	2	10	71575	71584	20 %	20 %	60 %	0 %	218848238
67	NC_011777	GGAAA	2	10	71809	71818	60 %	0 %	40 %	0 %	218848238
68	NC_011777	GAAAG	2	10	72569	72578	60 %	0 %	40 %	0 %	218848321
69	NC_011777	AGAAA	2	10	73465	73474	80 %	0 %	20 %	0 %	218848261
70	NC_011777	AAGAA	2	10	73985	73994	80 %	0 %	20 %	0 %	218848496
71	NC_011777	TAGTA	2	10	76086	76095	40 %	40 %	20 %	0 %	218848445
72	NC_011777	ATTGC	2	10	77618	77627	20 %	40 %	20 %	20 %	218848410
73	NC_011777	AATTC	2	10	78720	78729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011777	GAATG	2	10	79486	79495	40 %	20 %	40 %	0 %	218848467
75	NC_011777	ATGAA	2	10	79581	79590	60 %	20 %	20 %	0 %	218848467
76	NC_011777	AAACC	2	10	79719	79728	60 %	0 %	0 %	40 %	218848467
77	NC_011777	TATAA	2	10	84116	84125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011777	TTTAT	2	10	84139	84148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011777	AAAAG	2	10	84614	84623	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011777	ATTTG	2	10	85719	85728	20 %	60 %	20 %	0 %	218848439
81	NC_011777	TAATT	2	10	85741	85750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011777	AAACA	2	10	85799	85808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011777	CTTAC	2	10	85875	85884	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011777	AAATG	2	10	86427	86436	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011777	AGTTA	2	10	88180	88189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011777	AAACA	2	10	88224	88233	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011777	ATTTG	2	10	90632	90641	20 %	60 %	20 %	0 %	218848208
88	NC_011777	GGAGC	2	10	91766	91775	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011777	TTTTA	2	10	92843	92852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011777	CAGTA	2	10	93378	93387	40 %	20 %	20 %	20 %	218848264
91	NC_011777	AAATG	2	10	96977	96986	60 %	20 %	20 %	0 %	218848375
92	NC_011777	TAAAT	2	10	97807	97816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011777	TTGTG	2	10	97997	98006	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011777	TTTTA	2	10	98842	98851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011777	TATGG	2	10	99319	99328	20 %	40 %	40 %	0 %	218848432
96	NC_011777	ATGAA	2	10	101151	101160	60 %	20 %	20 %	0 %	218848429
97	NC_011777	ATTCC	2	10	101210	101219	20 %	40 %	0 %	40 %	218848429
98	NC_011777	CAAAA	2	10	101581	101590	80 %	0 %	0 %	20 %	218848429
99	NC_011777	ATTTT	2	10	103683	103692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011777	TATAA	2	10	103733	103742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011777	AATAA	2	10	103760	103769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011777	TGAAG	2	10	106886	106895	40 %	20 %	40 %	0 %	218848357
103	NC_011777	TAACT	2	10	107465	107474	40 %	40 %	0 %	20 %	218848357
104	NC_011777	GATAA	2	10	107697	107706	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011777	TGAAT	2	10	116963	116972	40 %	40 %	20 %	0 %	218848282
106	NC_011777	GGAAG	2	10	117438	117447	40 %	0 %	60 %	0 %	218848282
107	NC_011777	AACGA	2	10	118050	118059	60 %	0 %	20 %	20 %	218848468
108	NC_011777	AAGAA	2	10	118385	118394	80 %	0 %	20 %	0 %	218848324
109	NC_011777	GTTAT	2	10	118773	118782	20 %	60 %	20 %	0 %	218848215
110	NC_011777	TCCAG	2	10	121460	121469	20 %	20 %	20 %	40 %	218848382
111	NC_011777	CATCT	2	10	122279	122288	20 %	40 %	0 %	40 %	218848382
112	NC_011777	TTCTT	2	10	122641	122650	0 %	80 %	0 %	20 %	218848382
113	NC_011777	TTTTA	2	10	127206	127215	20 %	80 %	0 %	0 %	218848392
114	NC_011777	TTTTA	2	10	127647	127656	20 %	80 %	0 %	0 %	218848392
115	NC_011777	CAAAT	2	10	127806	127815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011777	GCTAT	2	10	130618	130627	20 %	40 %	20 %	20 %	218848245
117	NC_011777	TGCAA	2	10	131749	131758	40 %	20 %	20 %	20 %	218848423
118	NC_011777	GGTTG	2	10	131774	131783	0 %	40 %	60 %	0 %	218848423
119	NC_011777	AACAG	2	10	132459	132468	60 %	0 %	20 %	20 %	218848484
120	NC_011777	AAGTA	2	10	133259	133268	60 %	20 %	20 %	0 %	218848418
121	NC_011777	TCAAA	2	10	133813	133822	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011777	AAGAT	2	10	134607	134616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011777	ATCTT	2	10	134628	134637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011777	GATAT	2	10	135799	135808	40 %	40 %	20 %	0 %	218848374
125	NC_011777	CGATT	2	10	135871	135880	20 %	40 %	20 %	20 %	218848374
126	NC_011777	TATAC	2	10	135988	135997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011777	CATTA	2	10	137472	137481	40 %	40 %	0 %	20 %	218848471
128	NC_011777	AAAGA	2	10	140965	140974	80 %	0 %	20 %	0 %	218848216
129	NC_011777	TTGAT	2	10	144287	144296	20 %	60 %	20 %	0 %	218848311
130	NC_011777	TTAAT	2	10	144758	144767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011777	AAGAT	2	10	145855	145864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011777	TACAA	2	10	146561	146570	60 %	20 %	0 %	20 %	218848349
133	NC_011777	CCATA	2	10	148271	148280	40 %	20 %	0 %	40 %	218848434
134	NC_011777	TTGTT	2	10	149001	149010	0 %	80 %	20 %	0 %	218848406
135	NC_011777	TAAAG	2	10	149050	149059	60 %	20 %	20 %	0 %	218848406
136	NC_011777	GCAAA	2	10	149288	149297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011777	TACTT	2	10	150552	150561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011777	AATGT	2	10	150619	150628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011777	AATTT	2	10	151890	151899	40 %	60 %	0 %	0 %	218848253
140	NC_011777	CATTA	2	10	152127	152136	40 %	40 %	0 %	20 %	218848233
141	NC_011777	AAAAT	2	10	152704	152713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.