MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011777	TAAAA	2	10	2881	2890	80 %	20 %	0 %	0 %	218848205
2	NC_011777	TACAA	2	10	4298	4307	60 %	20 %	0 %	20 %	218848367
3	NC_011777	ATTTG	2	10	6610	6619	20 %	60 %	20 %	0 %	218848402
4	NC_011777	TTCTG	2	10	7781	7790	0 %	60 %	20 %	20 %	218848296
5	NC_011777	TTACT	2	10	8299	8308	20 %	60 %	0 %	20 %	218848219
6	NC_011777	ATACG	2	10	8555	8564	40 %	20 %	20 %	20 %	218848219
7	NC_011777	GCATT	2	10	8773	8782	20 %	40 %	20 %	20 %	218848219
8	NC_011777	CATTC	2	10	9733	9742	20 %	40 %	0 %	40 %	218848219
9	NC_011777	TTTGT	2	10	10072	10081	0 %	80 %	20 %	0 %	218848300
10	NC_011777	TTCCT	2	10	14499	14508	0 %	60 %	0 %	40 %	218848251
11	NC_011777	TTGTT	2	10	16553	16562	0 %	80 %	20 %	0 %	218848481
12	NC_011777	CACAA	2	10	19356	19365	60 %	0 %	0 %	40 %	218848209
13	NC_011777	CTTGT	2	10	23735	23744	0 %	60 %	20 %	20 %	218848447
14	NC_011777	AGTTG	2	10	24795	24804	20 %	40 %	40 %	0 %	218848447
15	NC_011777	GATAA	2	10	25648	25657	60 %	20 %	20 %	0 %	218848350
16	NC_011777	AGCCA	2	10	27251	27260	40 %	0 %	20 %	40 %	218848335
17	NC_011777	TCCGT	2	10	27796	27805	0 %	40 %	20 %	40 %	218848335
18	NC_011777	AAATA	2	10	28744	28753	80 %	20 %	0 %	0 %	218848335
19	NC_011777	ATTTC	2	10	31920	31929	20 %	60 %	0 %	20 %	218848368
20	NC_011777	CCTTC	2	10	34628	34637	0 %	40 %	0 %	60 %	218848280
21	NC_011777	GAAAT	2	10	36306	36315	60 %	20 %	20 %	0 %	218848449
22	NC_011777	AAGAA	2	10	37197	37206	80 %	0 %	20 %	0 %	218848342
23	NC_011777	GAAAT	2	10	39143	39152	60 %	20 %	20 %	0 %	218848191
24	NC_011777	ATAAG	2	10	44466	44475	60 %	20 %	20 %	0 %	218848385
25	NC_011777	AAAAT	2	10	45037	45046	80 %	20 %	0 %	0 %	218848294
26	NC_011777	TTTGC	2	10	46469	46478	0 %	60 %	20 %	20 %	218848381
27	NC_011777	ACAAA	2	10	48669	48678	80 %	0 %	0 %	20 %	218848260
28	NC_011777	GAAGC	2	10	50669	50678	40 %	0 %	40 %	20 %	218848469
29	NC_011777	ATGGA	2	10	51257	51266	40 %	20 %	40 %	0 %	218848469
30	NC_011777	GAAGT	2	10	52730	52739	40 %	20 %	40 %	0 %	218848427
31	NC_011777	TACGA	2	10	53868	53877	40 %	20 %	20 %	20 %	218848427
32	NC_011777	AGTAA	2	10	54109	54118	60 %	20 %	20 %	0 %	218848427
33	NC_011777	AAAGA	2	10	55699	55708	80 %	0 %	20 %	0 %	218848427
34	NC_011777	CTTCT	2	10	56673	56682	0 %	60 %	0 %	40 %	218848278
35	NC_011777	CTCTT	2	10	58637	58646	0 %	60 %	0 %	40 %	218848377
36	NC_011777	TTGAT	2	10	58724	58733	20 %	60 %	20 %	0 %	218848377
37	NC_011777	ATCAA	2	10	61508	61517	60 %	20 %	0 %	20 %	218848224
38	NC_011777	GTGAT	2	10	65381	65390	20 %	40 %	40 %	0 %	218848480
39	NC_011777	AAAAG	2	10	66734	66743	80 %	0 %	20 %	0 %	218848480
40	NC_011777	GAAAC	2	10	68599	68608	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
41	NC_011777	GAAAC	2	10	68647	68656	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
42	NC_011777	GAAAC	2	10	68695	68704	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
43	NC_011777	GAAAC	2	10	68899	68908	60 %	0 %	20 %	20 %	218848477
44	NC_011777	GTCAT	2	10	69959	69968	20 %	40 %	20 %	20 %	218848238
45	NC_011777	AAAAT	2	10	70919	70928	80 %	20 %	0 %	0 %	218848238
46	NC_011777	AAGGT	2	10	71017	71026	40 %	20 %	40 %	0 %	218848238
47	NC_011777	GAAAA	2	10	71038	71047	80 %	0 %	20 %	0 %	218848238
48	NC_011777	TGGGA	2	10	71575	71584	20 %	20 %	60 %	0 %	218848238
49	NC_011777	GGAAA	2	10	71809	71818	60 %	0 %	40 %	0 %	218848238
50	NC_011777	GAAAG	2	10	72569	72578	60 %	0 %	40 %	0 %	218848321
51	NC_011777	AGAAA	2	10	73465	73474	80 %	0 %	20 %	0 %	218848261
52	NC_011777	AAGAA	2	10	73985	73994	80 %	0 %	20 %	0 %	218848496
53	NC_011777	TAGTA	2	10	76086	76095	40 %	40 %	20 %	0 %	218848445
54	NC_011777	ATTGC	2	10	77618	77627	20 %	40 %	20 %	20 %	218848410
55	NC_011777	GAATG	2	10	79486	79495	40 %	20 %	40 %	0 %	218848467
56	NC_011777	ATGAA	2	10	79581	79590	60 %	20 %	20 %	0 %	218848467
57	NC_011777	AAACC	2	10	79719	79728	60 %	0 %	0 %	40 %	218848467
58	NC_011777	ATTTG	2	10	85719	85728	20 %	60 %	20 %	0 %	218848439
59	NC_011777	ATTTG	2	10	90632	90641	20 %	60 %	20 %	0 %	218848208
60	NC_011777	CAGTA	2	10	93378	93387	40 %	20 %	20 %	20 %	218848264
61	NC_011777	AAATG	2	10	96977	96986	60 %	20 %	20 %	0 %	218848375
62	NC_011777	TATGG	2	10	99319	99328	20 %	40 %	40 %	0 %	218848432
63	NC_011777	ATGAA	2	10	101151	101160	60 %	20 %	20 %	0 %	218848429
64	NC_011777	ATTCC	2	10	101210	101219	20 %	40 %	0 %	40 %	218848429
65	NC_011777	CAAAA	2	10	101581	101590	80 %	0 %	0 %	20 %	218848429
66	NC_011777	TGAAG	2	10	106886	106895	40 %	20 %	40 %	0 %	218848357
67	NC_011777	TAACT	2	10	107465	107474	40 %	40 %	0 %	20 %	218848357
68	NC_011777	TGAAT	2	10	116963	116972	40 %	40 %	20 %	0 %	218848282
69	NC_011777	GGAAG	2	10	117438	117447	40 %	0 %	60 %	0 %	218848282
70	NC_011777	AACGA	2	10	118050	118059	60 %	0 %	20 %	20 %	218848468
71	NC_011777	AAGAA	2	10	118385	118394	80 %	0 %	20 %	0 %	218848324
72	NC_011777	GTTAT	2	10	118773	118782	20 %	60 %	20 %	0 %	218848215
73	NC_011777	TCCAG	2	10	121460	121469	20 %	20 %	20 %	40 %	218848382
74	NC_011777	CATCT	2	10	122279	122288	20 %	40 %	0 %	40 %	218848382
75	NC_011777	TTCTT	2	10	122641	122650	0 %	80 %	0 %	20 %	218848382
76	NC_011777	TTTTA	2	10	127206	127215	20 %	80 %	0 %	0 %	218848392
77	NC_011777	TTTTA	2	10	127647	127656	20 %	80 %	0 %	0 %	218848392
78	NC_011777	GCTAT	2	10	130618	130627	20 %	40 %	20 %	20 %	218848245
79	NC_011777	TGCAA	2	10	131749	131758	40 %	20 %	20 %	20 %	218848423
80	NC_011777	GGTTG	2	10	131774	131783	0 %	40 %	60 %	0 %	218848423
81	NC_011777	AACAG	2	10	132459	132468	60 %	0 %	20 %	20 %	218848484
82	NC_011777	AAGTA	2	10	133259	133268	60 %	20 %	20 %	0 %	218848418
83	NC_011777	GATAT	2	10	135799	135808	40 %	40 %	20 %	0 %	218848374
84	NC_011777	CGATT	2	10	135871	135880	20 %	40 %	20 %	20 %	218848374
85	NC_011777	CATTA	2	10	137472	137481	40 %	40 %	0 %	20 %	218848471
86	NC_011777	AAAGA	2	10	140965	140974	80 %	0 %	20 %	0 %	218848216
87	NC_011777	TTGAT	2	10	144287	144296	20 %	60 %	20 %	0 %	218848311
88	NC_011777	TACAA	2	10	146561	146570	60 %	20 %	0 %	20 %	218848349
89	NC_011777	CCATA	2	10	148271	148280	40 %	20 %	0 %	40 %	218848434
90	NC_011777	TTGTT	2	10	149001	149010	0 %	80 %	20 %	0 %	218848406
91	NC_011777	TAAAG	2	10	149050	149059	60 %	20 %	20 %	0 %	218848406
92	NC_011777	AATTT	2	10	151890	151899	40 %	60 %	0 %	0 %	218848253
93	NC_011777	CATTA	2	10	152127	152136	40 %	40 %	0 %	20 %	218848233
94	NC_011777	TATCA	2	10	153639	153648	40 %	40 %	0 %	20 %	218848330
95	NC_011777	TGATT	2	10	153969	153978	20 %	60 %	20 %	0 %	218848458
96	NC_011777	AAAGG	2	10	155575	155584	60 %	0 %	40 %	0 %	218848505
97	NC_011777	CTTTA	2	10	156837	156846	20 %	60 %	0 %	20 %	218848485
98	NC_011777	ATTCC	2	10	159310	159319	20 %	40 %	0 %	40 %	218848210
99	NC_011777	GAAAA	2	10	160070	160079	80 %	0 %	20 %	0 %	218848400
100	NC_011777	CTCTA	2	10	162255	162264	20 %	40 %	0 %	40 %	218848393
101	NC_011777	ATTTC	2	10	164091	164100	20 %	60 %	0 %	20 %	218848479
102	NC_011777	TACCT	2	10	164690	164699	20 %	40 %	0 %	40 %	218848252
103	NC_011777	AATAA	2	10	167860	167869	80 %	20 %	0 %	0 %	218848230
104	NC_011777	AAATA	2	10	169591	169600	80 %	20 %	0 %	0 %	218848203
105	NC_011777	TGTAC	2	10	172345	172354	20 %	40 %	20 %	20 %	218848319
106	NC_011777	CCTTG	2	10	172624	172633	0 %	40 %	20 %	40 %	218848492
107	NC_011777	GAAAA	2	10	172836	172845	80 %	0 %	20 %	0 %	218848492
108	NC_011777	TCTGC	2	10	173371	173380	0 %	40 %	20 %	40 %	218848492
109	NC_011777	TTGAT	2	10	173591	173600	20 %	60 %	20 %	0 %	218848492
110	NC_011777	CATTT	2	10	174512	174521	20 %	60 %	0 %	20 %	218848289
111	NC_011777	TGTCG	2	10	177522	177531	0 %	40 %	40 %	20 %	218848188
112	NC_011777	CACTT	2	10	178173	178182	20 %	40 %	0 %	40 %	218848188
113	NC_011777	AAATA	2	10	178575	178584	80 %	20 %	0 %	0 %	218848188
114	NC_011777	ACAAA	2	10	178667	178676	80 %	0 %	0 %	20 %	218848188
115	NC_011777	ACTCT	2	10	179239	179248	20 %	40 %	0 %	40 %	218848281
116	NC_011777	TTTGT	2	10	181582	181591	0 %	80 %	20 %	0 %	218848336
117	NC_011777	AAACC	2	10	183055	183064	60 %	0 %	0 %	40 %	218848333
118	NC_011777	ATATT	2	10	183229	183238	40 %	60 %	0 %	0 %	218848333
119	NC_011777	TTGTT	2	10	183701	183710	0 %	80 %	20 %	0 %	218848333
120	NC_011777	AAAGG	2	10	184655	184664	60 %	0 %	40 %	0 %	218848396
121	NC_011777	ATTTG	2	10	185509	185518	20 %	60 %	20 %	0 %	218848487
122	NC_011777	AAATT	2	10	185671	185680	60 %	40 %	0 %	0 %	218848487
123	NC_011777	CTGTG	2	10	186057	186066	0 %	40 %	40 %	20 %	218848487
124	NC_011777	AAACA	2	10	187411	187420	80 %	0 %	0 %	20 %	218848334
125	NC_011777	AGCAA	2	10	188423	188432	60 %	0 %	20 %	20 %	218848334
126	NC_011777	TCTGT	2	10	189402	189411	0 %	60 %	20 %	20 %	218848412
127	NC_011777	AGAAA	2	10	190180	190189	80 %	0 %	20 %	0 %	218848412
128	NC_011777	AATGG	2	10	190334	190343	40 %	20 %	40 %	0 %	218848412
129	NC_011777	GAATT	2	10	190656	190665	40 %	40 %	20 %	0 %	218848186
130	NC_011777	ATTCT	2	10	194636	194645	20 %	60 %	0 %	20 %	218848315
131	NC_011777	TACAC	2	10	195472	195481	40 %	20 %	0 %	40 %	218848315
132	NC_011777	GGAGC	2	10	196191	196200	20 %	0 %	60 %	20 %	218848258
133	NC_011777	ATACT	2	10	199272	199281	40 %	40 %	0 %	20 %	218848463
134	NC_011777	AGCCC	2	10	201894	201903	20 %	0 %	20 %	60 %	218848249
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.