MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011777	CTTT	2	8	467	474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011777	TCAA	2	8	646	653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011777	TAAA	2	8	1627	1634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011777	ATTA	2	8	1798	1805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011777	ATTA	2	8	1906	1913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011777	TTTA	2	8	1925	1932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011777	ATAG	3	12	3124	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011777	AAAC	2	8	3213	3220	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011777	AAAT	2	8	3231	3238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011777	TTCT	2	8	4108	4115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011777	ACAT	2	8	4530	4537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011777	TCCT	2	8	5630	5637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011777	GAAA	2	8	5862	5869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011777	AATG	2	8	7472	7479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011777	CTAT	3	12	7499	7510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011777	CATA	2	8	12367	12374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011777	TTAG	2	8	18195	18202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011777	TTAC	2	8	18451	18458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011777	AAAT	2	8	23196	23203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011777	TCAT	2	8	24994	25001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011777	TATC	2	8	25133	25140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011777	GAAA	2	8	25292	25299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011777	AAAT	2	8	25302	25309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011777	AATA	2	8	26810	26817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011777	TTCT	2	8	29281	29288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011777	ATAA	2	8	31675	31682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011777	TAGA	2	8	34147	34154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011777	AAGA	2	8	36674	36681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011777	TAAT	2	8	43665	43672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011777	AATA	2	8	43894	43901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011777	AATA	2	8	45645	45652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011777	ACAA	2	8	46267	46274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011777	TTTA	2	8	48318	48325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011777	AATA	2	8	57792	57799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011777	CGGA	2	8	57979	57986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011777	ATTT	2	8	58057	58064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011777	TAAT	2	8	60091	60098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011777	CATT	2	8	60114	60121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011777	GAAT	2	8	60138	60145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011777	TAAA	2	8	60306	60313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011777	ATTC	2	8	61140	61147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011777	ACCA	3	12	61739	61750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011777	TTGA	2	8	61944	61951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011777	TAAT	2	8	63981	63988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011777	AGAA	2	8	64095	64102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011777	AATA	2	8	64105	64112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011777	TAAT	2	8	64129	64136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011777	AAAT	2	8	67735	67742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011777	TAAA	2	8	67748	67755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011777	ATTA	2	8	72613	72620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011777	GGGT	2	8	72633	72640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011777	AAAT	2	8	78128	78135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011777	CTCC	2	8	78677	78684	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_011777	GATA	2	8	78757	78764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011777	AAAC	2	8	80150	80157	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011777	TCAT	2	8	82356	82363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011777	TATT	2	8	82378	82385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011777	ATGA	2	8	84069	84076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011777	TTTC	2	8	84281	84288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011777	TAAC	2	8	84725	84732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011777	ATAA	2	8	85231	85238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011777	ATTT	2	8	86638	86645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011777	GAAA	2	8	87004	87011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011777	TTGT	2	8	87910	87917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011777	CAAA	2	8	88319	88326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011777	ACGA	2	8	88718	88725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011777	GGGT	2	8	88989	88996	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011777	TGGT	2	8	91175	91182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011777	TTAG	2	8	91573	91580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011777	AATT	2	8	93171	93178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011777	TTTC	2	8	97091	97098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011777	ACAT	2	8	97149	97156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011777	GAAG	2	8	97474	97481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011777	ACAG	2	8	97577	97584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011777	GGAG	2	8	97825	97832	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011777	TATT	2	8	97957	97964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011777	ATTT	2	8	98197	98204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011777	ACAG	2	8	98787	98794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011777	AAAG	2	8	101966	101973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011777	CTTT	2	8	102013	102020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011777	AAAG	2	8	102061	102068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011777	AAGT	2	8	103331	103338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011777	GAAG	2	8	103349	103356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011777	AAGG	2	8	107676	107683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011777	CTTT	2	8	107747	107754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011777	ATTT	2	8	115327	115334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011777	CAGC	2	8	120189	120196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011777	ATTT	2	8	123246	123253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011777	TGTA	2	8	123506	123513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011777	ATTT	2	8	125566	125573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011777	AAAC	2	8	125609	125616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011777	TCCA	2	8	127794	127801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011777	ATTA	2	8	127853	127860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011777	TATG	2	8	127914	127921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011777	AGAT	2	8	128046	128053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011777	AGGA	2	8	128116	128123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011777	TATT	2	8	128233	128240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011777	AAAT	2	8	130275	130282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011777	CTAA	2	8	131257	131264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011777	AGGA	2	8	131649	131656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011777	GAAA	2	8	131687	131694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011777	AAAC	2	8	133129	133136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011777	ATTT	2	8	133347	133354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011777	TAAA	2	8	134052	134059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011777	CAGT	2	8	134128	134135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011777	TAAG	2	8	134214	134221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011777	TTAA	2	8	134434	134441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011777	CAAA	2	8	134958	134965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011777	ACGG	2	8	135890	135897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011777	AATC	2	8	137112	137119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011777	TTCT	2	8	137227	137234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011777	AGAA	2	8	137248	137255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011777	CTAA	2	8	137706	137713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011777	TTTA	2	8	141684	141691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011777	AAAT	2	8	141825	141832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011777	TAAT	2	8	144538	144545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011777	TCAA	2	8	144688	144695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011777	TTTG	2	8	144798	144805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011777	CGTT	2	8	144838	144845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011777	CAAG	2	8	144899	144906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011777	TTTA	2	8	145301	145308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011777	TTTC	2	8	146056	146063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011777	TCTA	2	8	149234	149241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011777	TACA	2	8	149494	149501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011777	TTAA	2	8	149523	149530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011777	TATT	2	8	150475	150482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011777	GAAA	2	8	152560	152567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011777	ATTA	2	8	153555	153562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011777	TAAA	2	8	154750	154757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011777	TTTC	2	8	164177	164184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011777	TGTA	2	8	165369	165376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011777	CCTT	2	8	170008	170015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011777	TGAA	2	8	170817	170824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011777	GTTT	2	8	172055	172062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011777	TGAT	2	8	174107	174114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011777	CATA	2	8	174208	174215	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011777	CCTT	2	8	174717	174724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011777	AATG	2	8	174932	174939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011777	TAAT	3	12	181445	181456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011777	AAAT	2	8	181487	181494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011777	ATTA	2	8	181511	181518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011777	CCAA	2	8	186341	186348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011777	GGAG	2	8	193101	193108	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011777	ATAA	2	8	193531	193538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011777	AATG	2	8	193646	193653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011777	GGAA	2	8	193758	193765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011777	CTTT	2	8	198534	198541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011777	TCAA	2	8	200165	200172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011777	ATAA	2	8	200389	200396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011777	ATAA	2	8	200475	200482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011777	TAAA	2	8	201338	201345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011777	GATT	2	8	201418	201425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.