MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_209

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011775	TATTAA	2	12	4962	4973	50 %	50 %	0 %	0 %	218848175
2	NC_011775	TTTTAA	2	12	5339	5350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011775	TTATTT	2	12	6581	6592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218847948
4	NC_011775	TTTATA	2	12	6998	7009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011775	ATAAAT	2	12	8809	8820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011775	AGGTAG	2	12	10184	10195	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218848040
7	NC_011775	TCCCAT	2	12	11109	11120	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218847966
8	NC_011775	AATTGG	2	12	12439	12450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848005
9	NC_011775	TGAAGA	2	12	13720	13731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218848074
10	NC_011775	AAAGGA	2	12	14758	14769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218847956
11	NC_011775	AGAACA	2	12	15217	15228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218847956
12	NC_011775	GTTTTC	2	12	16565	16576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011775	ATAAAA	2	12	17806	17817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011775	TTATAT	2	12	23138	23149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218848123
15	NC_011775	AAAACA	2	12	23665	23676	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218847997
16	NC_011775	TTTCTG	2	12	26417	26428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848010
17	NC_011775	GCTTCT	2	12	28373	28384	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218847942
18	NC_011775	AAAATC	2	12	30500	30511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218848109
19	NC_011775	CAGAAA	2	12	31387	31398	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218848109
20	NC_011775	TAATGT	2	12	35983	35994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848163
21	NC_011775	GAATAT	2	12	38060	38071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848015
22	NC_011775	TCTAAT	2	12	39432	39443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848176
23	NC_011775	CATAAC	2	12	44183	44194	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218847994
24	NC_011775	ATTTAC	2	12	50318	50329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848140
25	NC_011775	AGAGAA	2	12	50547	50558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218848140
26	NC_011775	ATGAAA	2	12	55251	55262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848136
27	NC_011775	AGAGCA	2	12	59184	59195	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218848007
28	NC_011775	GTATGA	2	12	60016	60027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847931
29	NC_011775	ATTAAT	2	12	61168	61179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011775	ATTTGA	2	12	61989	62000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848158
31	NC_011775	TTTAAT	2	12	62260	62271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011775	AATTTT	2	12	62911	62922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218848048
33	NC_011775	GATTTA	2	12	64780	64791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218847972
34	NC_011775	ATTGAA	2	12	65695	65706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218847999
35	NC_011775	AAATTA	2	12	66265	66276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847999
36	NC_011775	GGTGAT	2	12	70590	70601	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218848086
37	NC_011775	GGTAAA	2	12	73975	73986	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218847969
38	NC_011775	TAGATA	2	12	77610	77621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218847937
39	NC_011775	TTATAA	2	12	77917	77928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011775	GAAAAT	2	12	78111	78122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848057
41	NC_011775	CCAGCT	2	12	79064	79075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218848013
42	NC_011775	TTATTC	2	12	82323	82334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011775	ATTATA	2	12	82465	82476	50 %	50 %	0 %	0 %	218847939
44	NC_011775	TTTATA	2	12	82935	82946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011775	TTAGCT	2	12	83061	83072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218847933
46	NC_011775	CAGTAA	2	12	83125	83136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218847933
47	NC_011775	GGTTAT	2	12	85122	85133	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218848164
48	NC_011775	TAAAGT	2	12	88065	88076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848035
49	NC_011775	ATTTAA	2	12	92094	92105	50 %	50 %	0 %	0 %	218847988
50	NC_011775	ATTTTA	2	12	92447	92458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011775	TTCAAT	2	12	94483	94494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848146
52	NC_011775	AACTTT	2	12	94792	94803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848146
53	NC_011775	TAGAAG	2	12	102863	102874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218848056
54	NC_011775	AACTTC	2	12	104443	104454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011775	TAATTA	2	12	106690	106701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011775	ACCTTA	2	12	108626	108637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011775	TGATAT	2	12	108973	108984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848131
58	NC_011775	TGCAAC	2	12	117605	117616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218847986
59	NC_011775	AATTAA	2	12	119890	119901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011775	AATTGA	2	12	121508	121519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848075
61	NC_011775	AAAACT	2	12	122700	122711	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218848031
62	NC_011775	TATTTT	2	12	127106	127117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011775	TAAATT	2	12	127370	127381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011775	ATAAAA	2	12	131538	131549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218848091
65	NC_011775	TCATTA	2	12	131703	131714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848091
66	NC_011775	TAATGA	2	12	135342	135353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218848058
67	NC_011775	AAATTC	2	12	141838	141849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218848033
68	NC_011775	TGAAAA	2	12	141948	141959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848157
69	NC_011775	TTGAAT	2	12	142677	142688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218848023
70	NC_011775	ATCAAG	2	12	143087	143098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218848066
71	NC_011775	TAAATT	2	12	146956	146967	50 %	50 %	0 %	0 %	218847946
72	NC_011775	AGTTGA	2	12	149130	149141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848104
73	NC_011775	TCCATT	2	12	152007	152018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848114
74	NC_011775	TTTCAC	2	12	159519	159530	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848014
75	NC_011775	AATTTC	2	12	161622	161633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218847974
76	NC_011775	CCACCG	2	12	164589	164600	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	218847985
77	NC_011775	AACCTG	2	12	166432	166443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218848161
78	NC_011775	TTCAAT	2	12	167954	167965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218848161
79	NC_011775	TTCAGG	2	12	170838	170849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218848143
80	NC_011775	TTGTTC	2	12	172152	172163	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848143
81	NC_011775	TTTAAT	2	12	175112	175123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218848094
82	NC_011775	AATAGA	2	12	180203	180214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218848051
83	NC_011775	TTAAAA	2	12	182052	182063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848047
84	NC_011775	TGCTTT	2	12	186831	186842	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848022
85	NC_011775	TGCTTT	2	12	187079	187090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848152
86	NC_011775	TGCTTT	2	12	187389	187400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218848107
87	NC_011775	TACCTG	2	12	190182	190193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218848142
88	NC_011775	CATTAC	2	12	192469	192480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218848027
89	NC_011775	TAATCC	2	12	193386	193397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847936
90	NC_011775	TACTTC	2	12	193811	193822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218848093
91	NC_011775	TTCTTT	2	12	196255	196266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218848120
92	NC_011775	TTAAAT	2	12	199923	199934	50 %	50 %	0 %	0 %	218848004
93	NC_011775	TGATTT	2	12	204497	204508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218848156

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.