MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_209

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011775	AAGTT	2	10	625	634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011775	ATATA	2	10	2640	2649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011775	GTTTC	2	10	7178	7187	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011775	TAAAA	3	15	8625	8639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011775	TAATT	2	10	15876	15885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011775	TTAGT	2	10	17794	17803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011775	ATAAA	2	10	18505	18514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011775	CTAAA	2	10	44419	44428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011775	TATAT	2	10	46488	46497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011775	AATTT	2	10	47142	47151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011775	TAAAA	2	10	48413	48422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011775	AATTT	2	10	48614	48623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011775	AAAAG	2	10	52642	52651	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011775	TACTT	2	10	58158	58167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011775	TATAA	2	10	67202	67211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011775	TCATT	2	10	71613	71622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011775	AATAA	2	10	73042	73051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011775	ATGAA	2	10	75692	75701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011775	ATATG	2	10	79270	79279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011775	TATAT	2	10	79489	79498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011775	ATAGT	2	10	83530	83539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011775	CTAAT	2	10	83738	83747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011775	ATTAA	2	10	85004	85013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011775	CAAAT	2	10	85359	85368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011775	ATAAA	2	10	85400	85409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011775	AGAGG	2	10	91456	91465	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011775	AATTA	2	10	94203	94212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011775	TATAA	2	10	95053	95062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011775	CCTAC	2	10	95751	95760	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_011775	AATGA	2	10	95845	95854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011775	ATTTG	2	10	96707	96716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011775	TTTTC	2	10	99236	99245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011775	CATTT	2	10	101484	101493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011775	TAAAA	2	10	105028	105037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011775	CAAAA	2	10	108734	108743	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011775	TCAAA	2	10	111441	111450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011775	TATTT	2	10	111460	111469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011775	TCTTT	2	10	111733	111742	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011775	TAAAT	2	10	117353	117362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011775	AAAAT	2	10	119627	119636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011775	CTCTT	2	10	123252	123261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011775	TAATT	2	10	123422	123431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011775	GAAAG	2	10	128051	128060	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011775	AAAGA	2	10	129226	129235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011775	CTAAA	2	10	129379	129388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011775	ATTTA	2	10	133908	133917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011775	ATTAA	2	10	137724	137733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011775	TTAAT	2	10	137786	137795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011775	AACAT	2	10	139685	139694	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011775	AAAAT	2	10	145109	145118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011775	ATTTA	2	10	151373	151382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011775	ATTTT	2	10	153227	153236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011775	TAGAT	2	10	155414	155423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011775	CTAAT	2	10	175441	175450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011775	ACTTT	2	10	177042	177051	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011775	TAATT	2	10	179020	179029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011775	ACGTA	2	10	184235	184244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011775	AAATT	2	10	187490	187499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011775	TTTCA	2	10	207425	207434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011775	ATTTT	2	10	207460	207469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011775	CACTA	2	10	209385	209394	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.