MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011774	AGGCTT	2	12	417	428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011774	ATATTT	2	12	1959	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011774	TTGAAT	2	12	5740	5751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011774	AAATCA	2	12	6423	6434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218847838
5	NC_011774	GGAAGA	2	12	9646	9657	50 %	0 %	50 %	0 %	218847833
6	NC_011774	GTTTAT	2	12	12932	12943	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011774	ATCAGA	2	12	14811	14822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218847887
8	NC_011774	ACTTTT	2	12	15429	15440	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011774	TAGGTG	2	12	16954	16965	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218847846
10	NC_011774	CTTCCA	2	12	21920	21931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218847884
11	NC_011774	GAATGA	2	12	22355	22366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218847892
12	NC_011774	AGTATG	2	12	22507	22518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847890
13	NC_011774	TTACAT	2	12	22667	22678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218847890
14	NC_011774	AACTTT	2	12	24026	24037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218847855
15	NC_011774	GATTAT	2	12	25985	25996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218847907
16	NC_011774	TGGATT	2	12	33185	33196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218847843
17	NC_011774	GTATGA	2	12	33243	33254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847843
18	NC_011774	AAGTTA	2	12	34589	34600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218847912
19	NC_011774	ATTTAA	2	12	35615	35626	50 %	50 %	0 %	0 %	218847901
20	NC_011774	CAACAC	2	12	38609	38620	50 %	0 %	0 %	50 %	218847901
21	NC_011774	CAATTA	2	12	38650	38661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218847901
22	NC_011774	ATTATG	2	12	43690	43701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218847815
23	NC_011774	TGAAGC	2	12	45488	45499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218847815
24	NC_011774	GATCTA	2	12	46976	46987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218847837
25	NC_011774	AGTTTT	2	12	48178	48189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218847841
26	NC_011774	ATACAA	2	12	48801	48812	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218847858
27	NC_011774	GTTTGA	2	12	50805	50816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218847899
28	NC_011774	ATTTAT	2	12	51244	51255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847847
29	NC_011774	CGGTGG	2	12	52646	52657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218847821
30	NC_011774	TATGGA	2	12	52827	52838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847821
31	NC_011774	CGGAGG	2	12	52904	52915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218847821
32	NC_011774	CGGTGG	2	12	52916	52927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218847821
33	NC_011774	CGGTGG	2	12	54240	54251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218847865
34	NC_011774	TAAGAG	2	12	54629	54640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218847865
35	NC_011774	TAGGTG	2	12	56774	56785	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218847836
36	NC_011774	AAAGTA	2	12	57499	57510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847836
37	NC_011774	AAATTA	2	12	59161	59172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847875
38	NC_011774	ATACAA	2	12	59565	59576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218847921
39	NC_011774	GACTAT	2	12	60715	60726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218847872
40	NC_011774	AAGTGC	2	12	61843	61854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218847888
41	NC_011774	AGGATT	2	12	63146	63157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847888
42	NC_011774	TGGAAA	2	12	63874	63885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218847904
43	NC_011774	AGGTGG	2	12	64987	64998	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	218847840
44	NC_011774	TGCTGG	2	12	67547	67558	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218847916
45	NC_011774	ATGCAA	2	12	69244	69255	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218847908
46	NC_011774	TAGGTG	2	12	70286	70297	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218847922
47	NC_011774	AAGTGC	2	12	70557	70568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218847922
48	NC_011774	ATTAAA	2	12	71206	71217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847922
49	NC_011774	TAAAAG	2	12	73763	73774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847900
50	NC_011774	AAACCT	2	12	78993	79004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218847876
51	NC_011774	CTATGT	2	12	80863	80874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218847876
52	NC_011774	GATGTA	2	12	80898	80909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847876
53	NC_011774	GTAAAA	2	12	86030	86041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847851
54	NC_011774	ATTGAA	2	12	87608	87619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218847851
55	NC_011774	GATTGC	2	12	87696	87707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218847851
56	NC_011774	TAAAAT	2	12	91467	91478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847825
57	NC_011774	AGATAA	2	12	91794	91805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847825
58	NC_011774	AAGTAA	2	12	94185	94196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847812
59	NC_011774	TAATTT	2	12	94822	94833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847812
60	NC_011774	AAACCA	2	12	95094	95105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847812
61	NC_011774	AAAAGC	2	12	100963	100974	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218847835
62	NC_011774	AAGTGA	2	12	101034	101045	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218847835
63	NC_011774	GCTGAA	2	12	101869	101880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218847835
64	NC_011774	AATGAA	2	12	101963	101974	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847880
65	NC_011774	AATAAA	2	12	103663	103674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011774	GATATT	2	12	117241	117252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218847814
67	NC_011774	TGATTA	2	12	117732	117743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218847814
68	NC_011774	ATAAGA	2	12	117962	117973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218847814
69	NC_011774	AAGTAT	2	12	118847	118858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011774	CTAACA	2	12	119480	119491	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011774	AAATAA	2	12	121162	121173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218847877
72	NC_011774	TTGTAT	2	12	127652	127663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011774	CTAATG	2	12	130843	130854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218847866
74	NC_011774	TTTATC	2	12	131396	131407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218847866
75	NC_011774	GAATAT	2	12	131515	131526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218847866
76	NC_011774	GTTAAA	2	12	132189	132200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011774	TAGTTA	2	12	137018	137029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011774	CATTTT	2	12	137896	137907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218847850
79	NC_011774	TTTTCA	2	12	138838	138849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.