MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011774	GTGTA	2	10	3093	3102	20 %	40 %	40 %	0 %	218847810
2	NC_011774	TGATT	2	10	3301	3310	20 %	60 %	20 %	0 %	218847810
3	NC_011774	GGAAA	2	10	11496	11505	60 %	0 %	40 %	0 %	218847926
4	NC_011774	TTTTA	2	10	14481	14490	20 %	80 %	0 %	0 %	218847887
5	NC_011774	CATTT	2	10	15881	15890	20 %	60 %	0 %	20 %	218847846
6	NC_011774	ACTGT	2	10	16944	16953	20 %	40 %	20 %	20 %	218847846
7	NC_011774	AAGCA	2	10	17419	17428	60 %	0 %	20 %	20 %	218847846
8	NC_011774	AGAGA	2	10	18968	18977	60 %	0 %	40 %	0 %	218847870
9	NC_011774	GAAAA	2	10	19892	19901	80 %	0 %	20 %	0 %	218847817
10	NC_011774	TAGAT	2	10	20536	20545	40 %	40 %	20 %	0 %	218847817
11	NC_011774	ATTTA	2	10	20943	20952	40 %	60 %	0 %	0 %	218847817
12	NC_011774	AATAT	2	10	21030	21039	60 %	40 %	0 %	0 %	218847817
13	NC_011774	ATATT	2	10	22625	22634	40 %	60 %	0 %	0 %	218847890
14	NC_011774	GTTCA	2	10	23870	23879	20 %	40 %	20 %	20 %	218847855
15	NC_011774	AAATT	2	10	24484	24493	60 %	40 %	0 %	0 %	218847855
16	NC_011774	TAAAT	2	10	24714	24723	60 %	40 %	0 %	0 %	218847905
17	NC_011774	TATTT	2	10	30790	30799	20 %	80 %	0 %	0 %	218847856
18	NC_011774	AGAGT	2	10	31643	31652	40 %	20 %	40 %	0 %	218847868
19	NC_011774	GAATG	2	10	32660	32669	40 %	20 %	40 %	0 %	218847896
20	NC_011774	TTTAC	2	10	32736	32745	20 %	60 %	0 %	20 %	218847896
21	NC_011774	GAAGA	2	10	33155	33164	60 %	0 %	40 %	0 %	218847843
22	NC_011774	AGAGA	2	10	33358	33367	60 %	0 %	40 %	0 %	218847843
23	NC_011774	GAAGA	2	10	34652	34661	60 %	0 %	40 %	0 %	218847912
24	NC_011774	AAAAT	2	10	34856	34865	80 %	20 %	0 %	0 %	218847901
25	NC_011774	TAAAT	2	10	34881	34890	60 %	40 %	0 %	0 %	218847901
26	NC_011774	ATTTT	2	10	36227	36236	20 %	80 %	0 %	0 %	218847901
27	NC_011774	CATTT	2	10	36725	36734	20 %	60 %	0 %	20 %	218847901
28	NC_011774	AAAGA	2	10	38824	38833	80 %	0 %	20 %	0 %	218847901
29	NC_011774	GATGG	2	10	38868	38877	20 %	20 %	60 %	0 %	218847901
30	NC_011774	GTATT	2	10	39623	39632	20 %	60 %	20 %	0 %	218847901
31	NC_011774	ACATG	2	10	42584	42593	40 %	20 %	20 %	20 %	218847815
32	NC_011774	ATATG	2	10	42599	42608	40 %	40 %	20 %	0 %	218847815
33	NC_011774	TACGT	2	10	44321	44330	20 %	40 %	20 %	20 %	218847815
34	NC_011774	GCTAA	2	10	44586	44595	40 %	20 %	20 %	20 %	218847815
35	NC_011774	AGGTA	2	10	44726	44735	40 %	20 %	40 %	0 %	218847815
36	NC_011774	TGATG	2	10	45584	45593	20 %	40 %	40 %	0 %	218847815
37	NC_011774	TGCAA	2	10	46415	46424	40 %	20 %	20 %	20 %	218847815
38	NC_011774	TTGTT	2	10	46748	46757	0 %	80 %	20 %	0 %	218847867
39	NC_011774	AGACA	2	10	47428	47437	60 %	0 %	20 %	20 %	218847827
40	NC_011774	AGCAA	2	10	47929	47938	60 %	0 %	20 %	20 %	218847841
41	NC_011774	ATAAC	2	10	50507	50516	60 %	20 %	0 %	20 %	218847899
42	NC_011774	GATAT	2	10	54970	54979	40 %	40 %	20 %	0 %	218847832
43	NC_011774	AGGTA	2	10	55563	55572	40 %	20 %	40 %	0 %	218847832
44	NC_011774	AGAAA	2	10	56853	56862	80 %	0 %	20 %	0 %	218847836
45	NC_011774	TAAAG	2	10	56880	56889	60 %	20 %	20 %	0 %	218847836
46	NC_011774	TAAAT	2	10	58347	58356	60 %	40 %	0 %	0 %	218847875
47	NC_011774	TTGGA	2	10	58752	58761	20 %	40 %	40 %	0 %	218847875
48	NC_011774	AAAAG	2	10	59151	59160	80 %	0 %	20 %	0 %	218847875
49	NC_011774	AATGA	2	10	60271	60280	60 %	20 %	20 %	0 %	218847859
50	NC_011774	AAATT	2	10	60536	60545	60 %	40 %	0 %	0 %	218847859
51	NC_011774	TGGAT	2	10	64972	64981	20 %	40 %	40 %	0 %	218847840
52	NC_011774	AGCAA	2	10	65818	65827	60 %	0 %	20 %	20 %	218847840
53	NC_011774	GAGCA	2	10	67129	67138	40 %	0 %	40 %	20 %	218847916
54	NC_011774	GATAT	2	10	68082	68091	40 %	40 %	20 %	0 %	218847916
55	NC_011774	AGGTA	2	10	68675	68684	40 %	20 %	40 %	0 %	218847916
56	NC_011774	ATTTT	2	10	69047	69056	20 %	80 %	0 %	0 %	218847908
57	NC_011774	CATGG	2	10	69801	69810	20 %	20 %	40 %	20 %	218847908
58	NC_011774	AGAAA	2	10	70365	70374	80 %	0 %	20 %	0 %	218847922
59	NC_011774	TTAAT	2	10	70508	70517	40 %	60 %	0 %	0 %	218847922
60	NC_011774	TAAAT	2	10	72432	72441	60 %	40 %	0 %	0 %	218847900
61	NC_011774	ATAAA	2	10	73824	73833	80 %	20 %	0 %	0 %	218847900
62	NC_011774	TTGCA	2	10	74670	74679	20 %	40 %	20 %	20 %	218847874
63	NC_011774	TAAAA	2	10	75523	75532	80 %	20 %	0 %	0 %	218847898
64	NC_011774	AAAAT	2	10	75812	75821	80 %	20 %	0 %	0 %	218847919
65	NC_011774	AAAAG	2	10	75922	75931	80 %	0 %	20 %	0 %	218847919
66	NC_011774	AAAAC	2	10	76373	76382	80 %	0 %	0 %	20 %	218847919
67	NC_011774	GAATT	2	10	76580	76589	40 %	40 %	20 %	0 %	218847919
68	NC_011774	AAAGA	2	10	76596	76605	80 %	0 %	20 %	0 %	218847919
69	NC_011774	ACTAC	2	10	78553	78562	40 %	20 %	0 %	40 %	218847876
70	NC_011774	GATTT	2	10	79437	79446	20 %	60 %	20 %	0 %	218847876
71	NC_011774	GAAGA	2	10	80187	80196	60 %	0 %	40 %	0 %	218847876
72	NC_011774	TCATA	2	10	80661	80670	40 %	40 %	0 %	20 %	218847876
73	NC_011774	AATTA	2	10	82163	82172	60 %	40 %	0 %	0 %	218847876
74	NC_011774	AATGA	2	10	82449	82458	60 %	20 %	20 %	0 %	218847876
75	NC_011774	TGATT	2	10	83348	83357	20 %	60 %	20 %	0 %	218847876
76	NC_011774	AAAAG	2	10	84170	84179	80 %	0 %	20 %	0 %	218847876
77	NC_011774	ATATG	2	10	84206	84215	40 %	40 %	20 %	0 %	218847876
78	NC_011774	GAAAT	2	10	85968	85977	60 %	20 %	20 %	0 %	218847851
79	NC_011774	TAAAG	2	10	88243	88252	60 %	20 %	20 %	0 %	218847851
80	NC_011774	AAAGT	2	10	89141	89150	60 %	20 %	20 %	0 %	218847851
81	NC_011774	AATGC	2	10	89234	89243	40 %	20 %	20 %	20 %	218847851
82	NC_011774	ATTTT	2	10	90320	90329	20 %	80 %	0 %	0 %	218847903
83	NC_011774	ACATA	2	10	90442	90451	60 %	20 %	0 %	20 %	218847825
84	NC_011774	TAAAA	2	10	90543	90552	80 %	20 %	0 %	0 %	218847825
85	NC_011774	GGATT	2	10	92115	92124	20 %	40 %	40 %	0 %	218847825
86	NC_011774	AGCAA	2	10	92983	92992	60 %	0 %	20 %	20 %	218847812
87	NC_011774	GATTG	2	10	96239	96248	20 %	40 %	40 %	0 %	218847812
88	NC_011774	TGGGA	2	10	96459	96468	20 %	20 %	60 %	0 %	218847812
89	NC_011774	TACAA	2	10	98450	98459	60 %	20 %	0 %	20 %	218847812
90	NC_011774	GAAAA	2	10	98702	98711	80 %	0 %	20 %	0 %	218847895
91	NC_011774	AATTT	2	10	100355	100364	40 %	60 %	0 %	0 %	218847895
92	NC_011774	AATGA	2	10	100558	100567	60 %	20 %	20 %	0 %	218847895
93	NC_011774	GATAA	2	10	104178	104187	60 %	20 %	20 %	0 %	218847826
94	NC_011774	AAAAT	2	10	104585	104594	80 %	20 %	0 %	0 %	218847917
95	NC_011774	TGAAA	2	10	108027	108036	60 %	20 %	20 %	0 %	218847820
96	NC_011774	AGAAA	2	10	108972	108981	80 %	0 %	20 %	0 %	218847823
97	NC_011774	ATGTT	2	10	109090	109099	20 %	60 %	20 %	0 %	218847889
98	NC_011774	ATGAA	2	10	110580	110589	60 %	20 %	20 %	0 %	218847881
99	NC_011774	GTATT	2	10	112338	112347	20 %	60 %	20 %	0 %	218847923
100	NC_011774	TTGGA	2	10	116855	116864	20 %	40 %	40 %	0 %	218847814
101	NC_011774	ATATG	2	10	117117	117126	40 %	40 %	20 %	0 %	218847814
102	NC_011774	TGAAA	2	10	117345	117354	60 %	20 %	20 %	0 %	218847814
103	NC_011774	AAAAG	2	10	119950	119959	80 %	0 %	20 %	0 %	218847863
104	NC_011774	AAAAC	2	10	120121	120130	80 %	0 %	0 %	20 %	218847877
105	NC_011774	GGCAT	2	10	120324	120333	20 %	20 %	40 %	20 %	218847877
106	NC_011774	CTTTA	2	10	121945	121954	20 %	60 %	0 %	20 %	218847883
107	NC_011774	AGGAA	2	10	122052	122061	60 %	0 %	40 %	0 %	218847883
108	NC_011774	TTTTC	2	10	122097	122106	0 %	80 %	0 %	20 %	218847883
109	NC_011774	TATTT	2	10	128308	128317	20 %	80 %	0 %	0 %	218847848
110	NC_011774	GTTTG	2	10	135714	135723	0 %	60 %	40 %	0 %	218847914
111	NC_011774	ATATT	2	10	136626	136635	40 %	60 %	0 %	0 %	218847882
112	NC_011774	TTTTA	2	10	137732	137741	20 %	80 %	0 %	0 %	218847850
113	NC_011774	TATTC	2	10	139202	139211	20 %	60 %	0 %	20 %	218847857

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.