MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011771	TCG	2	6	33	38	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011771	TAC	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011771	GAA	2	6	308	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011771	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011771	CTT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
6	NC_011771	TTC	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
7	NC_011771	TGT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
8	NC_011771	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847804
9	NC_011771	ATA	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
10	NC_011771	TCT	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
11	NC_011771	GTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
12	NC_011771	CTT	3	9	803	811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
13	NC_011771	TAC	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847804
14	NC_011771	AAT	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
15	NC_011771	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847804
16	NC_011771	TTG	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011771	AGC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011771	TCA	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011771	CTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011771	AAC	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847798
21	NC_011771	TTC	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
22	NC_011771	CTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
23	NC_011771	ATC	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847798
24	NC_011771	TGA	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847798
25	NC_011771	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011771	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
27	NC_011771	AAT	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
28	NC_011771	AAT	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
29	NC_011771	TAG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
30	NC_011771	AAT	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
31	NC_011771	TAT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011771	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011771	AAT	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011771	TAA	2	6	2312	2317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011771	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011771	TAT	2	6	2383	2388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011771	GAC	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847802
38	NC_011771	GCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218847802
39	NC_011771	TTC	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
40	NC_011771	TTA	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
41	NC_011771	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847802
42	NC_011771	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847802
43	NC_011771	TAT	2	6	2628	2633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
44	NC_011771	CTA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847802
45	NC_011771	TTC	2	6	2731	2736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
46	NC_011771	ATT	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
47	NC_011771	TCC	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847802
48	NC_011771	TCC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011771	CTT	2	6	2975	2980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011771	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011771	AGA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011771	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011771	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847799
54	NC_011771	TCT	2	6	3139	3144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847799
55	NC_011771	GGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218847799
56	NC_011771	ATT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
57	NC_011771	ATC	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847799
58	NC_011771	TAT	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
59	NC_011771	AAC	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847799
60	NC_011771	ATA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011771	CAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011771	TCA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011771	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011771	TTA	2	6	4062	4067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011771	TGC	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011771	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011771	AAT	2	6	4197	4202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011771	TAT	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011771	TGT	2	6	4429	4434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847800
70	NC_011771	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847800
71	NC_011771	ATA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
72	NC_011771	ATG	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847800
73	NC_011771	AAT	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
74	NC_011771	CTC	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847800
75	NC_011771	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847800
76	NC_011771	TCA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847803
77	NC_011771	CAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011771	GTT	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011771	AGG	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011771	AAT	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
81	NC_011771	ACA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847805
82	NC_011771	ATA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
83	NC_011771	TGA	2	6	5675	5680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847797
84	NC_011771	TTC	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847797
85	NC_011771	ATA	2	6	5831	5836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847797
86	NC_011771	AAT	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847797
87	NC_011771	TTA	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011771	AAT	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011771	GTT	2	6	6043	6048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011771	TCG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011771	ATA	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011771	GTT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011771	TAC	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011771	TGT	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011771	ATA	2	6	6712	6717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011771	CTT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
97	NC_011771	TAG	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847806
98	NC_011771	AAC	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847806
99	NC_011771	CTT	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
100	NC_011771	TTC	2	6	7247	7252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
101	NC_011771	CCA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218847806
102	NC_011771	TCT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
103	NC_011771	AAT	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847806
104	NC_011771	TCC	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011771	CAA	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011771	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011771	CTT	2	6	8021	8026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
108	NC_011771	CTA	3	9	8108	8116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
109	NC_011771	CTT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
110	NC_011771	CAA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847801
111	NC_011771	TTC	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
112	NC_011771	TTG	3	9	8595	8603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847801
113	NC_011771	ACT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
114	NC_011771	TCA	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
115	NC_011771	CTT	2	6	8771	8776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
116	NC_011771	GTC	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218847801
117	NC_011771	ATC	2	6	8853	8858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
118	NC_011771	CTT	2	6	8933	8938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
119	NC_011771	TAT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847801
120	NC_011771	CCA	2	6	9105	9110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011771	CGA	2	6	9149	9154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011771	CTG	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011771	TCT	2	6	9516	9521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011771	AAT	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011771	ATT	2	6	9541	9546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011771	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011771	TTA	2	6	9558	9563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011771	CAA	2	6	9753	9758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011771	ATA	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011771	CAG	2	6	9957	9962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011771	ATA	2	6	10037	10042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011771	TAA	2	6	10130	10135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011771	AGG	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011771	AAC	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011771	AAT	2	6	10243	10248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011771	TCC	2	6	10287	10292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.