MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa LESB58 chromosome

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011770	GGCAAG	2	12	55990	56001	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011770	CGAGGA	2	12	56065	56076	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011770	CAGGGA	2	12	65304	65315	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011770	CTGGCC	2	12	73037	73048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011770	GAAAAA	2	12	146371	146382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011770	CCCTTT	2	12	147961	147972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011770	ACGGCG	2	12	181513	181524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011770	GTTCGC	2	12	192604	192615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011770	CGATAA	2	12	224069	224080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011770	ATCGTC	2	12	224259	224270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011770	TTTTCG	2	12	225910	225921	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011770	GGAAAA	2	12	252499	252510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011770	TCGGCA	2	12	256287	256298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011770	TCTGCC	2	12	290821	290832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011770	ACGGAA	2	12	295515	295526	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011770	TGCGCC	2	12	302085	302096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011770	TGCGCT	2	12	341147	341158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011770	GTCGGC	2	12	430120	430131	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011770	CGCGAA	2	12	437102	437113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011770	CGCCGG	2	12	463649	463660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011770	AGGCCT	2	12	477952	477963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011770	GCGCGT	2	12	556602	556613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011770	GGTTGT	2	12	592585	592596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011770	AGGGAG	2	12	611220	611231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011770	TTTTTA	2	12	619099	619110	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011770	TTCGCC	2	12	619396	619407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011770	GGCCGG	2	12	629979	629990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011770	CGAGGA	2	12	632128	632139	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011770	GTGCGG	2	12	639826	639837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011770	TGGCGC	2	12	680545	680556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011770	TGAAAT	2	12	703356	703367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011770	TTTTGC	2	12	704546	704557	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011770	TTGAAG	2	12	732169	732180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011770	ATGTAA	2	12	829344	829355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011770	GAGCGT	2	12	875072	875083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011770	GTTCAA	2	12	882503	882514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011770	TTTCTG	2	12	890351	890362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011770	TTGCGA	2	12	905708	905719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011770	AGCGGG	2	12	918267	918278	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011770	TGTCGC	2	12	950235	950246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011770	GCTGGC	2	12	1023611	1023622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011770	TTGTCG	2	12	1032201	1032212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011770	CGACTG	2	12	1043296	1043307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011770	GCGGCA	2	12	1088061	1088072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011770	GGCCGG	2	12	1090343	1090354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011770	GCCGAG	2	12	1103065	1103076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011770	CGAAAA	2	12	1117634	1117645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011770	GTCAAG	2	12	1147155	1147166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011770	TCCCTC	2	12	1201913	1201924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011770	CGGCTT	2	12	1208568	1208579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011770	CCGGTG	2	12	1213095	1213106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011770	GTGGGC	2	12	1247937	1247948	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011770	GGGTGA	2	12	1264220	1264231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011770	GCCGTC	2	12	1377484	1377495	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011770	TGCCGG	2	12	1385070	1385081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011770	CAGGCC	2	12	1390006	1390017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011770	GGCGCC	2	12	1392598	1392609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011770	CCGTGA	5	30	1405924	1405953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011770	CTGGAG	2	12	1441663	1441674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011770	GGCGCT	2	12	1442706	1442717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011770	GAGGCC	2	12	1456569	1456580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011770	TTTCTG	2	12	1460481	1460492	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011770	AAACGG	2	12	1505255	1505266	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011770	TTCGAA	2	12	1563900	1563911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011770	TTTCCT	2	12	1571687	1571698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011770	CCCGCG	2	12	1587463	1587474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011770	CGTCCC	2	12	1637831	1637842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011770	AGAACA	2	12	1646160	1646171	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011770	GGGCCG	2	12	1658207	1658218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011770	TAGCGC	2	12	1674817	1674828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011770	CACCGA	2	12	1693437	1693448	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011770	GAGCTG	2	12	1701153	1701164	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011770	CGCGCT	2	12	1716834	1716845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011770	CCATAT	2	12	1789527	1789538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011770	GGCCGA	2	12	1792447	1792458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011770	GCATAG	2	12	1855726	1855737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011770	AGGGGC	2	12	1925262	1925273	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011770	GGCGCT	2	12	1995601	1995612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011770	AGGTCA	2	12	2007491	2007502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011770	CGGAAT	2	12	2145500	2145511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011770	CAGTTC	2	12	2178421	2178432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011770	CAGGCG	2	12	2178946	2178957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011770	GCTCCC	2	12	2285770	2285781	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011770	GGCCGG	2	12	2290729	2290740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011770	GCGGTA	2	12	2295793	2295804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011770	GGCCTG	2	12	2310312	2310323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011770	AGCCGC	2	12	2311213	2311224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011770	GACGAT	2	12	2313139	2313150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011770	TTTTCT	2	12	2341917	2341928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011770	TTGTCG	2	12	2348784	2348795	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011770	CGGGGG	2	12	2379796	2379807	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011770	GGGCCG	2	12	2379901	2379912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011770	CTCTTC	2	12	2433513	2433524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011770	GGGAGG	2	12	2450345	2450356	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011770	TTGGCG	2	12	2472171	2472182	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011770	GGCTCA	2	12	2510883	2510894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011770	GTACCA	2	12	2511517	2511528	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011770	GAGCAG	2	12	2511644	2511655	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011770	TGGCGG	2	12	2536542	2536553	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011770	CCCCCA	2	12	2549402	2549413	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_011770	GTCGCG	2	12	2549499	2549510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011770	TTCGGC	2	12	2549982	2549993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011770	GGGAGG	2	12	2570740	2570751	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011770	CCGCCC	2	12	2573977	2573988	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_011770	GCGTAA	2	12	2593385	2593396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011770	CTCTAC	2	12	2605222	2605233	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011770	GCGGAT	2	12	2619602	2619613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011770	AGCGGG	2	12	2660825	2660836	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011770	AATCGA	2	12	2671122	2671133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011770	AACGGG	2	12	2690182	2690193	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011770	CTGGAG	2	12	2697182	2697193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011770	GGCGCT	2	12	2698225	2698236	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011770	GATCGT	2	12	2704736	2704747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011770	TTTCCA	2	12	2715001	2715012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011770	AGCGTG	2	12	2744249	2744260	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011770	GTTATA	2	12	2755545	2755556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011770	GAAACC	2	12	2755706	2755717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011770	CGGGCG	2	12	2761640	2761651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011770	GCGACG	2	12	2762190	2762201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011770	CGGATG	2	12	2764783	2764794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011770	CCTTCG	2	12	2764900	2764911	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011770	CCTGCA	2	12	2764949	2764960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011770	GCGCTT	2	12	2793238	2793249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011770	GGCGTT	2	12	2799754	2799765	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_011770	AGGGCG	2	12	2809300	2809311	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011770	GCTGCC	2	12	2815430	2815441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011770	GGCTTT	2	12	2830732	2830743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011770	AAGGCC	2	12	2833271	2833282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011770	TCTTCG	2	12	2833905	2833916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011770	ATGGGC	2	12	2836872	2836883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011770	CGTCGG	2	12	2852418	2852429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011770	GGCCGC	2	12	2854133	2854144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011770	AGGTCG	2	12	2854369	2854380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011770	CGGCCA	2	12	2854895	2854906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011770	CGCAGG	2	12	2859619	2859630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011770	GGATGA	2	12	2873494	2873505	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_011770	GCAGGT	2	12	2893930	2893941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_011770	GCACCG	2	12	2895853	2895864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_011770	CGGCGC	2	12	3015598	3015609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011770	CGCAGG	2	12	3015672	3015683	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_011770	GGTCAG	2	12	3018341	3018352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_011770	GCCTGG	2	12	3028809	3028820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011770	AATGAT	2	12	3112079	3112090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011770	AGGCCG	2	12	3240551	3240562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_011770	GCCTGC	2	12	3603559	3603570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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244	NC_011770	CGGCGC	2	12	5303354	5303365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
245	NC_011770	CGTCGA	2	12	5322825	5322836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_011770	AGAAAA	2	12	5370749	5370760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_011770	TCTGGC	2	12	5428319	5428330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_011770	CGTTTT	2	12	5453009	5453020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_011770	ACGCCT	2	12	5453647	5453658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
250	NC_011770	CAACTT	2	12	5507121	5507132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_011770	CCAGGC	2	12	5541383	5541394	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
252	NC_011770	AACGGC	2	12	5583972	5583983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_011770	ATCGCC	2	12	5592969	5592980	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
254	NC_011770	CCCTGG	2	12	5593162	5593173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
255	NC_011770	ATTTCA	2	12	5599068	5599079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_011770	GGCAGT	2	12	5645157	5645168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_011770	GTCGGC	2	12	5700885	5700896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_011770	CGAACC	2	12	5706244	5706255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
259	NC_011770	CTGGCG	2	12	5724245	5724256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_011770	CAGGCG	2	12	5745023	5745034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_011770	GTCCTG	2	12	5790207	5790218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_011770	CCTGGC	2	12	5790659	5790670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
263	NC_011770	ATGAAC	2	12	5845799	5845810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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265	NC_011770	CTTGTT	2	12	5933322	5933333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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267	NC_011770	CCCGGC	2	12	5980013	5980024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_011770	GTTGCC	2	12	5982135	5982146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_011770	CCGTCA	2	12	5982369	5982380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
270	NC_011770	GGTGCA	2	12	6032779	6032790	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
271	NC_011770	TGTATA	2	12	6084083	6084094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011770	CCGCGC	2	12	6138327	6138338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_011770	TACGGT	2	12	6166692	6166703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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275	NC_011770	CCCTCG	2	12	6327424	6327435	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_011770	CGCCGG	2	12	6327835	6327846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NC_011770	CGGTGG	2	12	6328195	6328206	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
278	NC_011770	ATTTCA	2	12	6376674	6376685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_011770	GCCCGC	2	12	6422841	6422852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_011770	CAGCGC	2	12	6425525	6425536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
281	NC_011770	GGCCTC	2	12	6425798	6425809	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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288	NC_011770	GGAAGC	2	12	6578198	6578209	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.