MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 chromosome

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011768	GGCAAG	2	12	40353	40364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011768	GCAAAA	2	12	42061	42072	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011768	TAAAGA	2	12	95698	95709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011768	AATCAA	2	12	99644	99655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011768	TTCCTT	2	12	113338	113349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011768	GCCTTT	2	12	131993	132004	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011768	GGGTGA	2	12	133334	133345	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011768	ATTCAA	2	12	136102	136113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011768	AATTCT	2	12	152295	152306	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011768	TTAATT	2	12	186453	186464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011768	TTGGTT	2	12	190939	190950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011768	TTTGGC	2	12	193965	193976	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011768	CATTGC	2	12	266431	266442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011768	TACGCT	2	12	293026	293037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011768	GGAAAG	2	12	322254	322265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011768	TTGCAT	2	12	325218	325229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011768	CACCCC	2	12	325497	325508	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_011768	AATTGC	2	12	348343	348354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011768	TTTATT	2	12	349385	349396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011768	GACCAA	2	12	363628	363639	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011768	CACCCC	2	12	379775	379786	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_011768	CCTGTC	2	12	384960	384971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011768	GTGCCA	2	12	417877	417888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011768	CCAATA	2	12	418166	418177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011768	GTAATT	2	12	427591	427602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011768	TTATGG	2	12	447446	447457	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011768	CGAGGC	2	12	534232	534243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011768	CACCCC	2	12	579811	579822	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_011768	TGTTTT	2	12	599986	599997	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011768	GCCATG	2	12	689169	689180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011768	TGAATT	2	12	738920	738931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011768	CGGATT	2	12	766901	766912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011768	CGATGC	2	12	773557	773568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011768	TTTGGG	2	12	865755	865766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011768	AAAAAG	2	12	885366	885377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011768	GAAGGA	2	12	904368	904379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011768	ACCTTA	2	12	968933	968944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011768	CACCCC	2	12	975082	975093	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
39	NC_011768	AGGGAG	2	12	975109	975120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011768	TTCATA	2	12	979118	979129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011768	GAGGAT	2	12	1107236	1107247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011768	CATAAA	2	12	1126255	1126266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011768	CCTCGC	2	12	1146004	1146015	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011768	CAAAAC	2	12	1147414	1147425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011768	CAAGAA	2	12	1147489	1147500	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011768	CAAAAC	2	12	1147794	1147805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011768	TGGCTT	2	12	1227009	1227020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011768	GTCTTT	2	12	1472608	1472619	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011768	CTTATA	2	12	1481109	1481120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011768	CCAAGC	2	12	1484297	1484308	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011768	GTCTTT	2	12	1597748	1597759	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011768	GCCCCC	2	12	1621868	1621879	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
53	NC_011768	ATGAAA	2	12	1672267	1672278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011768	TAGCGT	2	12	1713587	1713598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011768	TGGCTT	2	12	1740713	1740724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011768	TTTTTA	2	12	1746961	1746972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011768	CACCCC	2	12	1802050	1802061	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
58	NC_011768	AGGGGG	2	12	1802077	1802088	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011768	AGAAAA	2	12	1806915	1806926	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011768	ATCAAA	2	12	1812868	1812879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011768	AGGGCC	2	12	1813488	1813499	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011768	CACCCC	2	12	1823114	1823125	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
63	NC_011768	TGCGCG	2	12	1836554	1836565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011768	TCCCCT	2	12	1836825	1836836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011768	CACCCC	2	12	1857708	1857719	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_011768	GTTTGA	2	12	1900889	1900900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011768	CCCAAC	2	12	1919549	1919560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011768	AAGGCA	2	12	1920976	1920987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011768	CGCAGT	2	12	1955894	1955905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011768	TGACTC	2	12	1995699	1995710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011768	CACCCC	2	12	2070730	2070741	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
72	NC_011768	CCCCCT	2	12	2097617	2097628	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_011768	CCTTCC	2	12	2116259	2116270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011768	CCTCCC	2	12	2147885	2147896	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_011768	GGTTTT	2	12	2157993	2158004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011768	GGCATG	2	12	2205076	2205087	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011768	CCTTAT	2	12	2231453	2231464	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011768	CACCCC	2	12	2243355	2243366	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_011768	AGGGGG	2	12	2243382	2243393	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011768	CCAAAC	2	12	2250115	2250126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011768	ATTTTT	2	12	2298335	2298346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011768	GGCCGC	2	12	2426275	2426286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011768	AAAGTC	2	12	2461859	2461870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011768	TAAAAA	2	12	2494866	2494877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011768	CGGACT	2	12	2538170	2538181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011768	TCGGCA	2	12	2544255	2544266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011768	TCCGGC	2	12	2552445	2552456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011768	CACCCC	2	12	2557285	2557296	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_011768	TTTGAT	2	12	2593884	2593895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011768	CCGGCC	2	12	2607222	2607233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011768	GCCTAA	2	12	2607802	2607813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011768	CTGTTT	2	12	2609913	2609924	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011768	GAAATT	2	12	2692350	2692361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011768	AGTCCC	2	12	2720784	2720795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011768	AGGGCC	2	12	2832252	2832263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011768	ATTTTT	2	12	2848057	2848068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011768	AAATTA	2	12	2912851	2912862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011768	TTTGAT	2	12	2939524	2939535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011768	AGGGTA	2	12	3036354	3036365	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011768	CAACCC	2	12	3096430	3096441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011768	TTTTTA	2	12	3116592	3116603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011768	TGAGGG	2	12	3126084	3126095	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011768	ATCTTC	2	12	3159138	3159149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011768	TGAGGG	2	12	3194656	3194667	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011768	GGGATT	2	12	3211999	3212010	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011768	ACAATC	2	12	3241827	3241838	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011768	GATCAA	2	12	3263210	3263221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011768	GATAGG	2	12	3265056	3265067	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011768	GCCGGC	2	12	3364676	3364687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011768	AAACAG	2	12	3404576	3404587	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011768	GAAGGG	2	12	3405232	3405243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011768	AATTTT	2	12	3405785	3405796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011768	CAAAAT	2	12	3405917	3405928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011768	TCCCCA	2	12	3407406	3407417	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011768	CACCCC	2	12	3463483	3463494	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
116	NC_011768	TGAATT	2	12	3468750	3468761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011768	TGGAAT	2	12	3493335	3493346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011768	ATTAAG	2	12	3500894	3500905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011768	CACCCC	2	12	3512174	3512185	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_011768	CTGTTT	2	12	3535724	3535735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011768	GTTTTT	2	12	3554676	3554687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011768	CAAAAA	2	12	3581039	3581050	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011768	GCAATG	2	12	3598425	3598436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011768	TGGAAT	2	12	3602094	3602105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011768	GATTAG	2	12	3641332	3641343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011768	AGGAGC	2	12	3680248	3680259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.