MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 chromosome

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011768	GAATGC	2	12	1279	1290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218777862
2	NC_011768	CGGTCC	2	12	1560	1571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218777862
3	NC_011768	CGCGTC	2	12	5544	5555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218777864
4	NC_011768	TTCCAA	2	12	5685	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218777864
5	NC_011768	AAAAAC	2	12	7382	7393	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218777865
6	NC_011768	CAAAGG	2	12	17100	17111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218777871
7	NC_011768	GCCACC	2	12	23031	23042	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	218777875
8	NC_011768	TCGCCA	2	12	24394	24405	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218777876
9	NC_011768	GAGGCG	2	12	27832	27843	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218777877
10	NC_011768	CTCTTT	2	12	31884	31895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218777880
11	NC_011768	TGCCCT	2	12	32533	32544	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218777881
12	NC_011768	GGAAAA	2	12	37059	37070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218777886
13	NC_011768	AGTTCC	2	12	38087	38098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218777886
14	NC_011768	CGAACC	2	12	38595	38606	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218777886
15	NC_011768	CAAGCG	2	12	38879	38890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218777887
16	NC_011768	CCTGGA	2	12	39152	39163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777887
17	NC_011768	GGGCCT	2	12	45171	45182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777890
18	NC_011768	ACCTAT	2	12	45701	45712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218777891
19	NC_011768	ACCGGA	2	12	49727	49738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218777894
20	NC_011768	GGAAAG	2	12	50069	50080	50 %	0 %	50 %	0 %	218777894
21	NC_011768	GCTTCC	2	12	51191	51202	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218777895
22	NC_011768	ACCAGC	2	12	51371	51382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218777895
23	NC_011768	GCTCCT	2	12	51462	51473	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218777895
24	NC_011768	CGGACC	2	12	51596	51607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777895
25	NC_011768	GCCCAG	2	12	56910	56921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777900
26	NC_011768	CCATGA	2	12	58827	58838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218777903
27	NC_011768	GGCTTC	2	12	61044	61055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218777904
28	NC_011768	ACGGCC	2	12	66972	66983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777910
29	NC_011768	ATGGCG	2	12	67521	67532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218777910
30	NC_011768	TGGCCT	2	12	68536	68547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218777910
31	NC_011768	TGGCGC	2	12	73245	73256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777912
32	NC_011768	CGCCAG	2	12	73705	73716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777912
33	NC_011768	TGCCCG	2	12	75065	75076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218777913
34	NC_011768	AGCAAA	2	12	77921	77932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218777915
35	NC_011768	TGGCCC	2	12	78119	78130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218777915
36	NC_011768	GGCCCG	2	12	79212	79223	0 %	0 %	50 %	50 %	218777915
37	NC_011768	GGCCGT	2	12	80181	80192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777916
38	NC_011768	TCAACG	2	12	80372	80383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218777916
39	NC_011768	GGCTGG	2	12	80787	80798	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218777917
40	NC_011768	CTGGGC	2	12	82049	82060	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777918
41	NC_011768	CCGCAG	2	12	82515	82526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777918
42	NC_011768	GGCCGC	2	12	84721	84732	0 %	0 %	50 %	50 %	218777920
43	NC_011768	ATCCCA	2	12	86503	86514	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218777922
44	NC_011768	TCCACG	2	12	92750	92761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218777925
45	NC_011768	CCAGGC	2	12	94551	94562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777926
46	NC_011768	ACACCG	2	12	94944	94955	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218777926
47	NC_011768	TCCATG	2	12	95249	95260	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218777926
48	NC_011768	CCAGGC	2	12	95499	95510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777926
49	NC_011768	TCCAGG	2	12	96866	96877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777928
50	NC_011768	ACAATG	2	12	98956	98967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218777930
51	NC_011768	TGCTCC	2	12	100489	100500	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218777931
52	NC_011768	GGCGTG	2	12	100559	100570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218777931
53	NC_011768	CGGAAA	2	12	101208	101219	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218777931
54	NC_011768	TCAGGT	2	12	103738	103749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218777932
55	NC_011768	CCTGAC	2	12	104894	104905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218777932
56	NC_011768	AGGGCC	2	12	107598	107609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218777932
57	NC_011768	GCCGTC	2	12	107844	107855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218777933
58	NC_011768	CCCGTA	2	12	107971	107982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218777933
59	NC_011768	GTCCAG	2	12	108294	108305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777933
60	NC_011768	GGTCCA	2	12	108318	108329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777933
61	NC_011768	GGCCGT	2	12	109083	109094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777933
62	NC_011768	CCTTGG	2	12	109250	109261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218777933
63	NC_011768	CGGAGG	2	12	111040	111051	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218777935
64	NC_011768	CGCTCC	2	12	112702	112713	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	218777937
65	NC_011768	CGATGC	2	12	113670	113681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777939
66	NC_011768	CGTTGG	2	12	115243	115254	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218777940
67	NC_011768	ACGTGG	2	12	121815	121826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218777943
68	NC_011768	CGGCTT	2	12	122995	123006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218777944
69	NC_011768	GGCGAT	2	12	129854	129865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218777948
70	NC_011768	GGCCAG	2	12	133103	133114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218777949
71	NC_011768	ATGGAA	2	12	140049	140060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218777952
72	NC_011768	CGGAGG	2	12	143058	143069	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218777954
73	NC_011768	TTACGA	2	12	146397	146408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218777956
74	NC_011768	CGGAAA	2	12	147197	147208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218777957
75	NC_011768	TTCCCT	2	12	155480	155491	0 %	50 %	0 %	50 %	218777965
76	NC_011768	CGCCTC	2	12	156738	156749	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	218777966
77	NC_011768	GCCAAG	2	12	157246	157257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218777966
78	NC_011768	CGTGGA	2	12	160305	160316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218777967
79	NC_011768	GGAAAA	2	12	160398	160409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218777967
80	NC_011768	TCCATA	2	12	164249	164260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218777972
81	NC_011768	GCGGCC	2	12	167188	167199	0 %	0 %	50 %	50 %	218777975
82	NC_011768	CGTGGC	2	12	167214	167225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218777975
83	NC_011768	GGCCGG	2	12	169306	169317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218777977
84	NC_011768	TGAGCT	2	12	169411	169422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218777977
85	NC_011768	CTTTTT	2	12	170006	170017	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218777977
86	NC_011768	GCGCCG	2	12	172190	172201	0 %	0 %	50 %	50 %	218777980
87	NC_011768	CAATGA	2	12	174133	174144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218777983
88	NC_011768	GCCATG	2	12	175620	175631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218777985
89	NC_011768	GGCCCA	2	12	176362	176373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218777985
90	NC_011768	ATGGGA	2	12	182268	182279	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218777989
91	NC_011768	TCGGAG	2	12	188756	188767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218777994
92	NC_011768	GCTTTT	2	12	188901	188912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218777994
93	NC_011768	GATTTT	2	12	196219	196230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218778001
94	NC_011768	CTTGGC	2	12	197054	197065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218778002
95	NC_011768	ATGGCC	2	12	197767	197778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778003
96	NC_011768	CCCAGG	2	12	197800	197811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218778003
97	NC_011768	CAGGGC	2	12	198285	198296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778003
98	NC_011768	GGCCCT	2	12	199334	199345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218778004
99	NC_011768	CCCTTC	2	12	201078	201089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218778004
100	NC_011768	GTTTTT	2	12	203529	203540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218778005
101	NC_011768	TCGGCA	2	12	203933	203944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778005
102	NC_011768	ACAATA	2	12	204053	204064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218778005
103	NC_011768	GCTTCC	2	12	208009	208020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218778006
104	NC_011768	ATGGCC	2	12	208510	208521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778006
105	NC_011768	GGCGCG	2	12	214771	214782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218778012
106	NC_011768	CATGGA	2	12	216911	216922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218778014
107	NC_011768	CCTTGT	2	12	220225	220236	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218778016
108	NC_011768	TTCCGG	2	12	227887	227898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218778022
109	NC_011768	TTGGGC	2	12	231066	231077	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218778024
110	NC_011768	TCATCC	2	12	234082	234093	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218778026
111	NC_011768	CGGCGC	2	12	238077	238088	0 %	0 %	50 %	50 %	218778029
112	NC_011768	ATCCCA	2	12	242668	242679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218778035
113	NC_011768	TGGCCA	2	12	246938	246949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778038
114	NC_011768	CCTGAT	2	12	247995	248006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218778039
115	NC_011768	ATTTCC	2	12	252947	252958	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218778043
116	NC_011768	TAAAGC	2	12	255177	255188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218778045
117	NC_011768	TGAAAA	2	12	256321	256332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218778045
118	NC_011768	GGGCCA	2	12	258357	258368	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778047
119	NC_011768	CATGAC	2	12	258691	258702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218778047
120	NC_011768	GCCTGG	2	12	264534	264545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218778050
121	NC_011768	CCCTTG	2	12	264715	264726	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218778050
122	NC_011768	CCTGGC	2	12	265963	265974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218778051
123	NC_011768	CTGGAC	2	12	265991	266002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778051
124	NC_011768	TGTTTT	2	12	266122	266133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	218778051
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129	NC_011768	TCCTTG	2	12	272511	272522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218778057
130	NC_011768	ATGGCC	2	12	272793	272804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778057
131	NC_011768	CTTCCA	2	12	273178	273189	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218778057
132	NC_011768	TGCGGA	2	12	275850	275861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218778058
133	NC_011768	CCCTGG	2	12	282095	282106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218778063
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146	NC_011768	GTCCGG	2	12	311939	311950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218778083
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229	NC_011768	ATAACC	2	12	497067	497078	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218778231
230	NC_011768	TCGGGT	2	12	497589	497600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218778231
231	NC_011768	CAGGCA	2	12	498169	498180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218778231
232	NC_011768	CGGGCA	2	12	498697	498708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778231
233	NC_011768	CCATCA	2	12	499138	499149	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218778231
234	NC_011768	CATCGT	2	12	500552	500563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218778231
235	NC_011768	CATCAC	2	12	500624	500635	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218778231
236	NC_011768	CATCAC	2	12	501905	501916	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218778231
237	NC_011768	CCGGAA	2	12	503302	503313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218778231
238	NC_011768	GGAACG	2	12	503748	503759	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218778231
239	NC_011768	CATCAA	2	12	504329	504340	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218778231
240	NC_011768	TGGCCC	2	12	505822	505833	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218778231
241	NC_011768	ACGCAG	2	12	506872	506883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218778231
242	NC_011768	TGACAC	2	12	509894	509905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218778231
243	NC_011768	ACGGGC	2	12	510045	510056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778231
244	NC_011768	AGCCTG	2	12	511179	511190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778231
245	NC_011768	GACGGC	2	12	511476	511487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778231
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249	NC_011768	GCGGGC	2	12	518568	518579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218778231
250	NC_011768	GGACGC	2	12	519386	519397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778231
251	NC_011768	ACCCTG	2	12	521010	521021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218778231
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254	NC_011768	CGTGAC	2	12	525722	525733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778231
255	NC_011768	TGAACG	2	12	526087	526098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218778231
256	NC_011768	GGGCGT	2	12	526946	526957	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218778231
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262	NC_011768	GAAGGC	2	12	548889	548900	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218778249
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330	NC_011768	TGGCCT	2	12	712918	712929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218778383
331	NC_011768	CAAGGC	2	12	712985	712996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218778383
332	NC_011768	GGAGCC	2	12	715279	715290	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778385
333	NC_011768	GGCCAG	2	12	716107	716118	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778385
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335	NC_011768	GGGCGG	2	12	718542	718553	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	218778385
336	NC_011768	GCCGGA	2	12	719974	719985	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218778385
337	NC_011768	GGCCTG	2	12	722103	722114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218778386
338	NC_011768	ACGCCG	2	12	722308	722319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218778386
339	NC_011768	CGTAGG	2	12	725908	725919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218778388
340	NC_011768	CGTGGG	2	12	730038	730049	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218778391
341	NC_011768	CCTCAT	2	12	730083	730094	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218778391
342	NC_011768	ACGAAT	2	12	731548	731559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218778392
343	NC_011768	CCATGG	2	12	732581	732592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778394
344	NC_011768	CGTCCA	2	12	733859	733870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218778394
345	NC_011768	GCGTCC	2	12	734734	734745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218778394
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347	NC_011768	TCAGCG	2	12	741165	741176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778398
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349	NC_011768	GTTGGA	2	12	744738	744749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218778400
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443	NC_011768	CAAGAT	2	12	1032410	1032421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218778622
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453	NC_011768	TTCCAG	2	12	1044550	1044561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218778628
454	NC_011768	TGGTTC	2	12	1050857	1050868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218778632
455	NC_011768	CTGCGG	2	12	1055333	1055344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218778635
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457	NC_011768	CTGGGA	2	12	1059040	1059051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218778640
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459	NC_011768	GGACTT	2	12	1060360	1060371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218778640
460	NC_011768	GCATCG	2	12	1062856	1062867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218778641
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