MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 chromosome

Total Repeats: 4123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011768	TGCCC	2	10	1325	1334	0 %	20 %	20 %	60 %	218777862
2	NC_011768	CGATT	2	10	3572	3581	20 %	40 %	20 %	20 %	218777864
3	NC_011768	GCCGT	2	10	4540	4549	0 %	20 %	40 %	40 %	218777864
4	NC_011768	TGCCG	2	10	5075	5084	0 %	20 %	40 %	40 %	218777864
5	NC_011768	TGACG	2	10	9962	9971	20 %	20 %	40 %	20 %	218777866
6	NC_011768	CATGC	2	10	10491	10500	20 %	20 %	20 %	40 %	218777866
7	NC_011768	GGCAG	2	10	11006	11015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011768	GCGGT	2	10	11638	11647	0 %	20 %	60 %	20 %	218777867
9	NC_011768	AAAGC	2	10	14071	14080	60 %	0 %	20 %	20 %	218777869
10	NC_011768	AAAGC	2	10	15601	15610	60 %	0 %	20 %	20 %	218777870
11	NC_011768	CGCCC	2	10	15932	15941	0 %	0 %	20 %	80 %	218777870
12	NC_011768	CCCAT	2	10	17126	17135	20 %	20 %	0 %	60 %	218777871
13	NC_011768	GCCGG	2	10	17196	17205	0 %	0 %	60 %	40 %	218777871
14	NC_011768	GCCGG	2	10	17629	17638	0 %	0 %	60 %	40 %	218777871
15	NC_011768	CCGCC	2	10	20038	20047	0 %	0 %	20 %	80 %	218777873
16	NC_011768	GCAGG	2	10	21341	21350	20 %	0 %	60 %	20 %	218777874
17	NC_011768	ATTTC	2	10	24075	24084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011768	ACGGA	2	10	24178	24187	40 %	0 %	40 %	20 %	218777876
19	NC_011768	GCCTG	2	10	25228	25237	0 %	20 %	40 %	40 %	218777876
20	NC_011768	CAACA	2	10	29897	29906	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011768	CGGGC	2	10	30791	30800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011768	GGCAT	2	10	30933	30942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011768	GAAAT	2	10	32836	32845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011768	GCTTA	2	10	32931	32940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011768	CCAGG	2	10	33635	33644	20 %	0 %	40 %	40 %	218777882
26	NC_011768	TGCTT	2	10	34169	34178	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011768	GAAAA	2	10	36596	36605	80 %	0 %	20 %	0 %	218777885
28	NC_011768	CTTTC	2	10	37450	37459	0 %	60 %	0 %	40 %	218777886
29	NC_011768	GCATT	2	10	38965	38974	20 %	40 %	20 %	20 %	218777887
30	NC_011768	CCGGT	2	10	39387	39396	0 %	20 %	40 %	40 %	218777887
31	NC_011768	GGCCA	2	10	39813	39822	20 %	0 %	40 %	40 %	218777887
32	NC_011768	TGGTC	2	10	40938	40947	0 %	40 %	40 %	20 %	218777889
33	NC_011768	ACCGC	2	10	45348	45357	20 %	0 %	20 %	60 %	218777890
34	NC_011768	AGGCC	2	10	47242	47251	20 %	0 %	40 %	40 %	218777894
35	NC_011768	GCCCG	2	10	47287	47296	0 %	0 %	40 %	60 %	218777894
36	NC_011768	TGGGC	2	10	47569	47578	0 %	20 %	60 %	20 %	218777894
37	NC_011768	TTCCG	2	10	48638	48647	0 %	40 %	20 %	40 %	218777894
38	NC_011768	GAATT	2	10	48825	48834	40 %	40 %	20 %	0 %	218777894
39	NC_011768	TCCCA	2	10	52090	52099	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_011768	TTTGC	2	10	53336	53345	0 %	60 %	20 %	20 %	218777896
41	NC_011768	AAGCA	2	10	55221	55230	60 %	0 %	20 %	20 %	218777899
42	NC_011768	CCGCA	2	10	58010	58019	20 %	0 %	20 %	60 %	218777901
43	NC_011768	TCGCT	2	10	58468	58477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011768	TCCAG	2	10	61166	61175	20 %	20 %	20 %	40 %	218777904
45	NC_011768	CCCAG	2	10	61322	61331	20 %	0 %	20 %	60 %	218777904
46	NC_011768	CCGGG	2	10	62993	63002	0 %	0 %	60 %	40 %	218777906
47	NC_011768	AAGGG	2	10	66143	66152	40 %	0 %	60 %	0 %	218777909
48	NC_011768	CTGCT	2	10	66512	66521	0 %	40 %	20 %	40 %	218777909
49	NC_011768	TTTCT	2	10	66619	66628	0 %	80 %	0 %	20 %	218777909
50	NC_011768	AGCCC	2	10	66640	66649	20 %	0 %	20 %	60 %	218777909
51	NC_011768	GGGGC	2	10	67378	67387	0 %	0 %	80 %	20 %	218777910
52	NC_011768	TGGAC	2	10	67897	67906	20 %	20 %	40 %	20 %	218777910
53	NC_011768	GCCCC	2	10	71460	71469	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_011768	CGCCT	2	10	71974	71983	0 %	20 %	20 %	60 %	218777912
55	NC_011768	CCCGG	2	10	72448	72457	0 %	0 %	40 %	60 %	218777912
56	NC_011768	GCCTT	2	10	74908	74917	0 %	40 %	20 %	40 %	218777913
57	NC_011768	GGTCC	2	10	75408	75417	0 %	20 %	40 %	40 %	218777913
58	NC_011768	CGGCG	2	10	77883	77892	0 %	0 %	60 %	40 %	218777915
59	NC_011768	CCATC	2	10	80403	80412	20 %	20 %	0 %	60 %	218777916
60	NC_011768	TGGAA	2	10	81532	81541	40 %	20 %	40 %	0 %	218777917
61	NC_011768	GGGGC	2	10	81562	81571	0 %	0 %	80 %	20 %	218777917
62	NC_011768	AGGGC	2	10	81689	81698	20 %	0 %	60 %	20 %	218777917
63	NC_011768	AGGGC	2	10	83630	83639	20 %	0 %	60 %	20 %	218777919
64	NC_011768	GCGGG	2	10	85676	85685	0 %	0 %	80 %	20 %	218777921
65	NC_011768	TAGTT	2	10	86231	86240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011768	TAATA	2	10	86319	86328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011768	CAAAA	2	10	89302	89311	80 %	0 %	0 %	20 %	218777923
68	NC_011768	AGTTT	2	10	89361	89370	20 %	60 %	20 %	0 %	218777923
69	NC_011768	CTCTT	2	10	89439	89448	0 %	60 %	0 %	40 %	218777923
70	NC_011768	GATTG	2	10	91245	91254	20 %	40 %	40 %	0 %	218777924
71	NC_011768	AATTA	2	10	92047	92056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011768	ACTGC	2	10	92329	92338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011768	GGTCC	2	10	92829	92838	0 %	20 %	40 %	40 %	218777925
74	NC_011768	AAAGC	2	10	93776	93785	60 %	0 %	20 %	20 %	218777925
75	NC_011768	GCGCC	2	10	94596	94605	0 %	0 %	40 %	60 %	218777926
76	NC_011768	CGTTT	2	10	95650	95659	0 %	60 %	20 %	20 %	218777926
77	NC_011768	GGCCC	2	10	96796	96805	0 %	0 %	40 %	60 %	218777928
78	NC_011768	CCCGT	2	10	97776	97785	0 %	20 %	20 %	60 %	218777929
79	NC_011768	TTTTC	2	10	98378	98387	0 %	80 %	0 %	20 %	218777930
80	NC_011768	ATAGG	2	10	99066	99075	40 %	20 %	40 %	0 %	218777930
81	NC_011768	ATTCC	2	10	99251	99260	20 %	40 %	0 %	40 %	218777930
82	NC_011768	GCCTG	2	10	102769	102778	0 %	20 %	40 %	40 %	218777932
83	NC_011768	GATGC	2	10	105259	105268	20 %	20 %	40 %	20 %	218777932
84	NC_011768	TCCAT	2	10	105409	105418	20 %	40 %	0 %	40 %	218777932
85	NC_011768	GGGAT	2	10	108793	108802	20 %	20 %	60 %	0 %	218777933
86	NC_011768	CCCAG	2	10	109426	109435	20 %	0 %	20 %	60 %	218777933
87	NC_011768	ATTAT	2	10	109540	109549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011768	CCATT	2	10	109664	109673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011768	GAAAA	2	10	111784	111793	80 %	0 %	20 %	0 %	218777936
90	NC_011768	AGGGC	2	10	111861	111870	20 %	0 %	60 %	20 %	218777936
91	NC_011768	TCGGA	2	10	114649	114658	20 %	20 %	40 %	20 %	218777940
92	NC_011768	AAAGG	2	10	116586	116595	60 %	0 %	40 %	0 %	218777940
93	NC_011768	CTCCA	2	10	117498	117507	20 %	20 %	0 %	60 %	218777940
94	NC_011768	GCCGC	2	10	117751	117760	0 %	0 %	40 %	60 %	218777940
95	NC_011768	GCCTG	2	10	118344	118353	0 %	20 %	40 %	40 %	218777940
96	NC_011768	GGCCG	2	10	120413	120422	0 %	0 %	60 %	40 %	218777942
97	NC_011768	TCCTT	2	10	121206	121215	0 %	60 %	0 %	40 %	218777943
98	NC_011768	GGCCG	2	10	122734	122743	0 %	0 %	60 %	40 %	218777944
99	NC_011768	TGGCG	2	10	125359	125368	0 %	20 %	60 %	20 %	218777945
100	NC_011768	TCCCT	2	10	125553	125562	0 %	40 %	0 %	60 %	218777945
101	NC_011768	GCCCA	2	10	126375	126384	20 %	0 %	20 %	60 %	218777945
102	NC_011768	AGGCC	2	10	127844	127853	20 %	0 %	40 %	40 %	218777946
103	NC_011768	GGAAT	2	10	128036	128045	40 %	20 %	40 %	0 %	218777946
104	NC_011768	AGGGG	2	10	128230	128239	20 %	0 %	80 %	0 %	218777946
105	NC_011768	CCGGA	2	10	129349	129358	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011768	AGGGC	2	10	130342	130351	20 %	0 %	60 %	20 %	218777948
107	NC_011768	GCCAG	2	10	132847	132856	20 %	0 %	40 %	40 %	218777949
108	NC_011768	GCCGG	2	10	135227	135236	0 %	0 %	60 %	40 %	218777951
109	NC_011768	GGGTC	2	10	136182	136191	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011768	GTTCT	2	10	139770	139779	0 %	60 %	20 %	20 %	218777952
111	NC_011768	GACCC	2	10	140923	140932	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_011768	TGACC	2	10	141232	141241	20 %	20 %	20 %	40 %	218777953
113	NC_011768	GGAAA	2	10	141719	141728	60 %	0 %	40 %	0 %	218777953
114	NC_011768	GGCCC	2	10	144667	144676	0 %	0 %	40 %	60 %	218777954
115	NC_011768	TAAAA	2	10	146806	146815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011768	CAAAA	2	10	152168	152177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011768	CGGAC	2	10	153673	153682	20 %	0 %	40 %	40 %	218777964
118	NC_011768	GGAAA	2	10	154822	154831	60 %	0 %	40 %	0 %	218777965
119	NC_011768	AATGG	2	10	158787	158796	40 %	20 %	40 %	0 %	218777967
120	NC_011768	GGAAA	2	10	159627	159636	60 %	0 %	40 %	0 %	218777967
121	NC_011768	TTCTT	2	10	159798	159807	0 %	80 %	0 %	20 %	218777967
122	NC_011768	AGGGC	2	10	161100	161109	20 %	0 %	60 %	20 %	218777967
123	NC_011768	GGCTC	2	10	161849	161858	0 %	20 %	40 %	40 %	218777968
124	NC_011768	CCATG	2	10	162961	162970	20 %	20 %	20 %	40 %	218777970
125	NC_011768	TCTGC	2	10	164811	164820	0 %	40 %	20 %	40 %	218777972
126	NC_011768	CAAAC	2	10	165608	165617	60 %	0 %	0 %	40 %	218777973
127	NC_011768	AATAC	2	10	165723	165732	60 %	20 %	0 %	20 %	218777973
128	NC_011768	CGGGA	2	10	167575	167584	20 %	0 %	60 %	20 %	218777975
129	NC_011768	AATAA	2	10	167813	167822	80 %	20 %	0 %	0 %	218777975
130	NC_011768	GAAAA	2	10	169931	169940	80 %	0 %	20 %	0 %	218777977
131	NC_011768	TTTTC	2	10	170643	170652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011768	CCTTT	2	10	172662	172671	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011768	CGGCC	2	10	177079	177088	0 %	0 %	40 %	60 %	218777985
134	NC_011768	ATTTT	2	10	177740	177749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011768	TTCTT	2	10	178872	178881	0 %	80 %	0 %	20 %	218777987
136	NC_011768	TTTGG	2	10	179709	179718	0 %	60 %	40 %	0 %	218777988
137	NC_011768	TTGGG	2	10	182154	182163	0 %	40 %	60 %	0 %	218777989
138	NC_011768	ATGGG	2	10	182256	182265	20 %	20 %	60 %	0 %	218777989
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177	NC_011768	CTTTT	2	10	241679	241688	0 %	80 %	0 %	20 %	218778034
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266	NC_011768	AGGCC	2	10	380026	380035	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
267	NC_011768	TCCGG	2	10	380658	380667	0 %	20 %	40 %	40 %	218778140
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269	NC_011768	ACGAT	2	10	380776	380785	40 %	20 %	20 %	20 %	218778140
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