MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 chromosome

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011768	GGCAG	2	10	11006	11015	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011768	ATTTC	2	10	24075	24084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011768	CAACA	2	10	29897	29906	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011768	CGGGC	2	10	30791	30800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011768	GGCAT	2	10	30933	30942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011768	GAAAT	2	10	32836	32845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011768	GCTTA	2	10	32931	32940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011768	TGCTT	2	10	34169	34178	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011768	TCCCA	2	10	52090	52099	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_011768	TCGCT	2	10	58468	58477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011768	GCCCC	2	10	71460	71469	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_011768	TAGTT	2	10	86231	86240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011768	TAATA	2	10	86319	86328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011768	AATTA	2	10	92047	92056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011768	ACTGC	2	10	92329	92338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011768	ATTAT	2	10	109540	109549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011768	CCATT	2	10	109664	109673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011768	CCGGA	2	10	129349	129358	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011768	GGGTC	2	10	136182	136191	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011768	GACCC	2	10	140923	140932	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011768	TAAAA	2	10	146806	146815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011768	CAAAA	2	10	152168	152177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011768	TTTTC	2	10	170643	170652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011768	CCTTT	2	10	172662	172671	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011768	ATTTT	2	10	177740	177749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011768	TCCGT	2	10	182848	182857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011768	TGCCC	2	10	207037	207046	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_011768	GGAAT	2	10	232437	232446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011768	ATATT	2	10	234658	234667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011768	AGGCG	2	10	236097	236106	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011768	GTTGG	2	10	241360	241369	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011768	AAGGC	2	10	266367	266376	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011768	GCCCA	2	10	274309	274318	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011768	TTGGG	2	10	278863	278872	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011768	GTAGT	2	10	278949	278958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011768	TGGGT	2	10	292896	292905	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011768	GGGCA	2	10	293005	293014	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011768	AATAC	2	10	301073	301082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011768	CGCTT	2	10	302946	302955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011768	CCGGC	2	10	302966	302975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_011768	AATTA	2	10	313167	313176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011768	CGGGG	2	10	314824	314833	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011768	ATGCT	2	10	317464	317473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011768	AGGCG	2	10	332075	332084	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011768	AAATC	2	10	336866	336875	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011768	TTGTA	2	10	339514	339523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011768	CCTAT	2	10	367842	367851	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011768	AGGCC	2	10	380026	380035	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011768	ATGGA	2	10	390422	390431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011768	AAGCA	2	10	403903	403912	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011768	AACCC	2	10	404060	404069	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_011768	GGCAG	2	10	417599	417608	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011768	CAACC	2	10	427633	427642	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_011768	GCCTT	2	10	427771	427780	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011768	GTATG	2	10	443276	443285	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011768	TTTTA	2	10	534157	534166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011768	CGCTG	2	10	550026	550035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011768	ATGAG	2	10	561647	561656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011768	ATTTT	2	10	579656	579665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011768	GAATT	2	10	596033	596042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011768	GGGCG	2	10	596852	596861	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011768	TTCAA	2	10	629205	629214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011768	AAACC	2	10	664907	664916	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011768	GTATC	2	10	668223	668232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011768	GAAAG	2	10	688060	688069	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011768	GGTTG	2	10	693312	693321	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011768	TGCCA	2	10	727576	727585	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011768	TTCAA	2	10	728942	728951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011768	TTCCT	2	10	735590	735599	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011768	CGCTT	2	10	764328	764337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_011768	TTCGG	2	10	766843	766852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011768	TGATT	2	10	773716	773725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011768	TGTTT	2	10	784490	784499	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011768	TATTG	2	10	823413	823422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011768	GATAA	2	10	841413	841422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011768	TCATC	2	10	865659	865668	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011768	ACAGG	2	10	886679	886688	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011768	CATTT	2	10	895295	895304	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011768	TCCAT	2	10	896152	896161	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011768	CGGCT	2	10	904279	904288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011768	AAATA	2	10	924847	924856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011768	CAACC	2	10	936485	936494	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_011768	TTCAA	2	10	942522	942531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011768	AAAGG	2	10	942853	942862	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011768	AATCA	2	10	976239	976248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011768	ACCGG	2	10	979054	979063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011768	AGGGG	2	10	980249	980258	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011768	ATATT	2	10	1006535	1006544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011768	GGTTG	2	10	1007702	1007711	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011768	ATTTG	2	10	1014090	1014099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011768	GGGCG	2	10	1026573	1026582	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011768	AAAAT	2	10	1026623	1026632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011768	CAACC	2	10	1030227	1030236	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_011768	CAACC	2	10	1037127	1037136	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_011768	CTTCA	2	10	1052202	1052211	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_011768	TGGGG	2	10	1068570	1068579	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011768	CAACC	2	10	1073276	1073285	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_011768	GTCCA	2	10	1077309	1077318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011768	CAACC	2	10	1083403	1083412	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_011768	CAACC	2	10	1085736	1085745	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011768	GGTTG	2	10	1085769	1085778	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011768	GTTTT	2	10	1123475	1123484	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011768	AGTTG	2	10	1202554	1202563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011768	TTTGT	2	10	1209513	1209522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011768	GGGAC	2	10	1216677	1216686	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011768	CACAT	2	10	1260435	1260444	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011768	TGCTA	2	10	1271471	1271480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011768	ATTCC	2	10	1272276	1272285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011768	TGCGC	2	10	1276204	1276213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011768	TTTTA	2	10	1276635	1276644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011768	ATTGG	2	10	1314325	1314334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011768	GGTTG	2	10	1314652	1314661	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011768	AAGGA	2	10	1360667	1360676	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011768	CCGGC	2	10	1381811	1381820	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_011768	GGCGG	2	10	1381943	1381952	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011768	AGTGC	2	10	1383212	1383221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011768	TAAAA	2	10	1384293	1384302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011768	AAACG	2	10	1403268	1403277	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011768	TGGAA	2	10	1421933	1421942	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011768	CAAAA	2	10	1423818	1423827	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011768	GGTGG	2	10	1438144	1438153	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011768	CTGGG	2	10	1438181	1438190	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011768	GGCGC	2	10	1443054	1443063	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011768	AAAAC	2	10	1443105	1443114	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011768	ATTTG	2	10	1462781	1462790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011768	ATGCA	2	10	1473328	1473337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011768	GGAAA	2	10	1475907	1475916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011768	CCCCT	2	10	1487868	1487877	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
129	NC_011768	GTATT	2	10	1488376	1488385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011768	ACAGG	2	10	1488551	1488560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011768	CCTGA	2	10	1488568	1488577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011768	TGGGG	2	10	1492012	1492021	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011768	AGGAA	2	10	1500795	1500804	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011768	TTTTA	2	10	1513857	1513866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011768	TATTT	2	10	1560013	1560022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011768	TTGGC	2	10	1569181	1569190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011768	TTGCA	2	10	1570033	1570042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011768	GCAGC	2	10	1591149	1591158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011768	TGCCT	2	10	1592621	1592630	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011768	CGGGC	2	10	1608141	1608150	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011768	GGTTG	2	10	1636672	1636681	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011768	CCGCT	2	10	1638541	1638550	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_011768	TTGCC	2	10	1644758	1644767	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011768	GCAGC	2	10	1656458	1656467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_011768	TAGGT	2	10	1657012	1657021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_011768	GCATT	2	10	1777301	1777310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_011768	GGGGC	2	10	1782220	1782229	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
162	NC_011768	CAGGG	2	10	1805694	1805703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_011768	GGGCA	2	10	1919204	1919213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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218	NC_011768	TGGGG	2	10	2220819	2220828	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
219	NC_011768	GGTTG	2	10	2224938	2224947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_011768	GGTTG	2	10	2234206	2234215	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_011768	TAGGT	2	10	2382599	2382608	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
243	NC_011768	CGCCC	2	10	2386076	2386085	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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248	NC_011768	ACTGC	2	10	2437184	2437193	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_011768	TGGGG	2	10	2441041	2441050	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
250	NC_011768	TATGA	2	10	2456449	2456458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_011768	ATATT	2	10	2460253	2460262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_011768	CCCGG	2	10	2474484	2474493	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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258	NC_011768	GAGGC	2	10	2530694	2530703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_011768	TCCCC	2	10	2534099	2534108	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
262	NC_011768	AATTA	2	10	2559446	2559455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011768	GATTT	2	10	2567541	2567550	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_011768	CCCCG	2	10	2578171	2578180	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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277	NC_011768	TGGGG	2	10	2651715	2651724	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_011768	TCTAT	2	10	2668739	2668748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
281	NC_011768	GATTG	2	10	2674572	2674581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011768	GCCGC	2	10	2683529	2683538	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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