MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome

Total Repeats: 18679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011766	GAG	2	6	68	73	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011766	GAG	2	6	80	85	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011766	AGG	2	6	91	96	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011766	AGA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883315
5	NC_011766	GCA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883315
6	NC_011766	GAA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883316
7	NC_011766	ACT	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
8	NC_011766	ACT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
9	NC_011766	TAT	2	6	680	685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
10	NC_011766	CTC	2	6	706	711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
11	NC_011766	ATT	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
12	NC_011766	TCC	3	9	785	793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
13	NC_011766	TAT	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
14	NC_011766	CAA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883316
15	NC_011766	CGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883316
16	NC_011766	CTC	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
17	NC_011766	CAC	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
18	NC_011766	CAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883317
19	NC_011766	ACC	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
20	NC_011766	CTT	2	6	1648	1653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883317
21	NC_011766	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883317
22	NC_011766	AAT	2	6	1780	1785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011766	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011766	CTT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011766	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011766	AGT	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011766	ATT	2	6	2134	2139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011766	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011766	TGG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883318
30	NC_011766	CAT	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
31	NC_011766	ATG	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883318
32	NC_011766	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
33	NC_011766	ACT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
34	NC_011766	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
35	NC_011766	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
36	NC_011766	AAG	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883318
37	NC_011766	AAT	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
38	NC_011766	GCC	2	6	2542	2547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218883319
39	NC_011766	AAT	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
40	NC_011766	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883319
41	NC_011766	CAT	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883319
42	NC_011766	TCT	2	6	2891	2896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
43	NC_011766	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
44	NC_011766	GTA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
45	NC_011766	AAT	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
46	NC_011766	CCA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883319
47	NC_011766	TTC	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
48	NC_011766	TAC	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
49	NC_011766	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
50	NC_011766	CTA	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
51	NC_011766	AAT	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883320
52	NC_011766	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
53	NC_011766	TAT	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
54	NC_011766	GAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883320
55	NC_011766	ATG	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883320
56	NC_011766	CCT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883320
57	NC_011766	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
58	NC_011766	CTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883320
59	NC_011766	GCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
60	NC_011766	TAC	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
61	NC_011766	GAT	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
62	NC_011766	TAG	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
63	NC_011766	CCT	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
64	NC_011766	ATT	2	6	5070	5075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
65	NC_011766	TCG	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883321
66	NC_011766	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883321
67	NC_011766	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883321
68	NC_011766	CTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
69	NC_011766	TTA	2	6	5320	5325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
70	NC_011766	TTA	2	6	5630	5635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011766	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011766	TTA	2	6	5702	5707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011766	GAA	2	6	5784	5789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
74	NC_011766	AGG	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
75	NC_011766	CGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883322
76	NC_011766	GAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
77	NC_011766	ACC	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883322
78	NC_011766	CAG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883322
79	NC_011766	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
80	NC_011766	CAA	2	6	6188	6193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883322
81	NC_011766	AGG	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
82	NC_011766	AGG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
83	NC_011766	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883322
84	NC_011766	AAT	2	6	6738	6743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883322
85	NC_011766	TAT	2	6	6855	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011766	TGG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883323
87	NC_011766	TTG	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218883323
88	NC_011766	AGC	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883323
89	NC_011766	CTT	2	6	7288	7293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883323
90	NC_011766	AAG	2	6	7845	7850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011766	GAT	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883324
92	NC_011766	CAG	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883324
93	NC_011766	TGG	2	6	8161	8166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883324
94	NC_011766	TTC	2	6	8254	8259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883324
95	NC_011766	TAG	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883324
96	NC_011766	ATA	2	6	8341	8346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883324
97	NC_011766	TCA	2	6	8414	8419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883324
98	NC_011766	ATA	2	6	8426	8431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883324
99	NC_011766	CAA	2	6	8439	8444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883324
100	NC_011766	ATT	2	6	8496	8501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883324
101	NC_011766	TAG	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883324
102	NC_011766	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883324
103	NC_011766	GAA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883324
104	NC_011766	GAC	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883324
105	NC_011766	GGA	2	6	8679	8684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883324
106	NC_011766	ATG	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883324
107	NC_011766	GCA	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883324
108	NC_011766	GAA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883324
109	NC_011766	TAT	2	6	9002	9007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883324
110	NC_011766	AAT	2	6	9114	9119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883324
111	NC_011766	TGA	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883324
112	NC_011766	CTT	2	6	9291	9296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883325
113	NC_011766	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883325
114	NC_011766	TCA	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883326
115	NC_011766	TTA	2	6	9707	9712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883326
116	NC_011766	GAT	3	9	9724	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883326
117	NC_011766	TTA	2	6	9851	9856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883326
118	NC_011766	CTT	2	6	9875	9880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883326
119	NC_011766	CTT	2	6	9927	9932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883326
120	NC_011766	AAT	2	6	9964	9969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883326
121	NC_011766	CAT	2	6	9996	10001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883326
122	NC_011766	AAT	2	6	10009	10014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883326
123	NC_011766	TCC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883326
124	NC_011766	TGG	2	6	10045	10050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883326
125	NC_011766	CCT	2	6	10178	10183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883326
126	NC_011766	CCA	2	6	10184	10189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883326
127	NC_011766	GAT	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883326
128	NC_011766	CAG	2	6	10205	10210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883326
129	NC_011766	TAT	3	9	10305	10313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883326
130	NC_011766	GCG	2	6	10487	10492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218883326
131	NC_011766	TAA	2	6	10550	10555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883326
132	NC_011766	ACT	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883326
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260	NC_011766	CAA	2	6	19664	19669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883336
261	NC_011766	CTA	2	6	19806	19811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883336
262	NC_011766	CAA	2	6	19826	19831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883336
263	NC_011766	GAG	2	6	19851	19856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883336
264	NC_011766	GGA	2	6	20162	20167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883336
265	NC_011766	GTT	2	6	20183	20188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218883336
266	NC_011766	GAG	2	6	20189	20194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883336
267	NC_011766	GTG	2	6	20208	20213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883336
268	NC_011766	TTC	2	6	20217	20222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883336
269	NC_011766	GAG	2	6	20291	20296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_011766	TGT	2	6	20316	20321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_011766	TGT	2	6	20353	20358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011766	TGC	2	6	20360	20365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_011766	TAT	2	6	20377	20382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_011766	AAG	2	6	23762	23767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
318	NC_011766	CCT	2	6	23862	23867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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320	NC_011766	TAT	2	6	23915	23920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_011766	TTG	2	6	23923	23928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
322	NC_011766	TGG	2	6	23940	23945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_011766	ATT	2	6	25984	25989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_011766	TTA	2	6	26033	26038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883340
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373	NC_011766	TTC	2	6	27759	27764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
374	NC_011766	AAT	2	6	27827	27832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883343
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378	NC_011766	GAG	2	6	28217	28222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883343
379	NC_011766	TAG	2	6	28311	28316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883344
380	NC_011766	TAT	2	6	28363	28368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883344
381	NC_011766	GGA	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883344
382	NC_011766	GTG	2	6	28485	28490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883344
383	NC_011766	ATT	2	6	28531	28536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883344
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