MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	TCATTT	2	12	31354	31365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011761	GTGCTG	2	12	84156	84167	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011761	TTGCGC	2	12	89167	89178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011761	TCCGGC	2	12	103226	103237	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011761	GGAAGT	2	12	103842	103853	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011761	GGCTGG	2	12	105950	105961	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011761	TCAGGG	2	12	119507	119518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011761	GGTTCT	2	12	137737	137748	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011761	TTTCCG	2	12	278779	278790	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011761	AGGGCG	2	12	374009	374020	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011761	CCGGCA	2	12	445241	445252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011761	AAGGGC	2	12	448330	448341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011761	CCATGT	2	12	497625	497636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011761	CGGATG	2	12	795871	795882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011761	GGCATG	2	12	800876	800887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011761	GCAGGT	2	12	831937	831948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011761	GCTGTT	2	12	832046	832057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011761	TTTGGA	2	12	928086	928097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011761	ATCCAC	2	12	941154	941165	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011761	TGGGGT	2	12	957447	957458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011761	GGTTGT	2	12	1000131	1000142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011761	GTCTGC	2	12	1011736	1011747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011761	TTGGGG	2	12	1024608	1024619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011761	CGTGAA	2	12	1028863	1028874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011761	TCCTAT	2	12	1031872	1031883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011761	ACGGCA	2	12	1034048	1034059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011761	CCCCAA	2	12	1114941	1114952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011761	CCAACC	2	12	1120441	1120452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011761	ACGCCA	2	12	1135191	1135202	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011761	GGGGCC	2	12	1152554	1152565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011761	GGCCGA	2	12	1180634	1180645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011761	CGACCT	2	12	1192774	1192785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011761	TTATTG	2	12	1310123	1310134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011761	GCGCAC	2	12	1388630	1388641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011761	AGGGCG	2	12	1404873	1404884	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011761	ACATCG	2	12	1470849	1470860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011761	GCTGCC	2	12	1493628	1493639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011761	CGAGCC	2	12	1519149	1519160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011761	GCCCCA	2	12	1519625	1519636	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011761	CTCCGT	2	12	1545092	1545103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011761	GTTCTG	2	12	1593229	1593240	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011761	TGTCCT	2	12	1616741	1616752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011761	CGCTGG	2	12	1618932	1618943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011761	CGGCAT	2	12	1667770	1667781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011761	TAGTTA	2	12	1706086	1706097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011761	TTTTGC	2	12	1742530	1742541	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011761	GCCATG	2	12	1756285	1756296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011761	GCCCAG	2	12	1853248	1853259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011761	GCCTCA	2	12	1853585	1853596	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011761	TCCGAC	2	12	1861324	1861335	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011761	TAATTA	2	12	1861428	1861439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011761	CTTTGC	2	12	1882131	1882142	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011761	CATGGA	2	12	1994593	1994604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011761	TCCTGT	2	12	2186302	2186313	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011761	CCTGCC	2	12	2211820	2211831	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011761	CTGTCG	2	12	2211930	2211941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011761	TCCCTG	2	12	2232111	2232122	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011761	GGCAGC	2	12	2232332	2232343	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011761	TTAACG	3	18	2234235	2234252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011761	GCATTT	2	12	2314292	2314303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011761	GTTCCA	2	12	2352279	2352290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011761	CTTCGG	2	12	2435839	2435850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011761	ACCTGA	2	12	2469725	2469736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011761	CGGCCT	2	12	2470840	2470851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011761	CCGTAT	2	12	2476338	2476349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011761	TTGCAT	2	12	2492025	2492036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011761	CCCATG	2	12	2517048	2517059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011761	GGTAGC	2	12	2553866	2553877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011761	AGCGTG	2	12	2581069	2581080	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011761	TCCGAC	2	12	2593810	2593821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011761	AGCGCA	2	12	2722294	2722305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011761	ACCTAT	2	12	2764485	2764496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011761	ATGGAA	2	12	2800502	2800513	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011761	GCCATG	2	12	2846910	2846921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011761	GGAGAT	2	12	2847714	2847725	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011761	AAAACT	2	12	2852020	2852031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.