MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 1991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	ACTGG	2	10	1571	1580	20 %	20 %	40 %	20 %	218666274
2	NC_011761	CTCTG	2	10	4044	4053	0 %	40 %	20 %	40 %	218665824
3	NC_011761	TGCCC	2	10	4150	4159	0 %	20 %	20 %	60 %	218665824
4	NC_011761	CGCAG	2	10	4766	4775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011761	AGACC	2	10	4897	4906	40 %	0 %	20 %	40 %	218667844
6	NC_011761	GGCGC	2	10	6202	6211	0 %	0 %	60 %	40 %	218667844
7	NC_011761	CGGCC	2	10	7687	7696	0 %	0 %	40 %	60 %	218667844
8	NC_011761	CCTGG	2	10	8182	8191	0 %	20 %	40 %	40 %	218667844
9	NC_011761	ACACC	2	10	8617	8626	40 %	0 %	0 %	60 %	218666859
10	NC_011761	AGGGA	2	10	9242	9251	40 %	0 %	60 %	0 %	218668121
11	NC_011761	GTCCG	2	10	10311	10320	0 %	20 %	40 %	40 %	218665167
12	NC_011761	ACCGG	2	10	11761	11770	20 %	0 %	40 %	40 %	218665167
13	NC_011761	GCGTT	2	10	12143	12152	0 %	40 %	40 %	20 %	218667234
14	NC_011761	CCTGC	2	10	12460	12469	0 %	20 %	20 %	60 %	218667234
15	NC_011761	ATGCC	2	10	12883	12892	20 %	20 %	20 %	40 %	218665509
16	NC_011761	GCAAT	2	10	13237	13246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011761	CCAGA	2	10	17015	17024	40 %	0 %	20 %	40 %	218667808
18	NC_011761	GCGCG	2	10	17739	17748	0 %	0 %	60 %	40 %	218667808
19	NC_011761	CACCG	2	10	19634	19643	20 %	0 %	20 %	60 %	218666611
20	NC_011761	GCGCC	2	10	21154	21163	0 %	0 %	40 %	60 %	218667290
21	NC_011761	GGCGC	3	15	21700	21714	0 %	0 %	60 %	40 %	218665976
22	NC_011761	TCAGC	2	10	25052	25061	20 %	20 %	20 %	40 %	218668036
23	NC_011761	GCTGT	2	10	25083	25092	0 %	40 %	40 %	20 %	218668036
24	NC_011761	GCGCC	2	10	27384	27393	0 %	0 %	40 %	60 %	218665148
25	NC_011761	TCGTC	2	10	27545	27554	0 %	40 %	20 %	40 %	218665148
26	NC_011761	GTCTG	2	10	27917	27926	0 %	40 %	40 %	20 %	218665805
27	NC_011761	CTTTC	2	10	28778	28787	0 %	60 %	0 %	40 %	218666690
28	NC_011761	ATGCA	2	10	29045	29054	40 %	20 %	20 %	20 %	218666690
29	NC_011761	TATGA	2	10	29210	29219	40 %	40 %	20 %	0 %	218666690
30	NC_011761	GCGTA	2	10	29799	29808	20 %	20 %	40 %	20 %	218666460
31	NC_011761	CGGTG	2	10	30402	30411	0 %	20 %	60 %	20 %	218666460
32	NC_011761	GAGCG	2	10	33892	33901	20 %	0 %	60 %	20 %	218665938
33	NC_011761	GTGAC	2	10	33972	33981	20 %	20 %	40 %	20 %	218665938
34	NC_011761	AGTCC	2	10	35406	35415	20 %	20 %	20 %	40 %	218667012
35	NC_011761	GGATT	2	10	38754	38763	20 %	40 %	40 %	0 %	218665463
36	NC_011761	GCGCC	2	10	40795	40804	0 %	0 %	40 %	60 %	218665063
37	NC_011761	CCTGC	3	15	43701	43715	0 %	20 %	20 %	60 %	218665640
38	NC_011761	CCATG	2	10	46197	46206	20 %	20 %	20 %	40 %	218667680
39	NC_011761	GTCAG	2	10	49977	49986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011761	ATGGG	2	10	55627	55636	20 %	20 %	60 %	0 %	218667976
41	NC_011761	GCCTG	2	10	59467	59476	0 %	20 %	40 %	40 %	218666964
42	NC_011761	CGTGA	2	10	60069	60078	20 %	20 %	40 %	20 %	218666964
43	NC_011761	TTCAT	2	10	60521	60530	20 %	60 %	0 %	20 %	218665171
44	NC_011761	AAGAC	2	10	61202	61211	60 %	0 %	20 %	20 %	218665171
45	NC_011761	GACCG	2	10	61532	61541	20 %	0 %	40 %	40 %	218667202
46	NC_011761	GCGCC	2	10	61831	61840	0 %	0 %	40 %	60 %	218667202
47	NC_011761	TGCGG	2	10	62923	62932	0 %	20 %	60 %	20 %	218666715
48	NC_011761	GGCGC	2	10	63579	63588	0 %	0 %	60 %	40 %	218665092
49	NC_011761	GTCAC	2	10	64025	64034	20 %	20 %	20 %	40 %	218665092
50	NC_011761	GCGCG	2	10	65863	65872	0 %	0 %	60 %	40 %	218666774
51	NC_011761	GCAGA	2	10	66935	66944	40 %	0 %	40 %	20 %	218665424
52	NC_011761	GCACA	2	10	69772	69781	40 %	0 %	20 %	40 %	218667706
53	NC_011761	AAGGA	2	10	71002	71011	60 %	0 %	40 %	0 %	218666817
54	NC_011761	CGGCA	2	10	72149	72158	20 %	0 %	40 %	40 %	218666588
55	NC_011761	AATGC	2	10	75734	75743	40 %	20 %	20 %	20 %	218667791
56	NC_011761	TCAAC	2	10	76818	76827	40 %	20 %	0 %	40 %	218667791
57	NC_011761	CTTGG	2	10	79876	79885	0 %	40 %	40 %	20 %	218666725
58	NC_011761	CGGGC	2	10	82429	82438	0 %	0 %	60 %	40 %	218667850
59	NC_011761	GGGCG	2	10	83594	83603	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011761	GGCCT	2	10	86386	86395	0 %	20 %	40 %	40 %	218667877
61	NC_011761	CGCGG	2	10	87345	87354	0 %	0 %	60 %	40 %	218667365
62	NC_011761	CATGC	2	10	88281	88290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011761	AGGAC	2	10	89871	89880	40 %	0 %	40 %	20 %	218665479
64	NC_011761	CGTCC	2	10	91195	91204	0 %	20 %	20 %	60 %	218668141
65	NC_011761	CCGCG	2	10	91475	91484	0 %	0 %	40 %	60 %	218668141
66	NC_011761	GCGGT	2	10	92801	92810	0 %	20 %	60 %	20 %	218667250
67	NC_011761	CGCGT	2	10	94215	94224	0 %	20 %	40 %	40 %	218667721
68	NC_011761	GACCG	2	10	102643	102652	20 %	0 %	40 %	40 %	218667857
69	NC_011761	CTCGC	2	10	104299	104308	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011761	CCGCA	2	10	106869	106878	20 %	0 %	20 %	60 %	218665086
71	NC_011761	TTCGG	2	10	107640	107649	0 %	40 %	40 %	20 %	218667717
72	NC_011761	CGCTG	2	10	107678	107687	0 %	20 %	40 %	40 %	218667717
73	NC_011761	CCTCG	2	10	108227	108236	0 %	20 %	20 %	60 %	218667717
74	NC_011761	TTTCG	2	10	108571	108580	0 %	60 %	20 %	20 %	218665485
75	NC_011761	CGCAG	2	10	114730	114739	20 %	0 %	40 %	40 %	218667773
76	NC_011761	CGCGG	2	10	115627	115636	0 %	0 %	60 %	40 %	218666398
77	NC_011761	GCGGT	2	10	116597	116606	0 %	20 %	60 %	20 %	218666627
78	NC_011761	GCGTT	2	10	117729	117738	0 %	40 %	40 %	20 %	218667935
79	NC_011761	TGCGG	2	10	117966	117975	0 %	20 %	60 %	20 %	218667935
80	NC_011761	GGGCT	2	10	118547	118556	0 %	20 %	60 %	20 %	218665478
81	NC_011761	ATGCC	2	10	118872	118881	20 %	20 %	20 %	40 %	218665478
82	NC_011761	AGATC	2	10	121737	121746	40 %	20 %	20 %	20 %	218665989
83	NC_011761	GTCAT	2	10	122006	122015	20 %	40 %	20 %	20 %	218665989
84	NC_011761	TGCCC	2	10	122644	122653	0 %	20 %	20 %	60 %	218666273
85	NC_011761	CTTGA	2	10	124695	124704	20 %	40 %	20 %	20 %	218667524
86	NC_011761	TGACC	2	10	124784	124793	20 %	20 %	20 %	40 %	218667524
87	NC_011761	CCTCG	2	10	124970	124979	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_011761	GCAGG	2	10	125113	125122	20 %	0 %	60 %	20 %	218666661
89	NC_011761	CGCCA	2	10	126451	126460	20 %	0 %	20 %	60 %	218666351
90	NC_011761	TCGCC	2	10	127447	127456	0 %	20 %	20 %	60 %	218667238
91	NC_011761	GAGGG	2	10	127653	127662	20 %	0 %	80 %	0 %	218667238
92	NC_011761	GGTCA	2	10	127727	127736	20 %	20 %	40 %	20 %	218667238
93	NC_011761	TGCCG	2	10	130455	130464	0 %	20 %	40 %	40 %	218666270
94	NC_011761	ATCGC	2	10	130990	130999	20 %	20 %	20 %	40 %	218666270
95	NC_011761	GGCGG	2	10	133492	133501	0 %	0 %	80 %	20 %	218666262
96	NC_011761	GCCAA	2	10	135523	135532	40 %	0 %	20 %	40 %	218666864
97	NC_011761	GTGCT	2	10	138199	138208	0 %	40 %	40 %	20 %	218667440
98	NC_011761	AAAAG	2	10	139321	139330	80 %	0 %	20 %	0 %	218666749
99	NC_011761	GGCGA	2	10	140907	140916	20 %	0 %	60 %	20 %	218668048
100	NC_011761	GGCGT	2	10	143048	143057	0 %	20 %	60 %	20 %	218666943
101	NC_011761	TGCCC	2	10	144407	144416	0 %	20 %	20 %	60 %	218667827
102	NC_011761	CACGG	2	10	145212	145221	20 %	0 %	40 %	40 %	218667827
103	NC_011761	TGGGC	2	10	147309	147318	0 %	20 %	60 %	20 %	218667774
104	NC_011761	GGCGA	2	10	147415	147424	20 %	0 %	60 %	20 %	218667774
105	NC_011761	GGCCT	2	10	147819	147828	0 %	20 %	40 %	40 %	218667774
106	NC_011761	GTGCC	2	10	147913	147922	0 %	20 %	40 %	40 %	218667774
107	NC_011761	CGGCG	2	10	148477	148486	0 %	0 %	60 %	40 %	218665719
108	NC_011761	GCTGA	2	10	150155	150164	20 %	20 %	40 %	20 %	218666720
109	NC_011761	GTGTG	2	10	150167	150176	0 %	40 %	60 %	0 %	218666720
110	NC_011761	GCCCA	2	10	150631	150640	20 %	0 %	20 %	60 %	218666720
111	NC_011761	GCCCA	2	10	150649	150658	20 %	0 %	20 %	60 %	218666720
112	NC_011761	CGGCG	2	10	151828	151837	0 %	0 %	60 %	40 %	218666386
113	NC_011761	GGACC	2	10	151957	151966	20 %	0 %	40 %	40 %	218666386
114	NC_011761	GCTTC	2	10	152305	152314	0 %	40 %	20 %	40 %	218666386
115	NC_011761	AGGCG	2	10	153800	153809	20 %	0 %	60 %	20 %	218665721
116	NC_011761	CATCC	2	10	160140	160149	20 %	20 %	0 %	60 %	218665149
117	NC_011761	CCCGG	2	10	161248	161257	0 %	0 %	40 %	60 %	218668163
118	NC_011761	CGGCG	2	10	162264	162273	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011761	ACATG	2	10	162281	162290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011761	GCGCG	2	10	164675	164684	0 %	0 %	60 %	40 %	218667563
121	NC_011761	GGAGC	2	10	164973	164982	20 %	0 %	60 %	20 %	218667563
122	NC_011761	GGCTG	2	10	165838	165847	0 %	20 %	60 %	20 %	218665857
123	NC_011761	GGGAC	2	10	165926	165935	20 %	0 %	60 %	20 %	218665857
124	NC_011761	ATGCC	2	10	165937	165946	20 %	20 %	20 %	40 %	218665857
125	NC_011761	GCCCT	2	10	166168	166177	0 %	20 %	20 %	60 %	218665649
126	NC_011761	TGGAC	2	10	167792	167801	20 %	20 %	40 %	20 %	218667372
127	NC_011761	ATCCC	2	10	167846	167855	20 %	20 %	0 %	60 %	218667372
128	NC_011761	GCATC	2	10	168306	168315	20 %	20 %	20 %	40 %	218667372
129	NC_011761	GCTTC	2	10	169546	169555	0 %	40 %	20 %	40 %	218666269
130	NC_011761	CCAGG	2	10	170398	170407	20 %	0 %	40 %	40 %	218666000
131	NC_011761	GTTTG	2	10	174427	174436	0 %	60 %	40 %	0 %	218665793
132	NC_011761	GATCA	2	10	177448	177457	40 %	20 %	20 %	20 %	218665590
133	NC_011761	TTTCG	2	10	178251	178260	0 %	60 %	20 %	20 %	218665590
134	NC_011761	CGGCG	2	10	182029	182038	0 %	0 %	60 %	40 %	218667206
135	NC_011761	GCCCA	2	10	182632	182641	20 %	0 %	20 %	60 %	218665844
136	NC_011761	GGGCA	2	10	183514	183523	20 %	0 %	60 %	20 %	218665584
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243	NC_011761	GTCAA	2	10	336503	336512	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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