MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 6124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	GGAA	2	8	1831	1838	50 %	0 %	50 %	0 %	218666274
2	NC_011761	CTGC	2	8	1856	1863	0 %	25 %	25 %	50 %	218666274
3	NC_011761	ATCT	2	8	3491	3498	25 %	50 %	0 %	25 %	218665824
4	NC_011761	GACG	2	8	3721	3728	25 %	0 %	50 %	25 %	218665824
5	NC_011761	GGGT	2	8	4182	4189	0 %	25 %	75 %	0 %	218665824
6	NC_011761	TGGC	2	8	5191	5198	0 %	25 %	50 %	25 %	218667844
7	NC_011761	GGCT	2	8	5968	5975	0 %	25 %	50 %	25 %	218667844
8	NC_011761	CGTG	2	8	6643	6650	0 %	25 %	50 %	25 %	218667844
9	NC_011761	GCTG	2	8	6909	6916	0 %	25 %	50 %	25 %	218667844
10	NC_011761	ACCC	2	8	7169	7176	25 %	0 %	0 %	75 %	218667844
11	NC_011761	CCGG	2	8	7399	7406	0 %	0 %	50 %	50 %	218667844
12	NC_011761	GACC	2	8	7599	7606	25 %	0 %	25 %	50 %	218667844
13	NC_011761	GCGG	2	8	7699	7706	0 %	0 %	75 %	25 %	218667844
14	NC_011761	CCGC	2	8	8211	8218	0 %	0 %	25 %	75 %	218667844
15	NC_011761	CAGT	2	8	8251	8258	25 %	25 %	25 %	25 %	218667844
16	NC_011761	TATT	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	218668121
17	NC_011761	GCAC	2	8	9598	9605	25 %	0 %	25 %	50 %	218668121
18	NC_011761	CCTG	2	8	11137	11144	0 %	25 %	25 %	50 %	218665167
19	NC_011761	CCAG	2	8	11406	11413	25 %	0 %	25 %	50 %	218665167
20	NC_011761	CTTT	2	8	11516	11523	0 %	75 %	0 %	25 %	218665167
21	NC_011761	ATGG	2	8	11525	11532	25 %	25 %	50 %	0 %	218665167
22	NC_011761	GGTT	2	8	11622	11629	0 %	50 %	50 %	0 %	218665167
23	NC_011761	CGGT	2	8	11853	11860	0 %	25 %	50 %	25 %	218665167
24	NC_011761	GGAC	2	8	12052	12059	25 %	0 %	50 %	25 %	218665167
25	NC_011761	ACTG	2	8	12521	12528	25 %	25 %	25 %	25 %	218667234
26	NC_011761	CCGT	2	8	12729	12736	0 %	25 %	25 %	50 %	218665509
27	NC_011761	CCGC	2	8	14015	14022	0 %	0 %	25 %	75 %	218665026
28	NC_011761	GCGG	2	8	14028	14035	0 %	0 %	75 %	25 %	218665026
29	NC_011761	CGGA	2	8	14065	14072	25 %	0 %	50 %	25 %	218665026
30	NC_011761	TCGC	2	8	14352	14359	0 %	25 %	25 %	50 %	218665026
31	NC_011761	AGAC	2	8	14785	14792	50 %	0 %	25 %	25 %	218665635
32	NC_011761	ACCG	2	8	14991	14998	25 %	0 %	25 %	50 %	218665635
33	NC_011761	GCAG	2	8	15483	15490	25 %	0 %	50 %	25 %	218666462
34	NC_011761	GCGG	2	8	15812	15819	0 %	0 %	75 %	25 %	218667808
35	NC_011761	GGTA	2	8	16060	16067	25 %	25 %	50 %	0 %	218667808
36	NC_011761	GGCA	2	8	16996	17003	25 %	0 %	50 %	25 %	218667808
37	NC_011761	CGGC	2	8	17386	17393	0 %	0 %	50 %	50 %	218667808
38	NC_011761	CGAT	2	8	18318	18325	25 %	25 %	25 %	25 %	218665289
39	NC_011761	TCCA	2	8	18480	18487	25 %	25 %	0 %	50 %	218665289
40	NC_011761	TGGA	2	8	18960	18967	25 %	25 %	50 %	0 %	218666611
41	NC_011761	CAGG	2	8	19400	19407	25 %	0 %	50 %	25 %	218666611
42	NC_011761	GTCC	2	8	19478	19485	0 %	25 %	25 %	50 %	218666611
43	NC_011761	CCAG	2	8	19513	19520	25 %	0 %	25 %	50 %	218666611
44	NC_011761	CCGA	2	8	19691	19698	25 %	0 %	25 %	50 %	218666611
45	NC_011761	CGGT	2	8	19713	19720	0 %	25 %	50 %	25 %	218666611
46	NC_011761	ACCT	2	8	19780	19787	25 %	25 %	0 %	50 %	218666415
47	NC_011761	ATGA	2	8	20768	20775	50 %	25 %	25 %	0 %	218666415
48	NC_011761	ACGC	2	8	20883	20890	25 %	0 %	25 %	50 %	218667290
49	NC_011761	TGTC	2	8	21122	21129	0 %	50 %	25 %	25 %	218667290
50	NC_011761	AGCC	2	8	21491	21498	25 %	0 %	25 %	50 %	218665976
51	NC_011761	AAAG	2	8	21744	21751	75 %	0 %	25 %	0 %	218665976
52	NC_011761	TGGT	2	8	22448	22455	0 %	50 %	50 %	0 %	218666805
53	NC_011761	GGCC	2	8	22788	22795	0 %	0 %	50 %	50 %	218666805
54	NC_011761	TGCC	2	8	22934	22941	0 %	25 %	25 %	50 %	218666805
55	NC_011761	ATGG	2	8	23543	23550	25 %	25 %	50 %	0 %	218666805
56	NC_011761	GTCG	2	8	23607	23614	0 %	25 %	50 %	25 %	218667699
57	NC_011761	GCAG	2	8	23621	23628	25 %	0 %	50 %	25 %	218667699
58	NC_011761	GGCG	2	8	24599	24606	0 %	0 %	75 %	25 %	218668036
59	NC_011761	GACG	2	8	26126	26133	25 %	0 %	50 %	25 %	218668036
60	NC_011761	TGCG	2	8	26782	26789	0 %	25 %	50 %	25 %	218665148
61	NC_011761	CGCC	2	8	26993	27000	0 %	0 %	25 %	75 %	218665148
62	NC_011761	GGCG	3	12	27754	27765	0 %	0 %	75 %	25 %	218665148
63	NC_011761	TCCA	2	8	28158	28165	25 %	25 %	0 %	50 %	218666690
64	NC_011761	TCAG	2	8	28290	28297	25 %	25 %	25 %	25 %	218666690
65	NC_011761	GCGT	2	8	28329	28336	0 %	25 %	50 %	25 %	218666690
66	NC_011761	CGAA	2	8	28414	28421	50 %	0 %	25 %	25 %	218666690
67	NC_011761	TCGG	2	8	28620	28627	0 %	25 %	50 %	25 %	218666690
68	NC_011761	CAAA	2	8	29329	29336	75 %	0 %	0 %	25 %	218666690
69	NC_011761	TTTG	2	8	29682	29689	0 %	75 %	25 %	0 %	218666690
70	NC_011761	CGCC	2	8	30221	30228	0 %	0 %	25 %	75 %	218666460
71	NC_011761	CAGG	2	8	30418	30425	25 %	0 %	50 %	25 %	218666460
72	NC_011761	AACC	2	8	30547	30554	50 %	0 %	0 %	50 %	218666460
73	NC_011761	AGGC	2	8	30614	30621	25 %	0 %	50 %	25 %	218666460
74	NC_011761	TATC	2	8	32091	32098	25 %	50 %	0 %	25 %	218667800
75	NC_011761	TGAA	2	8	32449	32456	50 %	25 %	25 %	0 %	218667800
76	NC_011761	CCAA	2	8	32799	32806	50 %	0 %	0 %	50 %	218667800
77	NC_011761	CCAG	2	8	33084	33091	25 %	0 %	25 %	50 %	218666136
78	NC_011761	GATA	2	8	33154	33161	50 %	25 %	25 %	0 %	218666136
79	NC_011761	CGTC	2	8	35094	35101	0 %	25 %	25 %	50 %	218667012
80	NC_011761	GATC	2	8	35748	35755	25 %	25 %	25 %	25 %	218667012
81	NC_011761	CATG	2	8	36580	36587	25 %	25 %	25 %	25 %	218665291
82	NC_011761	GGCC	2	8	37099	37106	0 %	0 %	50 %	50 %	218665291
83	NC_011761	GTGG	2	8	38496	38503	0 %	25 %	75 %	0 %	218665463
84	NC_011761	TTTC	2	8	39269	39276	0 %	75 %	0 %	25 %	218665463
85	NC_011761	CCAG	2	8	39281	39288	25 %	0 %	25 %	50 %	218665463
86	NC_011761	CCAG	2	8	39422	39429	25 %	0 %	25 %	50 %	218665463
87	NC_011761	TGGT	2	8	39451	39458	0 %	50 %	50 %	0 %	218665463
88	NC_011761	CCAA	2	8	39544	39551	50 %	0 %	0 %	50 %	218665463
89	NC_011761	AGGG	2	8	40931	40938	25 %	0 %	75 %	0 %	218665063
90	NC_011761	CTCG	2	8	41735	41742	0 %	25 %	25 %	50 %	218665929
91	NC_011761	GCCT	2	8	41945	41952	0 %	25 %	25 %	50 %	218665929
92	NC_011761	GATG	2	8	42278	42285	25 %	25 %	50 %	0 %	218665460
93	NC_011761	GCCG	2	8	42407	42414	0 %	0 %	50 %	50 %	218665460
94	NC_011761	GGCG	2	8	42890	42897	0 %	0 %	75 %	25 %	218665460
95	NC_011761	AGAC	2	8	42918	42925	50 %	0 %	25 %	25 %	218665460
96	NC_011761	TGGA	2	8	43829	43836	25 %	25 %	50 %	0 %	218665640
97	NC_011761	GCCA	2	8	44195	44202	25 %	0 %	25 %	50 %	218665640
98	NC_011761	CGCC	2	8	44283	44290	0 %	0 %	25 %	75 %	218665640
99	NC_011761	CAGG	2	8	44425	44432	25 %	0 %	50 %	25 %	218665640
100	NC_011761	CAGC	2	8	44494	44501	25 %	0 %	25 %	50 %	218665640
101	NC_011761	GCAA	2	8	44747	44754	50 %	0 %	25 %	25 %	218665640
102	NC_011761	CGGC	2	8	46301	46308	0 %	0 %	50 %	50 %	218667680
103	NC_011761	CCCT	2	8	46846	46853	0 %	25 %	0 %	75 %	218667680
104	NC_011761	ACCA	2	8	47704	47711	50 %	0 %	0 %	50 %	218665248
105	NC_011761	CAGA	2	8	48456	48463	50 %	0 %	25 %	25 %	218667788
106	NC_011761	CACC	2	8	48773	48780	25 %	0 %	0 %	75 %	218667788
107	NC_011761	GGAT	2	8	48980	48987	25 %	25 %	50 %	0 %	218667082
108	NC_011761	TTGG	2	8	49269	49276	0 %	50 %	50 %	0 %	218667082
109	NC_011761	GCTG	2	8	49425	49432	0 %	25 %	50 %	25 %	218667082
110	NC_011761	GGGC	2	8	51513	51520	0 %	0 %	75 %	25 %	218667437
111	NC_011761	TCGC	2	8	51877	51884	0 %	25 %	25 %	50 %	218665682
112	NC_011761	AGGA	2	8	52633	52640	50 %	0 %	50 %	0 %	218665682
113	NC_011761	TACC	2	8	54009	54016	25 %	25 %	0 %	50 %	218666159
114	NC_011761	TGGT	2	8	54050	54057	0 %	50 %	50 %	0 %	218666159
115	NC_011761	CATT	2	8	54272	54279	25 %	50 %	0 %	25 %	218666159
116	NC_011761	GGCC	2	8	54660	54667	0 %	0 %	50 %	50 %	218666159
117	NC_011761	CCGC	2	8	54871	54878	0 %	0 %	25 %	75 %	218666169
118	NC_011761	TGGC	2	8	55210	55217	0 %	25 %	50 %	25 %	218666169
119	NC_011761	CAGG	2	8	55241	55248	25 %	0 %	50 %	25 %	218666169
120	NC_011761	GCCG	2	8	55965	55972	0 %	0 %	50 %	50 %	218667976
121	NC_011761	CCGC	2	8	56296	56303	0 %	0 %	25 %	75 %	218666833
122	NC_011761	CAGC	2	8	56643	56650	25 %	0 %	25 %	50 %	218666833
123	NC_011761	GACA	2	8	56760	56767	50 %	0 %	25 %	25 %	218666833
124	NC_011761	AGGG	2	8	56800	56807	25 %	0 %	75 %	0 %	218666833
125	NC_011761	GCCA	2	8	57524	57531	25 %	0 %	25 %	50 %	218667981
126	NC_011761	GTAT	2	8	58092	58099	25 %	50 %	25 %	0 %	218666395
127	NC_011761	GCCT	2	8	59379	59386	0 %	25 %	25 %	50 %	218666964
128	NC_011761	GCTG	2	8	60592	60599	0 %	25 %	50 %	25 %	218665171
129	NC_011761	AATC	2	8	61161	61168	50 %	25 %	0 %	25 %	218665171
130	NC_011761	GACG	2	8	61746	61753	25 %	0 %	50 %	25 %	218667202
131	NC_011761	CTGG	2	8	61814	61821	0 %	25 %	50 %	25 %	218667202
132	NC_011761	GCCC	2	8	61847	61854	0 %	0 %	25 %	75 %	218667202
133	NC_011761	GCGG	3	12	62199	62210	0 %	0 %	75 %	25 %	218666356
134	NC_011761	CACC	2	8	63599	63606	25 %	0 %	0 %	75 %	218665092
135	NC_011761	TCAG	2	8	63748	63755	25 %	25 %	25 %	25 %	218665092
136	NC_011761	CGGA	2	8	63976	63983	25 %	0 %	50 %	25 %	218665092
137	NC_011761	GCCT	2	8	65056	65063	0 %	25 %	25 %	50 %	218666868
138	NC_011761	CGTC	2	8	65627	65634	0 %	25 %	25 %	50 %	218666774
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