MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 3942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	ATT	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011761	GAT	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011761	TCC	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011761	CAG	2	6	4735	4740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011761	ATT	2	6	8300	8305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011761	GTA	2	6	8359	8364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011761	CGG	2	6	12542	12547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011761	CCG	2	6	12554	12559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011761	TTC	2	6	12623	12628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011761	TTC	2	6	13165	13170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011761	CCG	2	6	20779	20784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011761	AAT	2	6	20836	20841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011761	AGC	2	6	24220	24225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011761	AGG	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011761	GCC	2	6	28029	28034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011761	CGT	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011761	TGC	2	6	31338	31343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011761	TGA	2	6	31498	31503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011761	TGC	2	6	38335	38340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011761	CCG	2	6	40056	40061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011761	GCG	2	6	45245	45250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011761	GGC	2	6	45346	45351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011761	CCG	2	6	45364	45369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011761	GAT	2	6	45439	45444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011761	GCA	2	6	45464	45469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011761	GAT	2	6	45502	45507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011761	TAT	2	6	45522	45527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011761	ACA	2	6	45729	45734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011761	CAG	2	6	45767	45772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011761	GTG	2	6	46945	46950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011761	CCG	2	6	50750	50755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011761	ATG	2	6	51721	51726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011761	CGC	2	6	51760	51765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011761	TGA	2	6	52889	52894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011761	CTC	2	6	53951	53956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011761	CGC	2	6	55997	56002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011761	ATC	2	6	56028	56033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011761	CCG	2	6	56043	56048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011761	TTC	2	6	56058	56063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011761	GAA	2	6	56088	56093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011761	ATC	2	6	56107	56112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011761	CTC	2	6	57177	57182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011761	GCG	2	6	58015	58020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011761	CAA	2	6	58052	58057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011761	TTG	2	6	58395	58400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011761	GCG	2	6	62849	62854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011761	GGC	2	6	62872	62877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011761	CGC	2	6	64050	64055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011761	GGA	2	6	71661	71666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011761	GCG	2	6	71698	71703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011761	CGC	2	6	71736	71741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011761	GCA	2	6	71761	71766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011761	CGC	2	6	71830	71835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011761	ATG	2	6	72230	72235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011761	CGC	2	6	72236	72241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011761	CCG	3	9	75165	75173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011761	CGC	2	6	75202	75207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011761	GCG	2	6	75291	75296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011761	GAA	2	6	77939	77944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011761	CGG	2	6	83521	83526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011761	AGG	2	6	83527	83532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011761	GCC	2	6	83691	83696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011761	ATC	2	6	83697	83702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011761	GCC	2	6	83703	83708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011761	GGT	2	6	83841	83846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011761	GGT	2	6	83902	83907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011761	ATA	2	6	83950	83955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011761	AGC	2	6	84010	84015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011761	CCG	2	6	84049	84054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011761	CCA	2	6	84058	84063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011761	GAA	2	6	84223	84228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011761	ATG	2	6	84242	84247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011761	CAG	2	6	84339	84344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011761	TGT	2	6	84473	84478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011761	TGT	2	6	84535	84540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011761	CAT	2	6	84575	84580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011761	AAC	2	6	85662	85667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011761	AGG	2	6	86511	86516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011761	AAG	2	6	86557	86562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011761	TCG	2	6	86597	86602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011761	CCT	2	6	86988	86993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011761	ATT	2	6	88087	88092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011761	CAG	2	6	88105	88110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011761	TGA	2	6	88226	88231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011761	CAC	2	6	88272	88277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011761	GAA	2	6	88411	88416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011761	TGG	2	6	88419	88424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011761	CGC	2	6	88464	88469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011761	TGG	2	6	88501	88506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011761	TCG	2	6	89130	89135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011761	TCA	2	6	89142	89147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011761	ACG	2	6	89223	89228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011761	ACT	2	6	90129	90134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011761	TGC	2	6	90201	90206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011761	CAG	2	6	92507	92512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011761	TAT	2	6	92555	92560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011761	CAT	2	6	92574	92579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011761	GAG	2	6	92614	92619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011761	CCG	2	6	93073	93078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011761	GCC	2	6	96232	96237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011761	AGC	2	6	96260	96265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011761	GGC	2	6	96575	96580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011761	TGC	2	6	96582	96587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011761	TGT	2	6	99966	99971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011761	CCG	2	6	102856	102861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011761	TTC	2	6	102899	102904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011761	CCG	2	6	102944	102949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011761	ACC	2	6	102974	102979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011761	TTA	2	6	103017	103022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011761	CGG	2	6	103074	103079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011761	GGT	2	6	103210	103215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011761	TGT	2	6	103248	103253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011761	CAG	3	9	103280	103288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011761	GTG	2	6	103310	103315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011761	GCC	2	6	103363	103368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011761	TGG	3	9	103577	103585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011761	TGG	2	6	103667	103672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011761	CGG	2	6	103682	103687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011761	CAG	2	6	103702	103707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011761	GCC	2	6	103779	103784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011761	GCT	2	6	103869	103874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011761	GGT	2	6	103875	103880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011761	TTC	2	6	103897	103902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011761	TGG	2	6	103955	103960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011761	TCC	2	6	103973	103978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011761	TGG	3	9	104039	104047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011761	CAT	2	6	104055	104060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011761	CGT	2	6	104061	104066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011761	GCT	2	6	104118	104123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011761	CGA	2	6	104162	104167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011761	TGG	2	6	104171	104176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011761	CGG	2	6	104202	104207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011761	TGG	2	6	104210	104215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011761	TGC	2	6	104258	104263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011761	TGG	2	6	104270	104275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011761	TGG	2	6	104348	104353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011761	CGG	2	6	104652	104657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011761	TGT	2	6	104660	104665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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