MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 40716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	TCT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218667577
2	NC_011761	TCG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667577
3	NC_011761	CCG	2	6	246	251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667577
4	NC_011761	GCT	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667577
5	NC_011761	GCC	2	6	383	388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667577
6	NC_011761	CCG	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667577
7	NC_011761	CAG	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667577
8	NC_011761	CGT	2	6	502	507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667577
9	NC_011761	ACG	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667577
10	NC_011761	ATG	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667577
11	NC_011761	CAG	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667577
12	NC_011761	ACT	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667577
13	NC_011761	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667577
14	NC_011761	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667577
15	NC_011761	CCG	2	6	814	819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667577
16	NC_011761	GCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667577
17	NC_011761	ACC	2	6	920	925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218667577
18	NC_011761	GAG	2	6	971	976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667577
19	NC_011761	AGG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667577
20	NC_011761	AAT	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218667577
21	NC_011761	ATC	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667577
22	NC_011761	GAC	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666274
23	NC_011761	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218666274
24	NC_011761	ATG	2	6	1456	1461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666274
25	NC_011761	CTG	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666274
26	NC_011761	ACA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218666274
27	NC_011761	CGG	2	6	1549	1554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666274
28	NC_011761	GCC	2	6	1558	1563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666274
29	NC_011761	TTA	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218666274
30	NC_011761	GCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666274
31	NC_011761	TCG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666274
32	NC_011761	CAG	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666274
33	NC_011761	CGG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666274
34	NC_011761	CGC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218666274
35	NC_011761	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666274
36	NC_011761	CGG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666274
37	NC_011761	TGG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218666274
38	NC_011761	CTG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666274
39	NC_011761	TGC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218666274
40	NC_011761	CAC	2	6	2153	2158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218666274
41	NC_011761	GGC	2	6	2184	2189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218666274
42	NC_011761	GCA	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218666274
43	NC_011761	ATG	3	9	2234	2242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218666274
44	NC_011761	TTC	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665824
45	NC_011761	AGT	2	6	2362	2367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665824
46	NC_011761	CGG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
47	NC_011761	CAT	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
48	NC_011761	TCA	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
49	NC_011761	TGC	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665824
50	NC_011761	GGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665824
51	NC_011761	CGG	2	6	2572	2577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
52	NC_011761	GGT	2	6	2599	2604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665824
53	NC_011761	ATC	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
54	NC_011761	CTG	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665824
55	NC_011761	GGA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665824
56	NC_011761	GCA	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665824
57	NC_011761	GTC	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665824
58	NC_011761	CAA	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218665824
59	NC_011761	GGC	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
60	NC_011761	CAT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
61	NC_011761	TTC	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665824
62	NC_011761	TCC	2	6	3284	3289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218665824
63	NC_011761	CGC	2	6	3346	3351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
64	NC_011761	TCG	2	6	3357	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218665824
65	NC_011761	GCG	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
66	NC_011761	GCC	2	6	3383	3388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
67	NC_011761	CGG	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
68	NC_011761	CGC	2	6	3410	3415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
69	NC_011761	GGC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
70	NC_011761	CGA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665824
71	NC_011761	TCA	3	9	3711	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
72	NC_011761	GCC	2	6	3826	3831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
73	NC_011761	AAG	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218665824
74	NC_011761	AGG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665824
75	NC_011761	GCC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
76	NC_011761	CGG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
77	NC_011761	ATG	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218665824
78	NC_011761	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218665824
79	NC_011761	TGG	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218665824
80	NC_011761	CAT	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218665824
81	NC_011761	TTC	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218665824
82	NC_011761	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
83	NC_011761	ACC	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218665824
84	NC_011761	CCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
85	NC_011761	CGC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218665824
86	NC_011761	CGA	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218665824
87	NC_011761	GAG	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218665824
88	NC_011761	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218667844
89	NC_011761	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
90	NC_011761	GCC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
91	NC_011761	CTG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667844
92	NC_011761	GGC	2	6	5041	5046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
93	NC_011761	GGT	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
94	NC_011761	GCC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
95	NC_011761	GGA	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667844
96	NC_011761	GCG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
97	NC_011761	ATT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218667844
98	NC_011761	GAA	2	6	5648	5653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667844
99	NC_011761	CGC	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
100	NC_011761	TGG	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
101	NC_011761	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667844
102	NC_011761	TGG	2	6	5949	5954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
103	NC_011761	CAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667844
104	NC_011761	GGT	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
105	NC_011761	AGC	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
106	NC_011761	AGG	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218667844
107	NC_011761	CGA	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
108	NC_011761	CGG	2	6	6229	6234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
109	NC_011761	GTG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
110	NC_011761	CGG	2	6	6447	6452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
111	NC_011761	CGG	2	6	6474	6479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
112	NC_011761	TAT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218667844
113	NC_011761	GAA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667844
114	NC_011761	CCG	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
115	NC_011761	CGA	2	6	6616	6621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
116	NC_011761	CGC	2	6	6664	6669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
117	NC_011761	GCG	2	6	6717	6722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
118	NC_011761	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
119	NC_011761	GAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667844
120	NC_011761	TCA	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218667844
121	NC_011761	GAA	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218667844
122	NC_011761	TAT	2	6	6812	6817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218667844
123	NC_011761	GCC	2	6	6962	6967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
124	NC_011761	CCG	2	6	7263	7268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
125	NC_011761	GCA	2	6	7303	7308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
126	NC_011761	CTG	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667844
127	NC_011761	GCA	2	6	7341	7346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218667844
128	NC_011761	CCG	2	6	7350	7355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218667844
129	NC_011761	GGC	2	6	7384	7389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667844
130	NC_011761	TGG	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
131	NC_011761	TGG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667844
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255	NC_011761	GTA	2	6	17177	17182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667808
256	NC_011761	CCT	2	6	17215	17220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218667808
257	NC_011761	TGA	2	6	17254	17259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218667808
258	NC_011761	CTG	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667808
259	NC_011761	GGT	2	6	17372	17377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218667808
260	NC_011761	GTC	2	6	17450	17455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218667808
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262	NC_011761	GGC	2	6	17572	17577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218667808
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