MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	GGAAA	2	10	1560	1569	60 %	0 %	40 %	0 %	218534719
2	NC_011760	GCTTA	2	10	2592	2601	20 %	40 %	20 %	20 %	218534722
3	NC_011760	AAACC	2	10	3126	3135	60 %	0 %	0 %	40 %	218534722
4	NC_011760	GAGCC	2	10	3707	3716	20 %	0 %	40 %	40 %	218534722
5	NC_011760	TTGGC	2	10	4497	4506	0 %	40 %	40 %	20 %	218534723
6	NC_011760	TTCCC	2	10	5952	5961	0 %	40 %	0 %	60 %	218534725
7	NC_011760	TGGCA	2	10	7022	7031	20 %	20 %	40 %	20 %	218534726
8	NC_011760	CCCCG	2	10	9671	9680	0 %	0 %	20 %	80 %	218534731
9	NC_011760	TGGCG	2	10	10861	10870	0 %	20 %	60 %	20 %	218534733
10	NC_011760	GGTGC	2	10	10933	10942	0 %	20 %	60 %	20 %	218534733
11	NC_011760	CCCCG	2	10	11035	11044	0 %	0 %	20 %	80 %	218534733
12	NC_011760	CGATC	2	10	11050	11059	20 %	20 %	20 %	40 %	218534733
13	NC_011760	CGCGG	2	10	11752	11761	0 %	0 %	60 %	40 %	218534734
14	NC_011760	CCGAT	2	10	11877	11886	20 %	20 %	20 %	40 %	218534734
15	NC_011760	GCCCT	2	10	12018	12027	0 %	20 %	20 %	60 %	218534735
16	NC_011760	CGAGA	2	10	12347	12356	40 %	0 %	40 %	20 %	218534736
17	NC_011760	GGGCC	2	10	13330	13339	0 %	0 %	60 %	40 %	218534737
18	NC_011760	GGCGC	2	10	14355	14364	0 %	0 %	60 %	40 %	218534740
19	NC_011760	CATCG	2	10	14884	14893	20 %	20 %	20 %	40 %	218534740
20	NC_011760	TGAAC	2	10	16433	16442	40 %	20 %	20 %	20 %	218534741

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.