MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	TGGC	2	8	566	573	0 %	25 %	50 %	25 %	218534718
2	NC_011760	CGGC	2	8	824	831	0 %	0 %	50 %	50 %	218534718
3	NC_011760	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	218534721
4	NC_011760	CGAA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	218534722
5	NC_011760	CTAA	2	8	4256	4263	50 %	25 %	0 %	25 %	218534723
6	NC_011760	TCAA	2	8	4426	4433	50 %	25 %	0 %	25 %	218534723
7	NC_011760	ACCT	2	8	4659	4666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011760	ATTG	2	8	5186	5193	25 %	50 %	25 %	0 %	218534724
9	NC_011760	GGGC	2	8	5216	5223	0 %	0 %	75 %	25 %	218534724
10	NC_011760	GTTC	2	8	5339	5346	0 %	50 %	25 %	25 %	218534724
11	NC_011760	GCGG	2	8	5439	5446	0 %	0 %	75 %	25 %	218534724
12	NC_011760	CTCA	2	8	5457	5464	25 %	25 %	0 %	50 %	218534724
13	NC_011760	CAGC	2	8	5520	5527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011760	GCCG	2	8	5853	5860	0 %	0 %	50 %	50 %	218534725
15	NC_011760	CAAT	2	8	6172	6179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011760	CGAT	2	8	6648	6655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011760	TGGT	2	8	7085	7092	0 %	50 %	50 %	0 %	218534726
18	NC_011760	CAAG	2	8	7110	7117	50 %	0 %	25 %	25 %	218534726
19	NC_011760	GCCC	2	8	7519	7526	0 %	0 %	25 %	75 %	218534727
20	NC_011760	CCGG	2	8	7632	7639	0 %	0 %	50 %	50 %	218534727
21	NC_011760	CTGG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	218534727
22	NC_011760	TGCC	2	8	8327	8334	0 %	25 %	25 %	50 %	218534727
23	NC_011760	GGCG	2	8	8796	8803	0 %	0 %	75 %	25 %	218534729
24	NC_011760	GCCC	2	8	9133	9140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011760	TCCC	2	8	9463	9470	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_011760	CGCC	2	8	9601	9608	0 %	0 %	25 %	75 %	218534731
27	NC_011760	GCCG	2	8	9632	9639	0 %	0 %	50 %	50 %	218534731
28	NC_011760	CCGG	2	8	9871	9878	0 %	0 %	50 %	50 %	218534731
29	NC_011760	GAAG	2	8	11149	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	218534733
30	NC_011760	GCCG	2	8	11492	11499	0 %	0 %	50 %	50 %	218534734
31	NC_011760	CCCT	2	8	12480	12487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_011760	CCTG	2	8	13249	13256	0 %	25 %	25 %	50 %	218534737
33	NC_011760	GCCG	2	8	13515	13522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011760	GGCT	2	8	13627	13634	0 %	25 %	50 %	25 %	218534738
35	NC_011760	TCCG	2	8	14871	14878	0 %	25 %	25 %	50 %	218534740
36	NC_011760	GCCG	2	8	14922	14929	0 %	0 %	50 %	50 %	218534740
37	NC_011760	GCAA	2	8	15003	15010	50 %	0 %	25 %	25 %	218534740
38	NC_011760	CCCG	2	8	15120	15127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_011760	GGCG	2	8	15227	15234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011760	GGGT	2	8	15306	15313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011760	TGGA	2	8	17041	17048	25 %	25 %	50 %	0 %	218534741
42	NC_011760	ATCG	2	8	17378	17385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011760	GCTG	2	8	17760	17767	0 %	25 %	50 %	25 %	218534742
44	NC_011760	GGTC	2	8	18015	18022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011760	GATC	2	8	18329	18336	25 %	25 %	25 %	25 %	218534744
46	NC_011760	TCGC	2	8	18742	18749	0 %	25 %	25 %	50 %	218534746
47	NC_011760	TCCA	2	8	19120	19127	25 %	25 %	0 %	50 %	218534748
48	NC_011760	GCCG	2	8	19474	19481	0 %	0 %	50 %	50 %	218534748
49	NC_011760	TCGT	2	8	19527	19534	0 %	50 %	25 %	25 %	218534748
50	NC_011760	CTGC	2	8	19702	19709	0 %	25 %	25 %	50 %	218534749
51	NC_011760	GGTG	2	8	20618	20625	0 %	25 %	75 %	0 %	218534752
52	NC_011760	CTGC	2	8	20776	20783	0 %	25 %	25 %	50 %	218534753
53	NC_011760	GCCG	2	8	21503	21510	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753
54	NC_011760	GCCG	2	8	21716	21723	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753
55	NC_011760	CCGG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753
56	NC_011760	GCGG	2	8	22369	22376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.