MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	TGGC	2	8	566	573	0 %	25 %	50 %	25 %	218534718
2	NC_011760	CGGC	2	8	824	831	0 %	0 %	50 %	50 %	218534718
3	NC_011760	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	218534721
4	NC_011760	CGAA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	218534722
5	NC_011760	CTAA	2	8	4256	4263	50 %	25 %	0 %	25 %	218534723
6	NC_011760	TCAA	2	8	4426	4433	50 %	25 %	0 %	25 %	218534723
7	NC_011760	ATTG	2	8	5186	5193	25 %	50 %	25 %	0 %	218534724
8	NC_011760	GGGC	2	8	5216	5223	0 %	0 %	75 %	25 %	218534724
9	NC_011760	GTTC	2	8	5339	5346	0 %	50 %	25 %	25 %	218534724
10	NC_011760	GCGG	2	8	5439	5446	0 %	0 %	75 %	25 %	218534724
11	NC_011760	CTCA	2	8	5457	5464	25 %	25 %	0 %	50 %	218534724
12	NC_011760	GCCG	2	8	5853	5860	0 %	0 %	50 %	50 %	218534725
13	NC_011760	TGGT	2	8	7085	7092	0 %	50 %	50 %	0 %	218534726
14	NC_011760	CAAG	2	8	7110	7117	50 %	0 %	25 %	25 %	218534726
15	NC_011760	GCCC	2	8	7519	7526	0 %	0 %	25 %	75 %	218534727
16	NC_011760	CCGG	2	8	7632	7639	0 %	0 %	50 %	50 %	218534727
17	NC_011760	CTGG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	218534727
18	NC_011760	TGCC	2	8	8327	8334	0 %	25 %	25 %	50 %	218534727
19	NC_011760	GGCG	2	8	8796	8803	0 %	0 %	75 %	25 %	218534729
20	NC_011760	CGCC	2	8	9601	9608	0 %	0 %	25 %	75 %	218534731
21	NC_011760	GCCG	2	8	9632	9639	0 %	0 %	50 %	50 %	218534731
22	NC_011760	CCGG	2	8	9871	9878	0 %	0 %	50 %	50 %	218534731
23	NC_011760	GAAG	2	8	11149	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	218534733
24	NC_011760	GCCG	2	8	11492	11499	0 %	0 %	50 %	50 %	218534734
25	NC_011760	CCTG	2	8	13249	13256	0 %	25 %	25 %	50 %	218534737
26	NC_011760	GGCT	2	8	13627	13634	0 %	25 %	50 %	25 %	218534738
27	NC_011760	TCCG	2	8	14871	14878	0 %	25 %	25 %	50 %	218534740
28	NC_011760	GCCG	2	8	14922	14929	0 %	0 %	50 %	50 %	218534740
29	NC_011760	GCAA	2	8	15003	15010	50 %	0 %	25 %	25 %	218534740
30	NC_011760	TGGA	2	8	17041	17048	25 %	25 %	50 %	0 %	218534741
31	NC_011760	GCTG	2	8	17760	17767	0 %	25 %	50 %	25 %	218534742
32	NC_011760	GATC	2	8	18329	18336	25 %	25 %	25 %	25 %	218534744
33	NC_011760	TCGC	2	8	18742	18749	0 %	25 %	25 %	50 %	218534746
34	NC_011760	TCCA	2	8	19120	19127	25 %	25 %	0 %	50 %	218534748
35	NC_011760	GCCG	2	8	19474	19481	0 %	0 %	50 %	50 %	218534748
36	NC_011760	TCGT	2	8	19527	19534	0 %	50 %	25 %	25 %	218534748
37	NC_011760	CTGC	2	8	19702	19709	0 %	25 %	25 %	50 %	218534749
38	NC_011760	GGTG	2	8	20618	20625	0 %	25 %	75 %	0 %	218534752
39	NC_011760	CTGC	2	8	20776	20783	0 %	25 %	25 %	50 %	218534753
40	NC_011760	GCCG	2	8	21503	21510	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753
41	NC_011760	GCCG	2	8	21716	21723	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753
42	NC_011760	CCGG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	50 %	50 %	218534753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.