MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL02

Total Repeats: 337

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011760	TGT	2	6	3	8	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011760	TGA	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011760	GAT	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534718
4	NC_011760	TCC	2	6	362	367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534718
5	NC_011760	CTC	2	6	384	389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534718
6	NC_011760	AGC	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534718
7	NC_011760	GGT	2	6	438	443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534718
8	NC_011760	CCG	2	6	472	477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534718
9	NC_011760	GGC	2	6	485	490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
10	NC_011760	GCG	2	6	559	564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
11	NC_011760	GGC	2	6	588	593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
12	NC_011760	GCG	4	12	597	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534718
13	NC_011760	CAG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011760	TCA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534719
15	NC_011760	GGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534719
16	NC_011760	CCG	2	6	1377	1382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534719
17	NC_011760	TCG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534719
18	NC_011760	GGA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534720
19	NC_011760	CCT	2	6	1705	1710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534720
20	NC_011760	GCT	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534720
21	NC_011760	GGC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534720
22	NC_011760	TCG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534720
23	NC_011760	CGG	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534720
24	NC_011760	CGG	2	6	2007	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011760	TTG	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011760	GCA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011760	CTT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534721
28	NC_011760	GGT	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534721
29	NC_011760	GAC	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534721
30	NC_011760	GGC	2	6	2266	2271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
31	NC_011760	CGG	2	6	2290	2295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
32	NC_011760	ACG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534721
33	NC_011760	ACA	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534721
34	NC_011760	GCG	3	9	2464	2472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
35	NC_011760	CGG	2	6	2489	2494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534721
36	NC_011760	GAG	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534722
37	NC_011760	GCT	3	9	2664	2672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
38	NC_011760	TCA	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534722
39	NC_011760	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534722
40	NC_011760	AGC	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
41	NC_011760	CGT	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
42	NC_011760	GCT	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
43	NC_011760	CCG	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534722
44	NC_011760	GAC	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
45	NC_011760	CAG	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
46	NC_011760	TTA	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534722
47	NC_011760	AGC	2	6	3361	3366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
48	NC_011760	TGT	2	6	3564	3569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534722
49	NC_011760	AGC	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534722
50	NC_011760	CGG	2	6	3795	3800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534722
51	NC_011760	GTC	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534722
52	NC_011760	GCG	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534722
53	NC_011760	CAT	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011760	CAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011760	GGC	2	6	4164	4169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011760	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011760	TAT	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534723
58	NC_011760	GTC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534723
59	NC_011760	CTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534723
60	NC_011760	TCT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534723
61	NC_011760	AGA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534723
62	NC_011760	CCT	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011760	CAG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011760	ACG	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011760	CGC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011760	TCG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011760	CCG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534724
68	NC_011760	GAT	2	6	5013	5018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534724
69	NC_011760	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534724
70	NC_011760	CTT	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534724
71	NC_011760	CCT	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534724
72	NC_011760	TGT	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218534724
73	NC_011760	TGA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534724
74	NC_011760	ACG	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534724
75	NC_011760	TCG	3	9	5383	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534724
76	NC_011760	CCG	2	6	5558	5563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011760	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011760	CAC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011760	CCA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011760	TCC	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011760	CAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011760	GAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011760	ATC	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534725
84	NC_011760	TGC	2	6	5802	5807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534725
85	NC_011760	CCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534725
86	NC_011760	ACA	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218534725
87	NC_011760	CGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534725
88	NC_011760	GCC	3	9	6010	6018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534725
89	NC_011760	GGT	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011760	CGA	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011760	AGC	2	6	6181	6186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011760	CGC	2	6	6189	6194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011760	ACG	2	6	6234	6239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011760	CCT	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011760	GAA	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011760	GGC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011760	GCA	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011760	ACC	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011760	GGA	2	6	7046	7051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534726
100	NC_011760	CGA	3	9	7053	7061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534726
101	NC_011760	CAG	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534726
102	NC_011760	GCT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534726
103	NC_011760	GCT	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534726
104	NC_011760	TGA	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011760	TTG	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011760	GCG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
107	NC_011760	GCG	2	6	7371	7376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
108	NC_011760	CAT	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534727
109	NC_011760	GAA	2	6	7574	7579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534727
110	NC_011760	CGA	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
111	NC_011760	GTG	2	6	7752	7757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534727
112	NC_011760	CCT	2	6	7813	7818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534727
113	NC_011760	GCC	2	6	7824	7829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
114	NC_011760	GCG	2	6	7903	7908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
115	NC_011760	GCC	2	6	7968	7973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
116	NC_011760	CAG	2	6	8048	8053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
117	NC_011760	GCG	3	9	8077	8085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
118	NC_011760	GCG	3	9	8112	8120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
119	NC_011760	CGC	2	6	8191	8196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
120	NC_011760	GCA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534727
121	NC_011760	CGT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534727
122	NC_011760	CCG	2	6	8265	8270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534727
123	NC_011760	TGA	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534727
124	NC_011760	CTT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534727
125	NC_011760	GGC	2	6	8411	8416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534727
126	NC_011760	CGG	2	6	8561	8566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534728
127	NC_011760	GAT	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534728
128	NC_011760	TGA	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534728
129	NC_011760	CTC	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534729
130	NC_011760	CCG	2	6	8833	8838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534729
131	NC_011760	GAC	2	6	8853	8858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534729
132	NC_011760	GCC	3	9	9150	9158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534730
133	NC_011760	CAT	2	6	9310	9315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534730
134	NC_011760	GCC	2	6	9410	9415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534730
135	NC_011760	CAC	2	6	9418	9423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534730
136	NC_011760	CGC	2	6	9512	9517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
137	NC_011760	GCC	2	6	9548	9553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
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139	NC_011760	GCC	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
140	NC_011760	CGC	2	6	9731	9736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534731
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159	NC_011760	AGG	2	6	11394	11399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011760	CCG	2	6	11400	11405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534734
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239	NC_011760	GTA	2	6	17215	17220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534741
240	NC_011760	CAT	2	6	17223	17228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534741
241	NC_011760	GGC	2	6	17334	17339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_011760	GCA	2	6	17528	17533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534742
243	NC_011760	TCC	2	6	17570	17575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534742
244	NC_011760	TTC	2	6	17686	17691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218534742
245	NC_011760	AAT	2	6	17715	17720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218534742
246	NC_011760	GCC	2	6	17728	17733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534742
247	NC_011760	AGA	2	6	17768	17773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534742
248	NC_011760	AGC	2	6	17801	17806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534742
249	NC_011760	TGA	2	6	17844	17849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534742
250	NC_011760	GCT	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534742
251	NC_011760	ATT	2	6	17889	17894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_011760	GGC	2	6	17915	17920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_011760	GTT	2	6	17977	17982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_011760	GGC	2	6	18085	18090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534743
255	NC_011760	CTC	2	6	18097	18102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534743
256	NC_011760	GCG	2	6	18111	18116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534743
257	NC_011760	TCC	2	6	18209	18214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534743
258	NC_011760	CGA	2	6	18228	18233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534743
259	NC_011760	GCC	2	6	18244	18249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534743
260	NC_011760	CGG	2	6	18284	18289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534743
261	NC_011760	CTC	2	6	18316	18321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534744
262	NC_011760	GCG	2	6	18339	18344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534744
263	NC_011760	CGT	2	6	18401	18406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534744
264	NC_011760	TGA	2	6	18413	18418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534744
265	NC_011760	GCA	2	6	18422	18427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534744
266	NC_011760	CTC	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534745
267	NC_011760	GTC	2	6	18605	18610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534745
268	NC_011760	CGA	2	6	18616	18621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534745
269	NC_011760	CGG	2	6	18640	18645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534745
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273	NC_011760	GGC	2	6	18733	18738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534746
274	NC_011760	TCG	3	9	18794	18802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534746
275	NC_011760	GCT	2	6	18840	18845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534746
276	NC_011760	CGT	2	6	18860	18865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534746
277	NC_011760	CTC	2	6	18886	18891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534747
278	NC_011760	AGT	2	6	18991	18996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534747
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280	NC_011760	GGC	2	6	19081	19086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534747
281	NC_011760	GCA	2	6	19095	19100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534747
282	NC_011760	CGG	2	6	19200	19205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534748
283	NC_011760	CAG	2	6	19243	19248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534748
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288	NC_011760	GCA	2	6	19780	19785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534749
289	NC_011760	AGG	2	6	19798	19803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534749
290	NC_011760	TCG	2	6	19865	19870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534750
291	NC_011760	GTC	2	6	19873	19878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534750
292	NC_011760	GAT	2	6	19933	19938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534750
293	NC_011760	CAC	2	6	19940	19945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534750
294	NC_011760	CGG	2	6	19963	19968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534750
295	NC_011760	CGG	2	6	19989	19994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534750
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298	NC_011760	GCC	2	6	20230	20235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534751
299	NC_011760	CGG	2	6	20261	20266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534751
300	NC_011760	AGC	2	6	20269	20274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534751
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302	NC_011760	AGG	2	6	20333	20338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218534751
303	NC_011760	GCG	3	9	20403	20411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534751
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325	NC_011760	GAA	2	6	21962	21967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218534753
326	NC_011760	CGT	2	6	22081	22086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534753
327	NC_011760	GGC	2	6	22202	22207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534753
328	NC_011760	TCC	2	6	22227	22232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218534753
329	NC_011760	CGC	2	6	22258	22263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534753
330	NC_011760	CGT	2	6	22307	22312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218534753
331	NC_011760	GTC	2	6	22358	22363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_011760	GCG	2	6	22387	22392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534754
333	NC_011760	GAC	2	6	22404	22409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218534754
334	NC_011760	CGG	2	6	22422	22427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218534754
335	NC_011760	TGG	2	6	22429	22434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218534754
336	NC_011760	CCA	2	6	22460	22465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218534754
337	NC_011760	CGC	2	6	22523	22528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218534754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.