MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011758	GAGGC	2	10	16663	16672	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011758	GATGG	2	10	17389	17398	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011758	CGGCT	2	10	18480	18489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011758	GGCAG	2	10	44597	44606	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011758	GCCAT	2	10	45902	45911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011758	GGCAA	2	10	53018	53027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011758	ACCGC	2	10	61384	61393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011758	TCGGG	2	10	64377	64386	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011758	CCTGA	2	10	64528	64537	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011758	CGGGT	2	10	71303	71312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011758	AGCTA	2	10	74727	74736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011758	TAGCT	2	10	75946	75955	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011758	CTGTC	2	10	78620	78629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011758	CGGCG	2	10	79991	80000	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011758	GCCGT	2	10	82275	82284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011758	AGCGG	2	10	90322	90331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011758	AGTCC	2	10	91922	91931	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011758	TCATG	2	10	92781	92790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011758	CGGCT	2	10	93371	93380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011758	CCCGT	2	10	93488	93497	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011758	GGGCC	2	10	95174	95183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011758	CCGAC	2	10	96094	96103	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011758	GCCCG	2	10	98315	98324	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011758	TCGGC	2	10	98972	98981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011758	CCCTA	2	10	99710	99719	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_011758	AGGGG	2	10	105768	105777	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011758	GGGGA	2	10	105887	105896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011758	GCGAC	2	10	106117	106126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011758	AAGCT	2	10	106935	106944	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011758	TAGCT	2	10	108155	108164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011758	CCAGG	2	10	115044	115053	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011758	TCGGG	2	10	115241	115250	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011758	GAGGG	2	10	115932	115941	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011758	GCCCT	2	10	115966	115975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_011758	CTCCC	2	10	116220	116229	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_011758	ACGGC	2	10	120028	120037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011758	CGGTC	2	10	138519	138528	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011758	GAGCC	2	10	141445	141454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011758	CCCCT	2	10	141464	141473	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
40	NC_011758	CGGCT	2	10	142821	142830	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011758	GCTCG	2	10	146990	146999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011758	CCGAC	2	10	154546	154555	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_011758	TCCGC	2	10	159855	159864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_011758	CAAGA	2	10	161283	161292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011758	GCTGC	2	10	161315	161324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011758	ACGTC	2	10	162124	162133	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011758	CTGTC	2	10	165354	165363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011758	GCTGC	2	10	174666	174675	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011758	GCTCA	2	10	175273	175282	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011758	CGGAG	2	10	178905	178914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011758	CCCGA	2	10	182075	182084	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_011758	GCCGG	2	10	192548	192557	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011758	AGCCG	2	10	194297	194306	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011758	GGCGC	2	10	194507	194516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011758	GCTGC	2	10	194917	194926	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011758	TGACG	2	10	202171	202180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011758	CGGAT	2	10	208615	208624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011758	AGCGT	2	10	208825	208834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011758	CGCCT	2	10	210173	210182	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_011758	TTGCA	2	10	211924	211933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011758	TCTTG	2	10	212231	212240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011758	GAAGC	2	10	213286	213295	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011758	GCCCG	2	10	237291	237300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_011758	CGGCG	2	10	242204	242213	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011758	GAGGG	2	10	242411	242420	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011758	CGGCC	2	10	243169	243178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_011758	AGGCG	2	10	251386	251395	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011758	TACGC	2	10	252733	252742	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011758	GCCGC	2	10	259644	259653	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011758	AGCGC	2	10	261826	261835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_011758	AAGCT	2	10	263290	263299	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011758	TAGCT	2	10	264510	264519	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011758	GTTTG	2	10	266715	266724	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011758	ACGTC	2	10	266742	266751	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_011758	GACCT	2	10	266898	266907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011758	ATGCG	2	10	268235	268244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011758	GTCTC	2	10	280513	280522	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011758	CTATC	2	10	297579	297588	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011758	AACGG	2	10	299209	299218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011758	TCCGG	2	10	305116	305125	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011758	CTCGC	2	10	306608	306617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_011758	CTTTA	2	10	321902	321911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011758	GCTTT	2	10	322552	322561	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011758	ACCTG	2	10	325149	325158	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011758	GCGTT	2	10	338680	338689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011758	GCCGT	2	10	343588	343597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011758	GGCGC	2	10	343646	343655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011758	GAACC	2	10	343842	343851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011758	CCGGA	2	10	343984	343993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011758	GAGCG	2	10	344452	344461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011758	CGACG	2	10	344521	344530	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011758	GTTCG	2	10	345001	345010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011758	GGCAT	2	10	345011	345020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011758	TTATA	2	10	345714	345723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011758	GGGAT	2	10	346987	346996	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011758	CCGGA	2	10	349677	349686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011758	CGAGC	2	10	357955	357964	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011758	GCCGT	2	10	378208	378217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.