MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens CM4 plasmid pMCHL01

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011758	GCGCT	2	10	1472	1481	0 %	20 %	40 %	40 %	218533257
2	NC_011758	CGGCG	2	10	1785	1794	0 %	0 %	60 %	40 %	218533258
3	NC_011758	TCGGC	2	10	3572	3581	0 %	20 %	40 %	40 %	218533260
4	NC_011758	CGAGG	2	10	4854	4863	20 %	0 %	60 %	20 %	218533262
5	NC_011758	GCCGT	2	10	5179	5188	0 %	20 %	40 %	40 %	218533262
6	NC_011758	GCGCG	2	10	5270	5279	0 %	0 %	60 %	40 %	218533262
7	NC_011758	GCCCG	2	10	8058	8067	0 %	0 %	40 %	60 %	218533264
8	NC_011758	CGGCG	2	10	8299	8308	0 %	0 %	60 %	40 %	218533265
9	NC_011758	GGGCC	2	10	8309	8318	0 %	0 %	60 %	40 %	218533265
10	NC_011758	AGCTC	2	10	11541	11550	20 %	20 %	20 %	40 %	218533268
11	NC_011758	GGCTG	2	10	17554	17563	0 %	20 %	60 %	20 %	218533274
12	NC_011758	TCGGC	2	10	18907	18916	0 %	20 %	40 %	40 %	218533275
13	NC_011758	CTCCA	2	10	19124	19133	20 %	20 %	0 %	60 %	218533275
14	NC_011758	GACGG	2	10	19451	19460	20 %	0 %	60 %	20 %	218533275
15	NC_011758	TCCGT	2	10	20236	20245	0 %	40 %	20 %	40 %	218533275
16	NC_011758	GCGAG	2	10	20882	20891	20 %	0 %	60 %	20 %	218533276
17	NC_011758	CATGG	2	10	20989	20998	20 %	20 %	40 %	20 %	218533276
18	NC_011758	CGTGC	2	10	21283	21292	0 %	20 %	40 %	40 %	218533276
19	NC_011758	GCCGC	2	10	21674	21683	0 %	0 %	40 %	60 %	218533276
20	NC_011758	GCTCC	2	10	23375	23384	0 %	20 %	20 %	60 %	218533277
21	NC_011758	AGCCG	2	10	29017	29026	20 %	0 %	40 %	40 %	218533281
22	NC_011758	CAGAA	2	10	29257	29266	60 %	0 %	20 %	20 %	218533281
23	NC_011758	ATGAA	2	10	29492	29501	60 %	20 %	20 %	0 %	218533281
24	NC_011758	CGCCA	2	10	29823	29832	20 %	0 %	20 %	60 %	218533282
25	NC_011758	CCGCG	2	10	31646	31655	0 %	0 %	40 %	60 %	218533282
26	NC_011758	CCGTC	2	10	32745	32754	0 %	20 %	20 %	60 %	218533282
27	NC_011758	CCTGG	2	10	34004	34013	0 %	20 %	40 %	40 %	218533283
28	NC_011758	CCGCG	2	10	34161	34170	0 %	0 %	40 %	60 %	218533283
29	NC_011758	CGCGG	2	10	34356	34365	0 %	0 %	60 %	40 %	218533283
30	NC_011758	GAGCG	2	10	34872	34881	20 %	0 %	60 %	20 %	218533283
31	NC_011758	TGAAC	2	10	35545	35554	40 %	20 %	20 %	20 %	218533283
32	NC_011758	CGGAC	2	10	38449	38458	20 %	0 %	40 %	40 %	218533285
33	NC_011758	TCGCG	2	10	39439	39448	0 %	20 %	40 %	40 %	218533285
34	NC_011758	CGGTC	2	10	39973	39982	0 %	20 %	40 %	40 %	218533286
35	NC_011758	GGCGC	2	10	41795	41804	0 %	0 %	60 %	40 %	218533287
36	NC_011758	CGAGG	2	10	46673	46682	20 %	0 %	60 %	20 %	218533291
37	NC_011758	TCGTC	2	10	48690	48699	0 %	40 %	20 %	40 %	218533293
38	NC_011758	GCGTG	2	10	50224	50233	0 %	20 %	60 %	20 %	218533295
39	NC_011758	TCGAA	2	10	52050	52059	40 %	20 %	20 %	20 %	218533296
40	NC_011758	CAGCT	2	10	54398	54407	20 %	20 %	20 %	40 %	218533298
41	NC_011758	GACCG	2	10	54748	54757	20 %	0 %	40 %	40 %	218533298
42	NC_011758	GCGCC	2	10	54814	54823	0 %	0 %	40 %	60 %	218533298
43	NC_011758	CGGAC	2	10	58271	58280	20 %	0 %	40 %	40 %	218533300
44	NC_011758	CCCGT	2	10	58288	58297	0 %	20 %	20 %	60 %	218533300
45	NC_011758	GGGGC	2	10	63123	63132	0 %	0 %	80 %	20 %	218533304
46	NC_011758	CTGGC	2	10	71612	71621	0 %	20 %	40 %	40 %	218533309
47	NC_011758	CGGAG	2	10	72682	72691	20 %	0 %	60 %	20 %	218533309
48	NC_011758	TGAAC	2	10	74185	74194	40 %	20 %	20 %	20 %	218533311
49	NC_011758	GTGCC	2	10	75433	75442	0 %	20 %	40 %	40 %	218533312
50	NC_011758	GTCGA	2	10	78870	78879	20 %	20 %	40 %	20 %	218533316
51	NC_011758	GGCGC	2	10	79295	79304	0 %	0 %	60 %	40 %	218533316
52	NC_011758	CAGTC	2	10	83432	83441	20 %	20 %	20 %	40 %	218533320
53	NC_011758	GTCGC	2	10	85863	85872	0 %	20 %	40 %	40 %	218533322
54	NC_011758	GGCAT	2	10	86367	86376	20 %	20 %	40 %	20 %	218533322
55	NC_011758	GACGC	2	10	86475	86484	20 %	0 %	40 %	40 %	218533323
56	NC_011758	ACCGG	2	10	86491	86500	20 %	0 %	40 %	40 %	218533323
57	NC_011758	CGGGG	2	10	90749	90758	0 %	0 %	80 %	20 %	218533326
58	NC_011758	GCGCC	2	10	93727	93736	0 %	0 %	40 %	60 %	218533328
59	NC_011758	TGGCC	2	10	95361	95370	0 %	20 %	40 %	40 %	218533331
60	NC_011758	CGGTC	2	10	96498	96507	0 %	20 %	40 %	40 %	218533333
61	NC_011758	GCCGG	2	10	96522	96531	0 %	0 %	60 %	40 %	218533333
62	NC_011758	CAGGG	2	10	96670	96679	20 %	0 %	60 %	20 %	218533333
63	NC_011758	GATCG	2	10	101704	101713	20 %	20 %	40 %	20 %	218533337
64	NC_011758	CGAGC	2	10	101857	101866	20 %	0 %	40 %	40 %	218533337
65	NC_011758	GATCG	2	10	102389	102398	20 %	20 %	40 %	20 %	218533337
66	NC_011758	GAACC	2	10	102836	102845	40 %	0 %	20 %	40 %	218533337
67	NC_011758	GGCGA	2	10	103359	103368	20 %	0 %	60 %	20 %	218533337
68	NC_011758	GGGAG	2	10	105177	105186	20 %	0 %	80 %	0 %	218533337
69	NC_011758	GGCAC	2	10	107449	107458	20 %	0 %	40 %	40 %	218533340
70	NC_011758	CGGTT	2	10	111148	111157	0 %	40 %	40 %	20 %	218533343
71	NC_011758	CGCCC	2	10	113106	113115	0 %	0 %	20 %	80 %	218533344
72	NC_011758	GGCTC	2	10	118667	118676	0 %	20 %	40 %	40 %	218533346
73	NC_011758	GCCTC	2	10	120256	120265	0 %	20 %	20 %	60 %	218533349
74	NC_011758	GCGAC	2	10	120673	120682	20 %	0 %	40 %	40 %	218533349
75	NC_011758	CCGAC	2	10	120803	120812	20 %	0 %	20 %	60 %	218533349
76	NC_011758	GCTGG	2	10	122904	122913	0 %	20 %	60 %	20 %	218533350
77	NC_011758	CTCGG	2	10	123499	123508	0 %	20 %	40 %	40 %	218533350
78	NC_011758	CATTG	2	10	126862	126871	20 %	40 %	20 %	20 %	218533351
79	NC_011758	GCGCG	2	10	126912	126921	0 %	0 %	60 %	40 %	218533351
80	NC_011758	CGTCG	2	10	128444	128453	0 %	20 %	40 %	40 %	218533352
81	NC_011758	GAGCC	2	10	130042	130051	20 %	0 %	40 %	40 %	218533353
82	NC_011758	CGGGT	2	10	132486	132495	0 %	20 %	60 %	20 %	218533354
83	NC_011758	GATCG	2	10	134405	134414	20 %	20 %	40 %	20 %	218533356
84	NC_011758	GAGCT	2	10	137377	137386	20 %	20 %	40 %	20 %	218533360
85	NC_011758	GCCCC	2	10	138644	138653	0 %	0 %	20 %	80 %	218533362
86	NC_011758	GTCCG	2	10	139122	139131	0 %	20 %	40 %	40 %	218533362
87	NC_011758	GCCCG	2	10	141322	141331	0 %	0 %	40 %	60 %	218533364
88	NC_011758	GGGCC	2	10	144326	144335	0 %	0 %	60 %	40 %	218533367
89	NC_011758	TCTCG	2	10	144496	144505	0 %	40 %	20 %	40 %	218533367
90	NC_011758	GCTGC	2	10	144778	144787	0 %	20 %	40 %	40 %	218533368
91	NC_011758	GGCCG	2	10	146238	146247	0 %	0 %	60 %	40 %	218533369
92	NC_011758	CCGGG	2	10	148746	148755	0 %	0 %	60 %	40 %	218533372
93	NC_011758	CCAGA	2	10	150551	150560	40 %	0 %	20 %	40 %	218533374
94	NC_011758	GGACC	2	10	152891	152900	20 %	0 %	40 %	40 %	218533375
95	NC_011758	GGTGC	2	10	153639	153648	0 %	20 %	60 %	20 %	218533375
96	NC_011758	TTGCC	2	10	153695	153704	0 %	40 %	20 %	40 %	218533375
97	NC_011758	CGCAG	2	10	154040	154049	20 %	0 %	40 %	40 %	218533375
98	NC_011758	TGCCG	2	10	154631	154640	0 %	20 %	40 %	40 %	218533376
99	NC_011758	TCGCA	2	10	155455	155464	20 %	20 %	20 %	40 %	218533376
100	NC_011758	GCCGC	2	10	158324	158333	0 %	0 %	40 %	60 %	218533377
101	NC_011758	TCGCG	2	10	159230	159239	0 %	20 %	40 %	40 %	218533379
102	NC_011758	TACGG	2	10	162829	162838	20 %	20 %	40 %	20 %	218533385
103	NC_011758	GTCGA	2	10	165604	165613	20 %	20 %	40 %	20 %	218533390
104	NC_011758	GGCGC	2	10	166029	166038	0 %	0 %	60 %	40 %	218533390
105	NC_011758	GCGCC	2	10	168274	168283	0 %	0 %	40 %	60 %	218533393
106	NC_011758	CGCGG	2	10	169107	169116	0 %	0 %	60 %	40 %	218533393
107	NC_011758	AGCCG	2	10	169820	169829	20 %	0 %	40 %	40 %	218533394
108	NC_011758	GCGAG	2	10	172067	172076	20 %	0 %	60 %	20 %	218533397
109	NC_011758	CGCTC	2	10	172358	172367	0 %	20 %	20 %	60 %	218533398
110	NC_011758	TCCGC	2	10	173293	173302	0 %	20 %	20 %	60 %	218533400
111	NC_011758	GCCCT	2	10	173843	173852	0 %	20 %	20 %	60 %	218533402
112	NC_011758	CAACT	2	10	174254	174263	40 %	20 %	0 %	40 %	218533403
113	NC_011758	GCCGC	2	10	176989	176998	0 %	0 %	40 %	60 %	218533405
114	NC_011758	GGTGA	2	10	177009	177018	20 %	20 %	60 %	0 %	218533405
115	NC_011758	ACCAG	2	10	180959	180968	40 %	0 %	20 %	40 %	218533409
116	NC_011758	GCGCC	2	10	181535	181544	0 %	0 %	40 %	60 %	218533410
117	NC_011758	CCGGG	2	10	187081	187090	0 %	0 %	60 %	40 %	218533416
118	NC_011758	GCGGG	2	10	188781	188790	0 %	0 %	80 %	20 %	218533416
119	NC_011758	TCGAG	2	10	189360	189369	20 %	20 %	40 %	20 %	218533416
120	NC_011758	CCGGC	2	10	191566	191575	0 %	0 %	40 %	60 %	218533417
121	NC_011758	GGCGT	2	10	193703	193712	0 %	20 %	60 %	20 %	218533418
122	NC_011758	ATGCC	2	10	193752	193761	20 %	20 %	20 %	40 %	218533419
123	NC_011758	GCGAC	2	10	195974	195983	20 %	0 %	40 %	40 %	218533421
124	NC_011758	GATCA	2	10	196882	196891	40 %	20 %	20 %	20 %	218533421
125	NC_011758	GGCCG	2	10	198916	198925	0 %	0 %	60 %	40 %	218533424
126	NC_011758	CGTCA	2	10	199520	199529	20 %	20 %	20 %	40 %	218533424
127	NC_011758	CGGGA	2	10	200384	200393	20 %	0 %	60 %	20 %	218533424
128	NC_011758	CGAGG	2	10	202938	202947	20 %	0 %	60 %	20 %	218533426
129	NC_011758	CGTGA	2	10	203034	203043	20 %	20 %	40 %	20 %	218533426
130	NC_011758	TGTCG	2	10	206366	206375	0 %	40 %	40 %	20 %	218533430
131	NC_011758	GCGGA	2	10	207670	207679	20 %	0 %	60 %	20 %	218533431
132	NC_011758	GACCG	2	10	207693	207702	20 %	0 %	40 %	40 %	218533431
133	NC_011758	GCGAC	2	10	213617	213626	20 %	0 %	40 %	40 %	218533433
134	NC_011758	GCACC	2	10	214336	214345	20 %	0 %	20 %	60 %	218533434
135	NC_011758	TGTCG	2	10	214933	214942	0 %	40 %	40 %	20 %	218533435
136	NC_011758	GCGCA	2	10	216025	216034	20 %	0 %	40 %	40 %	218533437
137	NC_011758	GGCGT	2	10	217391	217400	0 %	20 %	60 %	20 %	218533437
138	NC_011758	GCGGT	2	10	217505	217514	0 %	20 %	60 %	20 %	218533437
139	NC_011758	TCGCC	2	10	217758	217767	0 %	20 %	20 %	60 %	218533437
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141	NC_011758	GCACG	2	10	218505	218514	20 %	0 %	40 %	40 %	218533437
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149	NC_011758	TCGGC	2	10	229406	229415	0 %	20 %	40 %	40 %	218533451
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168	NC_011758	AGGGC	2	10	241553	241562	20 %	0 %	60 %	20 %	218533462
169	NC_011758	GCACC	2	10	245728	245737	20 %	0 %	20 %	60 %	218533464
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259	NC_011758	GCCGG	2	10	378890	378899	0 %	0 %	60 %	40 %	218533560

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.