MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011753	ATTGG	2	10	13870	13879	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011753	TCCAT	2	10	14737	14746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011753	CTTCT	2	10	16175	16184	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011753	CAACA	2	10	52607	52616	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011753	CTATT	2	10	53080	53089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011753	AAACG	2	10	61532	61541	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011753	ACTAA	2	10	68208	68217	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011753	TTTTG	2	10	81716	81725	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011753	CTTAG	2	10	83371	83380	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011753	GCCAA	2	10	85945	85954	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011753	TTTTA	2	10	102069	102078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011753	TTGAT	2	10	104841	104850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011753	GCGAG	2	10	114643	114652	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011753	AATGA	2	10	148703	148712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011753	TTAAT	2	10	157324	157333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011753	TCGAT	2	10	169732	169741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011753	GTAAA	2	10	172620	172629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011753	TTCCT	2	10	177757	177766	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011753	AAAAT	2	10	182522	182531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011753	ACTGA	2	10	234798	234807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011753	ATTGT	2	10	245401	245410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011753	TTGCT	2	10	247571	247580	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011753	TTGAT	2	10	254713	254722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011753	TTGAT	2	10	254975	254984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011753	ATTCT	2	10	255095	255104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011753	TTGAT	2	10	255256	255265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011753	GTTGT	2	10	255926	255935	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011753	TTAAT	2	10	285607	285616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011753	TTAGA	2	10	286008	286017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011753	CGTAA	2	10	306444	306453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011753	TAAAA	2	10	307923	307932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011753	AAAAG	2	10	309524	309533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011753	AGCGG	2	10	315522	315531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011753	GGATT	2	10	330147	330156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011753	TAGAG	2	10	355014	355023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011753	TAGTG	2	10	357691	357700	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011753	AGTTT	2	10	363312	363321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011753	CAAAG	2	10	364838	364847	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011753	AGGAC	2	10	366101	366110	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011753	AAGTT	2	10	376183	376192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011753	TCTAA	2	10	378406	378415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011753	AAAAG	2	10	402446	402455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011753	ATTTG	2	10	406629	406638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011753	ATATC	2	10	410293	410302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011753	AACTT	2	10	429283	429292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011753	AGCAT	2	10	437599	437608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011753	TTTCT	2	10	463963	463972	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011753	ACTTA	2	10	464039	464048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011753	ACTCT	2	10	468421	468430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011753	AGCTT	2	10	471390	471399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011753	GTTTT	2	10	497727	497736	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011753	TGGCT	2	10	500795	500804	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011753	GCAAA	2	10	515609	515618	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011753	CTTAA	2	10	516340	516349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011753	TTTTG	2	10	516374	516383	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011753	ATAAA	2	10	521858	521867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011753	TCTTT	2	10	524384	524393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011753	TTCCT	2	10	534449	534458	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011753	GTCAC	2	10	541599	541608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011753	GCTTG	2	10	547107	547116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011753	TGAAG	2	10	548596	548605	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011753	AGAAA	2	10	549497	549506	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011753	AAGCA	2	10	559407	559416	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011753	CTTTT	2	10	561953	561962	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011753	GCTTT	2	10	563743	563752	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011753	TGATG	2	10	575521	575530	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011753	AATGC	2	10	601084	601093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011753	CAAAA	2	10	619065	619074	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011753	AAGAC	2	10	622156	622165	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011753	TGAAG	2	10	637322	637331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011753	GATTG	2	10	650967	650976	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011753	TGTTT	2	10	652714	652723	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011753	AACAA	2	10	658106	658115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011753	AAAAG	2	10	694990	694999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011753	TTAAT	2	10	696178	696187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011753	TAGAT	2	10	699218	699227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011753	CTTTT	2	10	715717	715726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011753	CTCTT	2	10	722351	722360	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011753	TAATG	2	10	726986	726995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011753	ATTCT	2	10	739174	739183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011753	TCAAT	2	10	740654	740663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011753	TTAAT	2	10	740730	740739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011753	TTTAA	2	10	761720	761729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011753	AAAAC	2	10	764419	764428	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011753	TAATA	2	10	766445	766454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011753	AAAGC	2	10	769161	769170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011753	TAAAT	2	10	788145	788154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011753	GATTA	2	10	789001	789010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011753	AAGTG	2	10	817309	817318	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011753	TTGAG	2	10	820147	820156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011753	AAATA	2	10	839636	839645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011753	ACTTT	2	10	884184	884193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011753	GTTAA	2	10	884227	884236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011753	AATAA	2	10	908255	908264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011753	TTCAT	2	10	916272	916281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011753	TATTT	2	10	931781	931790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011753	ACTTA	2	10	948611	948620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011753	TCGTT	2	10	953108	953117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011753	GAATT	2	10	958522	958531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011753	TTTTG	2	10	975964	975973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011753	CTTTT	2	10	976027	976036	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011753	TTTGG	2	10	993026	993035	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011753	AGGAA	2	10	1000146	1000155	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011753	GCTTT	2	10	1012533	1012542	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011753	GTGCA	2	10	1021612	1021621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011753	ATGTG	2	10	1021680	1021689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011753	AACAA	2	10	1031345	1031354	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011753	GAAAG	2	10	1031425	1031434	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011753	TCGCT	2	10	1035988	1035997	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011753	AGTTT	2	10	1040590	1040599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011753	AATAA	2	10	1041969	1041978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011753	ACTCT	2	10	1043860	1043869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011753	TCTAC	2	10	1045912	1045921	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011753	AAGAT	2	10	1061487	1061496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011753	GAAAA	2	10	1066159	1066168	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011753	TATTT	2	10	1072265	1072274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011753	GCATT	2	10	1072340	1072349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011753	TGAAA	2	10	1078902	1078911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011753	GCTTT	2	10	1082339	1082348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011753	TTTAT	2	10	1099009	1099018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011753	AATCT	2	10	1100237	1100246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011753	TCAAT	2	10	1108496	1108505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011753	ATCAA	2	10	1129320	1129329	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011753	ATCAC	2	10	1143119	1143128	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011753	TAAAA	2	10	1144166	1144175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011753	TACCA	2	10	1146192	1146201	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011753	TAAAC	2	10	1146412	1146421	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011753	TTATT	2	10	1160135	1160144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011753	AAATT	2	10	1164979	1164988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011753	AAATT	2	10	1171676	1171685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011753	CTTCT	2	10	1182864	1182873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011753	TAGTG	2	10	1184630	1184639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011753	TAAAT	2	10	1191588	1191597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011753	AGAAA	2	10	1194442	1194451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011753	AACGA	2	10	1199609	1199618	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011753	ATAAC	2	10	1204955	1204964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011753	TAAAA	2	10	1232467	1232476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011753	TAAAA	2	10	1239673	1239682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011753	TGAGG	2	10	1255519	1255528	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011753	CATTT	2	10	1262190	1262199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011753	GTTGT	2	10	1262224	1262233	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011753	TTAAC	2	10	1268290	1268299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011753	AGACA	2	10	1274024	1274033	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011753	ACAAA	2	10	1284443	1284452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011753	GTTTA	2	10	1306762	1306771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_011753	ATTTA	2	10	2561592	2561601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011753	GCTAA	2	10	2561648	2561657	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_011753	AATTA	2	10	2591020	2591029	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011753	AGAAT	2	10	2591031	2591040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011753	GTAAA	2	10	2617657	2617666	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_011753	TTTAA	2	10	2661586	2661595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011753	AGAAA	2	10	2679174	2679183	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_011753	ATTTA	2	10	2956463	2956472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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354	NC_011753	AGCAA	2	10	3157926	3157935	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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358	NC_011753	GGTCT	2	10	3205212	3205221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
359	NC_011753	TCGGT	2	10	3207422	3207431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.