MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011751	GAAAAT	2	12	10571	10582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011751	TAAAAA	2	12	62816	62827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011751	AACATC	2	12	81225	81236	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011751	AAGGGA	2	12	89016	89027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011751	TTTATT	2	12	138746	138757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011751	ATTGTT	2	12	152258	152269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011751	GTAGTG	2	12	203405	203416	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011751	GAACCC	2	12	269473	269484	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011751	CTTTTC	2	12	281707	281718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011751	AGGGAG	2	12	300111	300122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011751	GTGCAG	2	12	335719	335730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011751	ATTATC	2	12	360898	360909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011751	TTTTCT	2	12	373242	373253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011751	CTATTT	2	12	374279	374290	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011751	TGTCTG	2	12	384934	384945	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011751	TTTATT	2	12	402063	402074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011751	TTTTTA	2	12	457072	457083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011751	TATTGA	2	12	465476	465487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011751	TTTTCA	2	12	531194	531205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011751	CAGGCG	2	12	549867	549878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011751	CGCGCC	2	12	601269	601280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011751	ACTGGA	2	12	658509	658520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011751	CAGGAG	2	12	660742	660753	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011751	AATAAA	2	12	662677	662688	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011751	TCTTTA	2	12	699041	699052	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011751	CCAAAC	2	12	723754	723765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011751	TGCAAA	2	12	727779	727790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011751	ATTTTT	2	12	820881	820892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011751	AATCAG	2	12	869936	869947	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011751	TTTTCT	2	12	902562	902573	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011751	AATATT	2	12	967090	967101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011751	CAGAAA	2	12	979001	979012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011751	TTTTTC	2	12	1027899	1027910	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011751	GGGAGG	2	12	1028073	1028084	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011751	TTCATT	2	12	1103634	1103645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011751	TAACCG	2	12	1111532	1111543	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011751	AAATAA	2	12	1142384	1142395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011751	CTGGAA	2	12	1151948	1151959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011751	AAAGAT	2	12	1174744	1174755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011751	TGTCCA	2	12	1189958	1189969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011751	ATAATG	2	12	1213639	1213650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011751	TGTTAA	2	12	1246980	1246991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011751	CAAAAA	2	12	1286123	1286134	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011751	GTTTTT	2	12	1364336	1364347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011751	CAGGAG	2	12	1424775	1424786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011751	AAAATG	2	12	1455829	1455840	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011751	GAAGGT	2	12	1465096	1465107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011751	TTTTGT	2	12	1465775	1465786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011751	GAATAA	2	12	1469413	1469424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011751	CAGGCT	2	12	1488421	1488432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011751	AAAATA	2	12	1499761	1499772	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011751	CTTATT	2	12	1546455	1546466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011751	CAAAAG	2	12	1552352	1552363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011751	CTGATC	2	12	1562831	1562842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011751	CATATC	2	12	1660345	1660356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011751	AATTTA	2	12	1680529	1680540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011751	AATTTG	2	12	1717609	1717620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011751	GTTAAT	2	12	1720047	1720058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011751	AAAAAC	2	12	1753717	1753728	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011751	ACCGTT	2	12	1768593	1768604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011751	CAAAAA	2	12	1838166	1838177	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011751	TTAAAT	2	12	1839965	1839976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011751	TGACAG	2	12	1866384	1866395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011751	AAAAAC	2	12	1874940	1874951	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011751	AAAATA	2	12	1989569	1989580	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011751	TGTTTT	2	12	1990202	1990213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011751	AAGACT	2	12	1990462	1990473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011751	TATTAC	2	12	2105118	2105129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011751	TTTCTT	2	12	2123358	2123369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011751	ACTGTC	2	12	2172719	2172730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011751	TCTTAT	2	12	2233896	2233907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011751	ATATTT	2	12	2267447	2267458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011751	TTTTGT	2	12	2421748	2421759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011751	TCCCCC	2	12	2452549	2452560	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_011751	CCTTAC	2	12	2506134	2506145	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011751	CCTTAC	2	12	2506742	2506753	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011751	CCTGTT	2	12	2518233	2518244	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011751	ACGCAG	2	12	2536549	2536560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011751	TCTTCC	2	12	2566250	2566261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011751	TAAATG	2	12	2706243	2706254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011751	TGTCAC	2	12	2719877	2719888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011751	AGCGGA	2	12	2723013	2723024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011751	AGAAAA	2	12	2730156	2730167	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011751	GTTAAC	2	12	2768763	2768774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011751	GTTAAC	2	12	2768827	2768838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011751	CTGATG	2	12	2787586	2787597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011751	GTTATG	2	12	2805429	2805440	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011751	CAAGTG	2	12	2818402	2818413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011751	TCACCT	2	12	2920663	2920674	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011751	GTCGGG	2	12	2921098	2921109	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011751	TCAGGG	2	12	2923726	2923737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011751	TCCTTC	2	12	2930963	2930974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011751	TGGACA	2	12	2981060	2981071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011751	CAGTTT	2	12	2995665	2995676	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011751	CAGAGC	2	12	3051137	3051148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011751	TAAGGG	2	12	3073311	3073322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011751	TTTTAC	2	12	3085139	3085150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011751	GGAGAA	2	12	3097554	3097565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011751	GGAGAA	2	12	3123135	3123146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011751	TTCAGG	2	12	3183024	3183035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011751	GGTTTT	2	12	3224452	3224463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011751	ACAAGA	2	12	3228783	3228794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011751	TTTGTT	2	12	3253809	3253820	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011751	ATTAGA	2	12	3302138	3302149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011751	ATTCTC	2	12	3319132	3319143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011751	ATCGCG	2	12	3363712	3363723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011751	GTAAGG	2	12	3378387	3378398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011751	GGCAAA	2	12	3409389	3409400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011751	GGCAAA	2	12	3409563	3409574	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011751	ACTGAG	2	12	3411942	3411953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011751	ACCCGC	2	12	3451266	3451277	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011751	TATTGT	2	12	3466275	3466286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011751	TAAATA	2	12	3472626	3472637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011751	TCCGCC	2	12	3476311	3476322	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011751	CCAGTT	2	12	3477200	3477211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011751	AGCGCC	2	12	3504651	3504662	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011751	CGTGCG	2	12	3509686	3509697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011751	ATAAAC	2	12	3512633	3512644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011751	TAAACA	2	12	3513438	3513449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011751	ATTCCG	2	12	3528689	3528700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011751	TTTATC	2	12	3538452	3538463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011751	TTTAAA	2	12	3544804	3544815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011751	TTTTCG	2	12	3577821	3577832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011751	AGTTGT	2	12	3665805	3665816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011751	CTTTTT	2	12	3670482	3670493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011751	AATGAT	2	12	3671317	3671328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.