MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 chromosome

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011751	CTCAT	2	10	15957	15966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011751	TTAAT	2	10	24719	24728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011751	GATGC	2	10	39047	39056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011751	GCATC	2	10	70993	71002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011751	ATTTT	2	10	83237	83246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011751	GGGAG	2	10	83401	83410	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011751	CGCCA	2	10	83465	83474	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011751	GGCAT	2	10	146311	146320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011751	GTAAG	2	10	147075	147084	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011751	TCCTC	2	10	148795	148804	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011751	GCGGT	2	10	154346	154355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011751	TTGTT	2	10	160970	160979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011751	TTATC	2	10	171301	171310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011751	TACGT	2	10	186192	186201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011751	TGGCC	2	10	187882	187891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011751	AAATA	2	10	195773	195782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011751	GTCTG	2	10	195858	195867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011751	TCGGT	2	10	226372	226381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011751	TTTTC	2	10	241239	241248	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011751	AAATA	2	10	261243	261252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011751	GCACA	2	10	269705	269714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011751	AATTA	2	10	290297	290306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011751	GACAG	2	10	314986	314995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011751	CAAAA	2	10	324028	324037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011751	AGTGA	2	10	336219	336228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011751	CAAAG	2	10	337528	337537	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011751	CGTGA	2	10	344432	344441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011751	TGTGT	2	10	355344	355353	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011751	TGTTA	2	10	356452	356461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011751	CAAAA	2	10	373266	373275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011751	AAAAT	2	10	378513	378522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011751	TGAAC	2	10	407561	407570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011751	TGAAC	2	10	407654	407663	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011751	TGAAC	2	10	407840	407849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011751	TGAAC	2	10	407933	407942	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011751	GGCTG	2	10	416037	416046	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011751	TTGCG	2	10	424779	424788	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011751	CTTCT	2	10	454542	454551	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011751	GTTTC	2	10	489046	489055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011751	CTTTT	2	10	492522	492531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011751	GGAGT	2	10	497016	497025	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011751	GAAGA	2	10	520157	520166	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011751	TCAGG	2	10	527568	527577	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011751	TGAGT	2	10	533917	533926	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011751	CAGGT	2	10	535204	535213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011751	TCAGG	2	10	563334	563343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011751	TATTT	2	10	617853	617862	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011751	GTTTC	2	10	637938	637947	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011751	GTTGA	2	10	649752	649761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011751	GTTGT	2	10	649885	649894	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011751	GAGGG	2	10	650066	650075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011751	ATGAA	2	10	657157	657166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011751	TAACT	2	10	664511	664520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011751	TTTTA	2	10	688752	688761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011751	GTCAG	2	10	723997	724006	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011751	GTCAG	2	10	724499	724508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011751	GCAGT	2	10	727724	727733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011751	GTTAA	2	10	744716	744725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011751	TGCTA	2	10	770013	770022	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011751	ATTTG	2	10	771454	771463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011751	TCAAT	2	10	773759	773768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011751	CGTAA	2	10	776157	776166	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011751	GCATA	2	10	788352	788361	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011751	AGCAA	2	10	788459	788468	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011751	ATATT	2	10	790082	790091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011751	ACAGG	2	10	809704	809713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011751	CAGGG	2	10	815533	815542	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011751	ATAAA	2	10	820631	820640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011751	TCGCG	2	10	820818	820827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011751	TTCGT	2	10	838592	838601	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011751	ATAAC	2	10	878479	878488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011751	CTAAT	2	10	878569	878578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011751	GTCGT	2	10	888066	888075	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011751	TTGAG	2	10	889323	889332	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011751	GATGC	2	10	913420	913429	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011751	AAAAT	2	10	914923	914932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011751	AAATT	2	10	920772	920781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011751	GAGGG	2	10	931925	931934	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011751	ACATA	2	10	982338	982347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011751	GATGC	2	10	987604	987613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011751	CAAAA	2	10	994347	994356	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011751	TTCTA	2	10	999377	999386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011751	TTATA	2	10	1030049	1030058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011751	TGATG	2	10	1041117	1041126	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011751	CAGGG	2	10	1060987	1060996	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011751	AGTAA	2	10	1072847	1072856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011751	CAAAT	2	10	1082667	1082676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011751	TCGCT	2	10	1114850	1114859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011751	GCTGT	2	10	1138014	1138023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011751	GCAAC	2	10	1145402	1145411	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011751	TTCAC	2	10	1159372	1159381	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011751	GTTCA	2	10	1182294	1182303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011751	TTGTT	2	10	1186739	1186748	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011751	AGCGA	2	10	1188079	1188088	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011751	TAGGG	2	10	1188115	1188124	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011751	ATGAC	2	10	1189819	1189828	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011751	TATTT	2	10	1189882	1189891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011751	TTTTC	2	10	1197857	1197866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011751	TTATT	2	10	1198667	1198676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011751	TTCTT	2	10	1200600	1200609	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011751	GTACA	2	10	1203135	1203144	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011751	TTATG	2	10	1203292	1203301	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011751	TAAAA	2	10	1224392	1224401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011751	AGATC	2	10	1284224	1284233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011751	GTCAT	2	10	1285590	1285599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011751	TGCAG	2	10	1294293	1294302	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_011751	TCTGC	2	10	1299556	1299565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011751	GTCGC	2	10	1310136	1310145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011751	ATTTT	2	10	1368213	1368222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011751	CATTT	2	10	1371132	1371141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011751	CGATG	2	10	1371890	1371899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011751	GATTC	2	10	1373014	1373023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011751	GGGGA	2	10	1405294	1405303	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011751	CAGTG	2	10	1416691	1416700	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011751	GAAAA	2	10	1418132	1418141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011751	TTTTC	2	10	1428221	1428230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011751	AAATA	2	10	1451062	1451071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011751	CATGA	2	10	1458610	1458619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011751	GTGAT	2	10	1464135	1464144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011751	CGAAA	2	10	1464979	1464988	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011751	ATTTT	2	10	1469586	1469595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011751	TATAA	2	10	1473787	1473796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011751	TTCTA	2	10	1476840	1476849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011751	CTTAC	2	10	1481003	1481012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011751	GATTA	2	10	1483799	1483808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011751	GCATC	2	10	1488444	1488453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011751	ATAAA	2	10	1499796	1499805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011751	GAAAA	2	10	1505181	1505190	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011751	CTTCA	2	10	1523808	1523817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_011751	CTTCA	2	10	1524344	1524353	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011751	TTATC	2	10	1531663	1531672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011751	ACCGT	2	10	1541976	1541985	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011751	CAAAT	2	10	1551382	1551391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011751	CGTTG	2	10	1567880	1567889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011751	TGCGC	2	10	1618571	1618580	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011751	AGTAC	2	10	1628595	1628604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011751	TTAAT	2	10	1631310	1631319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011751	TTATT	2	10	1651053	1651062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011751	TATTT	2	10	1660471	1660480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011751	GATGC	2	10	1666646	1666655	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011751	GTTTT	2	10	1666663	1666672	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011751	CAGGG	2	10	1666780	1666789	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011751	ACGTA	2	10	1684395	1684404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011751	TGCAT	2	10	1701007	1701016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011751	ACGGC	2	10	1703440	1703449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011751	AAACG	2	10	1716296	1716305	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011751	AGTGC	2	10	1720230	1720239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011751	GTTCA	2	10	1730513	1730522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011751	AAGCG	2	10	1730554	1730563	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_011751	GAAAT	2	10	1744005	1744014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011751	GTCCA	2	10	1753878	1753887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_011751	AATTT	2	10	1754461	1754470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011751	AAACG	2	10	1765137	1765146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_011751	CTTAT	2	10	1766896	1766905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_011751	ATCGA	2	10	1785750	1785759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_011751	GTTTG	2	10	1834029	1834038	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011751	CTGGC	2	10	1834337	1834346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_011751	TATGA	2	10	1842628	1842637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011751	AAGAT	2	10	1867767	1867776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011751	CAATA	2	10	1867850	1867859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_011751	TGCCA	2	10	1871022	1871031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_011751	TCCCG	2	10	1905651	1905660	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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172	NC_011751	TACCA	2	10	1970793	1970802	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_011751	ATTTT	2	10	2087249	2087258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011751	TGTTT	2	10	2094551	2094560	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_011751	CATGC	2	10	2809427	2809436	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
248	NC_011751	GCGTC	2	10	2820755	2820764	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_011751	GTTCA	3	15	3007311	3007325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_011751	CTCTG	2	10	3051126	3051135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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280	NC_011751	TAACC	2	10	3062461	3062470	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
281	NC_011751	ATCTA	2	10	3063046	3063055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_011751	AAAAT	2	10	3085054	3085063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011751	GTTTA	2	10	3092046	3092055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011751	TTTAG	2	10	3100595	3100604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_011751	AAGCG	2	10	4655887	4655896	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_011751	AGAAA	2	10	4859762	4859771	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011751	TAATT	2	10	4867753	4867762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011751	GCAGT	2	10	4869029	4869038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
465	NC_011751	GTCGA	2	10	4877661	4877670	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
466	NC_011751	GCAAA	2	10	4909197	4909206	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_011751	TGCGC	2	10	4923782	4923791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
468	NC_011751	GCATC	2	10	4923839	4923848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
469	NC_011751	CGTTT	2	10	4950451	4950460	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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484	NC_011751	GAATG	2	10	5037409	5037418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_011751	CCTTC	2	10	5043616	5043625	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
487	NC_011751	CAAAG	2	10	5070543	5070552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
488	NC_011751	GTTGA	2	10	5072364	5072373	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
489	NC_011751	TAATA	2	10	5075580	5075589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_011751	AGCGC	2	10	5141013	5141022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_011751	GTAAC	2	10	5151096	5151105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

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