MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 2805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	218698421
2	NC_011750	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	218698422
3	NC_011750	CGCAG	2	10	8245	8254	20 %	0 %	40 %	40 %	218698427
4	NC_011750	CGTAC	2	10	9673	9682	20 %	20 %	20 %	40 %	218698428
5	NC_011750	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	218698435
6	NC_011750	CGGAC	2	10	17978	17987	20 %	0 %	40 %	40 %	218698435
7	NC_011750	AAATG	2	10	19545	19554	60 %	20 %	20 %	0 %	218698436
8	NC_011750	CCGAT	2	10	20302	20311	20 %	20 %	20 %	40 %	218698437
9	NC_011750	AGCGA	2	10	20690	20699	40 %	0 %	40 %	20 %	218698437
10	NC_011750	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	218698437
11	NC_011750	GTTTT	2	10	23107	23116	0 %	80 %	20 %	0 %	218698440
12	NC_011750	TTTAT	2	10	24163	24172	20 %	80 %	0 %	0 %	218698440
13	NC_011750	AATGT	2	10	25639	25648	40 %	40 %	20 %	0 %	218698441
14	NC_011750	TGCAA	2	10	25852	25861	40 %	20 %	20 %	20 %	218698441
15	NC_011750	ATAAA	2	10	25923	25932	80 %	20 %	0 %	0 %	218698441
16	NC_011750	TAAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	218698441
17	NC_011750	GTAAT	2	10	28248	28257	40 %	40 %	20 %	0 %	218698443
18	NC_011750	CAGTA	2	10	34847	34856	40 %	20 %	20 %	20 %	218698449
19	NC_011750	GCGAA	2	10	40642	40651	40 %	0 %	40 %	20 %	218698453
20	NC_011750	CCGTT	2	10	41536	41545	0 %	40 %	20 %	40 %	218698453
21	NC_011750	CACGG	2	10	41913	41922	20 %	0 %	40 %	40 %	218698453
22	NC_011750	CGAAT	2	10	44655	44664	40 %	20 %	20 %	20 %	218698457
23	NC_011750	CCATG	2	10	46192	46201	20 %	20 %	20 %	40 %	218698458
24	NC_011750	CCGTA	2	10	47838	47847	20 %	20 %	20 %	40 %	218698459
25	NC_011750	TTAAA	2	10	48576	48585	60 %	40 %	0 %	0 %	218698459
26	NC_011750	ACCCA	2	10	49319	49328	40 %	0 %	0 %	60 %	218698460
27	NC_011750	TTTGA	2	10	50945	50954	20 %	60 %	20 %	0 %	218698461
28	NC_011750	CGGCG	2	10	51196	51205	0 %	0 %	60 %	40 %	218698461
29	NC_011750	AATCA	2	10	51478	51487	60 %	20 %	0 %	20 %	218698462
30	NC_011750	CGGTT	2	10	52433	52442	0 %	40 %	40 %	20 %	218698463
31	NC_011750	TGGCG	2	10	54124	54133	0 %	20 %	60 %	20 %	218698465
32	NC_011750	TGCAC	2	10	55886	55895	20 %	20 %	20 %	40 %	218698466
33	NC_011750	GAAAC	2	10	57818	57827	60 %	0 %	20 %	20 %	218698467
34	NC_011750	AATCC	2	10	58987	58996	40 %	20 %	0 %	40 %	218698470
35	NC_011750	AACGT	2	10	60291	60300	40 %	20 %	20 %	20 %	218698472
36	NC_011750	GCGTC	2	10	63275	63284	0 %	20 %	40 %	40 %	218698475
37	NC_011750	ATGTT	2	10	64089	64098	20 %	60 %	20 %	0 %	218698476
38	NC_011750	CTTCG	2	10	64522	64531	0 %	40 %	20 %	40 %	218698476
39	NC_011750	TGCGT	2	10	64808	64817	0 %	40 %	40 %	20 %	218698476
40	NC_011750	CGTGG	2	10	67985	67994	0 %	20 %	60 %	20 %	218698479
41	NC_011750	AAAGT	2	10	71978	71987	60 %	20 %	20 %	0 %	218698481
42	NC_011750	GTGCT	2	10	73241	73250	0 %	40 %	40 %	20 %	218698482
43	NC_011750	GGTGA	2	10	74225	74234	20 %	20 %	60 %	0 %	218698482
44	NC_011750	CAGCG	2	10	75508	75517	20 %	0 %	40 %	40 %	218698484
45	NC_011750	TTGAT	2	10	77588	77597	20 %	60 %	20 %	0 %	218698485
46	NC_011750	TTTTC	2	10	81197	81206	0 %	80 %	0 %	20 %	218698487
47	NC_011750	AAAGC	2	10	81501	81510	60 %	0 %	20 %	20 %	218698488
48	NC_011750	GGCAA	2	10	86476	86485	40 %	0 %	40 %	20 %	218698493
49	NC_011750	TTGCT	2	10	87212	87221	0 %	60 %	20 %	20 %	218698494
50	NC_011750	GATGG	2	10	87948	87957	20 %	20 %	60 %	0 %	218698494
51	NC_011750	CCTGG	2	10	90201	90210	0 %	20 %	40 %	40 %	218698496
52	NC_011750	GACCG	2	10	92468	92477	20 %	0 %	40 %	40 %	218698498
53	NC_011750	ATGTT	2	10	95016	95025	20 %	60 %	20 %	0 %	218698500
54	NC_011750	AAAAC	2	10	95431	95440	80 %	0 %	0 %	20 %	218698500
55	NC_011750	TGCAT	2	10	95956	95965	20 %	40 %	20 %	20 %	218698501
56	NC_011750	ATTCC	2	10	96126	96135	20 %	40 %	0 %	40 %	218698501
57	NC_011750	AGTTC	2	10	101219	101228	20 %	40 %	20 %	20 %	218698505
58	NC_011750	TATCG	2	10	103099	103108	20 %	40 %	20 %	20 %	218698507
59	NC_011750	GGGCT	2	10	106971	106980	0 %	20 %	60 %	20 %	218698510
60	NC_011750	TCTGG	2	10	108678	108687	0 %	40 %	40 %	20 %	218698512
61	NC_011750	ACCGT	2	10	109344	109353	20 %	20 %	20 %	40 %	218698512
62	NC_011750	ATCAG	2	10	111117	111126	40 %	20 %	20 %	20 %	218698514
63	NC_011750	AGCCG	2	10	112885	112894	20 %	0 %	40 %	40 %	218698515
64	NC_011750	GCGCA	2	10	115213	115222	20 %	0 %	40 %	40 %	218698517
65	NC_011750	TGGCG	2	10	116208	116217	0 %	20 %	60 %	20 %	218698518
66	NC_011750	CGCGG	2	10	122384	122393	0 %	0 %	60 %	40 %	218698523
67	NC_011750	CATCG	2	10	124641	124650	20 %	20 %	20 %	40 %	218698526
68	NC_011750	TAACG	2	10	125335	125344	40 %	20 %	20 %	20 %	218698526
69	NC_011750	ATGCC	2	10	125794	125803	20 %	20 %	20 %	40 %	218698526
70	NC_011750	AATGC	2	10	127077	127086	40 %	20 %	20 %	20 %	218698527
71	NC_011750	TCTGT	2	10	128023	128032	0 %	60 %	20 %	20 %	218698529
72	NC_011750	AGCAG	2	10	130454	130463	40 %	0 %	40 %	20 %	218698532
73	NC_011750	CGAAG	2	10	132369	132378	40 %	0 %	40 %	20 %	218698533
74	NC_011750	ACACG	2	10	132502	132511	40 %	0 %	20 %	40 %	218698533
75	NC_011750	TCGCG	2	10	132763	132772	0 %	20 %	40 %	40 %	218698533
76	NC_011750	GCATC	2	10	132853	132862	20 %	20 %	20 %	40 %	218698533
77	NC_011750	GACTG	2	10	134171	134180	20 %	20 %	40 %	20 %	218698534
78	NC_011750	AGAGC	2	10	134581	134590	40 %	0 %	40 %	20 %	218698534
79	NC_011750	AGGCG	2	10	139736	139745	20 %	0 %	60 %	20 %	218698537
80	NC_011750	TCTGG	2	10	143135	143144	0 %	40 %	40 %	20 %	218698538
81	NC_011750	GGGCA	2	10	144546	144555	20 %	0 %	60 %	20 %	218698539
82	NC_011750	CAGCG	2	10	144825	144834	20 %	0 %	40 %	40 %	218698540
83	NC_011750	ACGAC	2	10	146105	146114	40 %	0 %	20 %	40 %	218698541
84	NC_011750	TTCAG	2	10	150293	150302	20 %	40 %	20 %	20 %	218698544
85	NC_011750	AGCGC	2	10	150863	150872	20 %	0 %	40 %	40 %	218698544
86	NC_011750	CCGTC	2	10	151655	151664	0 %	20 %	20 %	60 %	218698545
87	NC_011750	GTGAA	2	10	151665	151674	40 %	20 %	40 %	0 %	218698545
88	NC_011750	GTTCA	2	10	152052	152061	20 %	40 %	20 %	20 %	218698546
89	NC_011750	ATCCA	2	10	152378	152387	40 %	20 %	0 %	40 %	218698546
90	NC_011750	TTTAT	2	10	153642	153651	20 %	80 %	0 %	0 %	218698548
91	NC_011750	ATTTG	2	10	154254	154263	20 %	60 %	20 %	0 %	218698548
92	NC_011750	CGGGC	2	10	155056	155065	0 %	0 %	60 %	40 %	218698550
93	NC_011750	TTTCA	2	10	156181	156190	20 %	60 %	0 %	20 %	218698551
94	NC_011750	GCGAG	2	10	169908	169917	20 %	0 %	60 %	20 %	218698564
95	NC_011750	TGGCG	2	10	170345	170354	0 %	20 %	60 %	20 %	218698564
96	NC_011750	ACCAC	2	10	173249	173258	40 %	0 %	0 %	60 %	218698568
97	NC_011750	GGCGT	2	10	174952	174961	0 %	20 %	60 %	20 %	218698569
98	NC_011750	CTGCG	2	10	178025	178034	0 %	20 %	40 %	40 %	218698570
99	NC_011750	GCAAA	2	10	180057	180066	60 %	0 %	20 %	20 %	218698571
100	NC_011750	TGGCG	2	10	180403	180412	0 %	20 %	60 %	20 %	218698571
101	NC_011750	AACCT	2	10	182220	182229	40 %	20 %	0 %	40 %	218698573
102	NC_011750	TGGTC	2	10	182262	182271	0 %	40 %	40 %	20 %	218698573
103	NC_011750	TGGCG	2	10	183507	183516	0 %	20 %	60 %	20 %	218698574
104	NC_011750	CGGCG	2	10	184137	184146	0 %	0 %	60 %	40 %	218698574
105	NC_011750	TTCCA	2	10	184748	184757	20 %	40 %	0 %	40 %	218698574
106	NC_011750	GGTCC	2	10	189071	189080	0 %	20 %	40 %	40 %	218698579
107	NC_011750	ACGGG	2	10	190988	190997	20 %	0 %	60 %	20 %	218698581
108	NC_011750	GTGAT	2	10	193147	193156	20 %	40 %	40 %	0 %	218698582
109	NC_011750	GTGAT	2	10	193438	193447	20 %	40 %	40 %	0 %	218698582
110	NC_011750	GCCAG	2	10	197122	197131	20 %	0 %	40 %	40 %	218698586
111	NC_011750	GCTGT	2	10	197476	197485	0 %	40 %	40 %	20 %	218698586
112	NC_011750	GGCGT	2	10	197960	197969	0 %	20 %	60 %	20 %	218698586
113	NC_011750	GTTCT	2	10	198563	198572	0 %	60 %	20 %	20 %	218698586
114	NC_011750	CTGAA	2	10	200555	200564	40 %	20 %	20 %	20 %	218698588
115	NC_011750	AAGCG	2	10	200619	200628	40 %	0 %	40 %	20 %	218698588
116	NC_011750	TGGTG	2	10	202402	202411	0 %	40 %	60 %	0 %	218698590
117	NC_011750	TGCAC	2	10	202528	202537	20 %	20 %	20 %	40 %	218698590
118	NC_011750	TGCGC	2	10	202921	202930	0 %	20 %	40 %	40 %	218698590
119	NC_011750	GTCTG	2	10	203086	203095	0 %	40 %	40 %	20 %	218698591
120	NC_011750	CATGG	2	10	204622	204631	20 %	20 %	40 %	20 %	218698593
121	NC_011750	CAGAT	2	10	205661	205670	40 %	20 %	20 %	20 %	218698594
122	NC_011750	ACTTT	2	10	205794	205803	20 %	60 %	0 %	20 %	218698594
123	NC_011750	GACGT	2	10	209714	209723	20 %	20 %	40 %	20 %	218698597
124	NC_011750	CGACG	2	10	211541	211550	20 %	0 %	40 %	40 %	218698599
125	NC_011750	ATGCC	2	10	214109	214118	20 %	20 %	20 %	40 %	218698602
126	NC_011750	TGGCC	2	10	215435	215444	0 %	20 %	40 %	40 %	218698604
127	NC_011750	ACCGC	2	10	215448	215457	20 %	0 %	20 %	60 %	218698604
128	NC_011750	AGCCG	2	10	216806	216815	20 %	0 %	40 %	40 %	218698604
129	NC_011750	GGTGG	2	10	216915	216924	0 %	20 %	80 %	0 %	218698604
130	NC_011750	CCACG	2	10	224324	224333	20 %	0 %	20 %	60 %	218698609
131	NC_011750	TATTT	2	10	227109	227118	20 %	80 %	0 %	0 %	218698612
132	NC_011750	ATCAA	2	10	227304	227313	60 %	20 %	0 %	20 %	218698612
133	NC_011750	CAGCG	2	10	233325	233334	20 %	0 %	40 %	40 %	218698618
134	NC_011750	GGAAC	2	10	234805	234814	40 %	0 %	40 %	20 %	218698619
135	NC_011750	CAGGC	2	10	238718	238727	20 %	0 %	40 %	40 %	218698623
136	NC_011750	CTTAA	2	10	242327	242336	40 %	40 %	0 %	20 %	218698625
137	NC_011750	CGCGC	2	10	251883	251892	0 %	0 %	40 %	60 %	218698634
138	NC_011750	ACCGG	2	10	251982	251991	20 %	0 %	40 %	40 %	218698634
139	NC_011750	GTCAG	2	10	252244	252253	20 %	20 %	40 %	20 %	218698635
140	NC_011750	CGCCC	2	10	258198	258207	0 %	0 %	20 %	80 %	218698640
141	NC_011750	GGTCG	2	10	258457	258466	0 %	20 %	60 %	20 %	218698640
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145	NC_011750	TGCCC	2	10	284383	284392	0 %	20 %	20 %	60 %	218698664
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147	NC_011750	TGGCG	2	10	284731	284740	0 %	20 %	60 %	20 %	218698664
148	NC_011750	CGGCA	2	10	286257	286266	20 %	0 %	40 %	40 %	218698666
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151	NC_011750	GCGCC	2	10	288157	288166	0 %	0 %	40 %	60 %	218698668
152	NC_011750	GCCTT	2	10	289896	289905	0 %	40 %	20 %	40 %	218698670
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163	NC_011750	GGCAA	2	10	303438	303447	40 %	0 %	40 %	20 %	218698687
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165	NC_011750	CGCCA	2	10	304083	304092	20 %	0 %	20 %	60 %	218698687
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177	NC_011750	CCCAT	2	10	332023	332032	20 %	20 %	0 %	60 %	218698712
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257	NC_011750	AAGTG	2	10	484295	484304	40 %	20 %	40 %	0 %	218698848
258	NC_011750	AAATC	2	10	485696	485705	60 %	20 %	0 %	20 %	218698850
259	NC_011750	GAGCT	2	10	487850	487859	20 %	20 %	40 %	20 %	218698853
260	NC_011750	ACCGT	2	10	488538	488547	20 %	20 %	20 %	40 %	218698853
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