MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 64424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	CAC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698420
2	NC_011750	ACC	3	9	213	221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698420
3	NC_011750	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
4	NC_011750	TGG	2	6	474	479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
5	NC_011750	GAT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
6	NC_011750	CGC	2	6	568	573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
7	NC_011750	TCG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
8	NC_011750	TTG	2	6	662	667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
9	NC_011750	CTG	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
10	NC_011750	CCG	2	6	847	852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
11	NC_011750	CCG	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698421
12	NC_011750	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
13	NC_011750	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
14	NC_011750	CTG	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
15	NC_011750	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
16	NC_011750	GTT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
17	NC_011750	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698421
18	NC_011750	TGA	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
19	NC_011750	GGC	2	6	1327	1332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
20	NC_011750	GTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
21	NC_011750	ATC	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
22	NC_011750	AAG	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
23	NC_011750	GGT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698421
24	NC_011750	TCT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698421
25	NC_011750	CGT	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
26	NC_011750	GAT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
27	NC_011750	TCA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
28	NC_011750	GCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
29	NC_011750	GAA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
30	NC_011750	GAA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698421
31	NC_011750	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
32	NC_011750	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
33	NC_011750	GTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698421
34	NC_011750	TCG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
35	NC_011750	TAC	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698421
36	NC_011750	GCG	2	6	2117	2122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698421
37	NC_011750	TGA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
38	NC_011750	TGA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
39	NC_011750	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
40	NC_011750	TGC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698421
41	NC_011750	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698421
42	NC_011750	TGA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
43	NC_011750	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698421
44	NC_011750	TAT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698421
45	NC_011750	GCG	2	6	2862	2867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
46	NC_011750	GGC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
47	NC_011750	CAA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698422
48	NC_011750	GGT	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698422
49	NC_011750	GCA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698422
50	NC_011750	GGT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698422
51	NC_011750	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
52	NC_011750	GAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698422
53	NC_011750	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698422
54	NC_011750	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
55	NC_011750	CGC	2	6	3384	3389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698422
56	NC_011750	TGA	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698422
57	NC_011750	CGG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698422
58	NC_011750	TGA	2	6	3860	3865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
59	NC_011750	TGA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
60	NC_011750	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
61	NC_011750	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
62	NC_011750	TGA	3	9	4322	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
63	NC_011750	CTA	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698423
64	NC_011750	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698423
65	NC_011750	CTG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698423
66	NC_011750	ACG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698423
67	NC_011750	AAC	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698423
68	NC_011750	GTT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698423
69	NC_011750	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698423
70	NC_011750	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
71	NC_011750	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698423
72	NC_011750	TGC	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698423
73	NC_011750	TGA	3	9	4999	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698423
74	NC_011750	ATC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698423
75	NC_011750	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698424
76	NC_011750	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698424
77	NC_011750	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698424
78	NC_011750	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698424
79	NC_011750	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698424
80	NC_011750	ATC	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
81	NC_011750	ATC	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
82	NC_011750	CAT	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698424
83	NC_011750	GCT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
84	NC_011750	GGA	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218698425
85	NC_011750	TCA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698425
86	NC_011750	AAG	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698425
87	NC_011750	AAT	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698425
88	NC_011750	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698425
89	NC_011750	TGA	2	6	5732	5737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698425
90	NC_011750	TTC	2	6	5752	5757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698425
91	NC_011750	TTC	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698425
92	NC_011750	CAC	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698425
93	NC_011750	TGC	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
94	NC_011750	TTG	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698425
95	NC_011750	TGA	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698425
96	NC_011750	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698425
97	NC_011750	GTG	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698425
98	NC_011750	GCC	2	6	6645	6650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
99	NC_011750	GTT	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698426
100	NC_011750	AGA	2	6	6716	6721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698426
101	NC_011750	ATC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698426
102	NC_011750	CGC	2	6	6987	6992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
103	NC_011750	CGC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
104	NC_011750	GCC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698426
105	NC_011750	CAG	2	6	7272	7277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698426
106	NC_011750	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698426
107	NC_011750	GGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218698426
108	NC_011750	AGA	2	6	7565	7570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698426
109	NC_011750	CGG	2	6	7586	7591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698426
110	NC_011750	CAA	2	6	7765	7770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698426
111	NC_011750	TAA	2	6	7820	7825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218698426
112	NC_011750	ACC	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698427
113	NC_011750	CAG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698427
114	NC_011750	CAG	2	6	8324	8329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698427
115	NC_011750	TGC	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698427
116	NC_011750	AAG	2	6	8565	8570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698427
117	NC_011750	CTG	2	6	8591	8596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698427
118	NC_011750	TTG	2	6	8655	8660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218698427
119	NC_011750	AGA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698427
120	NC_011750	TAC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698427
121	NC_011750	GCT	2	6	8863	8868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698427
122	NC_011750	GCA	2	6	8971	8976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698427
123	NC_011750	CTG	2	6	9068	9073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698427
124	NC_011750	TGA	2	6	9189	9194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698428
125	NC_011750	GCG	2	6	9240	9245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698428
126	NC_011750	GAA	2	6	9275	9280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698428
127	NC_011750	ATC	2	6	9347	9352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698428
128	NC_011750	TGG	2	6	9372	9377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698428
129	NC_011750	CAC	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218698428
130	NC_011750	CGT	2	6	9428	9433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698428
131	NC_011750	TGC	2	6	9733	9738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698428
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161	NC_011750	GCC	2	6	12267	12272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698432
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254	NC_011750	TGA	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698436
255	NC_011750	GTA	2	6	18977	18982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698436
256	NC_011750	AGA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218698436
257	NC_011750	GTC	2	6	19030	19035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218698436
258	NC_011750	CAA	2	6	19043	19048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698436
259	NC_011750	ATT	2	6	19049	19054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698436
260	NC_011750	TTC	2	6	19241	19246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218698436
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262	NC_011750	CGC	3	9	19436	19444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218698436
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268	NC_011750	ATT	2	6	19995	20000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218698437
269	NC_011750	GAT	2	6	20024	20029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698437
270	NC_011750	GCG	2	6	20041	20046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218698437
271	NC_011750	CAA	2	6	20114	20119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218698437
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273	NC_011750	TGG	2	6	20255	20260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218698437
274	NC_011750	GAT	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218698437
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277	NC_011750	CGA	2	6	20435	20440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218698437
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279	NC_011750	ATC	2	6	20457	20462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698437
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283	NC_011750	ATC	2	6	20823	20828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218698437
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