MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	TGACAC	2	12	126	137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218692795
2	NC_011749	TGGATA	2	12	324	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692795
3	NC_011749	ATTTTT	2	12	2929	2940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218692797
4	NC_011749	CTTGTT	2	12	6571	6582	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218692799
5	NC_011749	TTCTTA	2	12	7806	7817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218692799
6	NC_011749	GCTCCT	2	12	11243	11254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218692803
7	NC_011749	AGGTGC	2	12	12091	12102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218692804
8	NC_011749	ATTTTG	2	12	13340	13351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218692807
9	NC_011749	TCTTTT	2	12	21788	21799	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218692811
10	NC_011749	AAAATA	2	12	25214	25225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011749	CAATAA	2	12	25878	25889	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218692817
12	NC_011749	ACCAGA	2	12	31502	31513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218692827
13	NC_011749	ACGCAG	2	12	32724	32735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692828
14	NC_011749	GCGCCA	2	12	34715	34726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218692830
15	NC_011749	CTTCGC	2	12	36928	36939	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218692832
16	NC_011749	CATCTC	2	12	37475	37486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218692832
17	NC_011749	TAAAAA	2	12	43005	43016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218692841
18	NC_011749	AAGACC	2	12	43991	44002	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218692842
19	NC_011749	AATCAG	2	12	56163	56174	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011749	TCCCCA	2	12	56648	56659	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	218692863
21	NC_011749	GCCCCA	2	12	59156	59167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	218692864
22	NC_011749	CCACAT	2	12	59462	59473	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218692864
23	NC_011749	ACGGTT	2	12	63272	63283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218692865
24	NC_011749	TAAACT	2	12	66592	66603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218692868
25	NC_011749	GTAACT	2	12	68840	68851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218692869
26	NC_011749	CCTGCC	2	12	70836	70847	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	218692870
27	NC_011749	TCATAA	2	12	71304	71315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218692871
28	NC_011749	AACAGA	2	12	71475	71486	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218692872
29	NC_011749	TTTCCA	2	12	81131	81142	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218692883
30	NC_011749	TCAGAG	2	12	94103	94114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011749	TCAGAG	2	12	94121	94132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011749	CTGCCA	2	12	94960	94971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218692906
33	NC_011749	GGGAAG	2	12	95269	95280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218692906
34	NC_011749	TCCGGC	2	12	97030	97041	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	218692908
35	NC_011749	CGCCAC	2	12	97281	97292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	218692908
36	NC_011749	CCAGCG	2	12	97400	97411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	218692908
37	NC_011749	CTCATC	2	12	98294	98305	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218692909
38	NC_011749	CAGTAG	4	24	99502	99525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011749	TGCTGA	2	12	100826	100837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218692912
40	NC_011749	TCCGGT	2	12	104964	104975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692916
41	NC_011749	GCGACA	2	12	108042	108053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692921
42	NC_011749	TAAGTT	2	12	109133	109144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218692922
43	NC_011749	GCTGTC	2	12	118226	118237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692934
44	NC_011749	AAAATC	2	12	118406	118417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011749	TGTTTT	2	12	119420	119431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011749	ATTTTT	2	12	119940	119951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.