MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	TTATG	2	10	1267	1276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011749	GTTAT	2	10	2446	2455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011749	TGATG	2	10	2859	2868	20 %	40 %	40 %	0 %	218692797
4	NC_011749	ATTTT	2	10	3386	3395	20 %	80 %	0 %	0 %	218692797
5	NC_011749	ACTTG	2	10	3971	3980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011749	TAGTT	2	10	4799	4808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011749	ATAGA	2	10	5063	5072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011749	CACAG	2	10	6805	6814	40 %	0 %	20 %	40 %	218692799
9	NC_011749	AGTTA	2	10	7280	7289	40 %	40 %	20 %	0 %	218692799
10	NC_011749	GGGAT	2	10	7842	7851	20 %	20 %	60 %	0 %	218692799
11	NC_011749	CCCTG	2	10	9047	9056	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011749	CCGAA	2	10	9269	9278	40 %	0 %	20 %	40 %	218692801
13	NC_011749	CAGCC	2	10	9347	9356	20 %	0 %	20 %	60 %	218692801
14	NC_011749	TTTGA	2	10	9841	9850	20 %	60 %	20 %	0 %	218692802
15	NC_011749	GCGCT	2	10	10479	10488	0 %	20 %	40 %	40 %	218692802
16	NC_011749	ACCTT	2	10	10879	10888	20 %	40 %	0 %	40 %	218692803
17	NC_011749	CGAAC	2	10	11228	11237	40 %	0 %	20 %	40 %	218692803
18	NC_011749	GAGTA	2	10	13814	13823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011749	ACACG	2	10	14193	14202	40 %	0 %	20 %	40 %	218692808
20	NC_011749	TTGTT	2	10	15252	15261	0 %	80 %	20 %	0 %	218692808
21	NC_011749	CTGAA	2	10	19806	19815	40 %	20 %	20 %	20 %	218692810
22	NC_011749	CGTTA	2	10	20253	20262	20 %	40 %	20 %	20 %	218692810
23	NC_011749	GTCTG	2	10	20385	20394	0 %	40 %	40 %	20 %	218692810
24	NC_011749	AAATT	2	10	21310	21319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011749	TACAC	2	10	24051	24060	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011749	CGGCC	2	10	26552	26561	0 %	0 %	40 %	60 %	218692819
27	NC_011749	AACAA	2	10	28728	28737	80 %	0 %	0 %	20 %	218692822
28	NC_011749	GCAGC	2	10	33855	33864	20 %	0 %	40 %	40 %	218692829
29	NC_011749	GGCCT	2	10	40208	40217	0 %	20 %	40 %	40 %	218692836
30	NC_011749	TTAAG	2	10	40273	40282	40 %	40 %	20 %	0 %	218692836
31	NC_011749	AACAT	2	10	41285	41294	60 %	20 %	0 %	20 %	218692839
32	NC_011749	ACACC	2	10	41579	41588	40 %	0 %	0 %	60 %	218692839
33	NC_011749	CAATC	2	10	41787	41796	40 %	20 %	0 %	40 %	218692839
34	NC_011749	CTCAA	2	10	42488	42497	40 %	20 %	0 %	40 %	218692840
35	NC_011749	ATTAT	2	10	43136	43145	40 %	60 %	0 %	0 %	218692841
36	NC_011749	GGTAA	2	10	43237	43246	40 %	20 %	40 %	0 %	218692841
37	NC_011749	CCAAG	2	10	44571	44580	40 %	0 %	20 %	40 %	218692842
38	NC_011749	TAGAT	2	10	44842	44851	40 %	40 %	20 %	0 %	218692843
39	NC_011749	AAAGT	2	10	44853	44862	60 %	20 %	20 %	0 %	218692843
40	NC_011749	TTCCT	2	10	46363	46372	0 %	60 %	0 %	40 %	218692845
41	NC_011749	TCCAA	2	10	46430	46439	40 %	20 %	0 %	40 %	218692845
42	NC_011749	CGGGG	2	10	50517	50526	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011749	TGTTT	2	10	53501	53510	0 %	80 %	20 %	0 %	218692858
44	NC_011749	CCCGG	2	10	53698	53707	0 %	0 %	40 %	60 %	218692859
45	NC_011749	GACCA	2	10	56853	56862	40 %	0 %	20 %	40 %	218692863
46	NC_011749	CGTGT	2	10	56910	56919	0 %	40 %	40 %	20 %	218692863
47	NC_011749	CAGGT	2	10	57192	57201	20 %	20 %	40 %	20 %	218692863
48	NC_011749	ACGGC	2	10	57730	57739	20 %	0 %	40 %	40 %	218692864
49	NC_011749	CCGGT	2	10	57801	57810	0 %	20 %	40 %	40 %	218692864
50	NC_011749	CGCTG	2	10	59060	59069	0 %	20 %	40 %	40 %	218692864
51	NC_011749	TCCGG	2	10	60500	60509	0 %	20 %	40 %	40 %	218692864
52	NC_011749	AGGTC	2	10	61979	61988	20 %	20 %	40 %	20 %	218692864
53	NC_011749	CCAGC	2	10	62125	62134	20 %	0 %	20 %	60 %	218692864
54	NC_011749	CAGCA	2	10	63494	63503	40 %	0 %	20 %	40 %	218692865
55	NC_011749	CCGTG	2	10	63946	63955	0 %	20 %	40 %	40 %	218692865
56	NC_011749	ACCAG	2	10	65796	65805	40 %	0 %	20 %	40 %	218692867
57	NC_011749	CACTG	2	10	67838	67847	20 %	20 %	20 %	40 %	218692869
58	NC_011749	CCCAG	2	10	69439	69448	20 %	0 %	20 %	60 %	218692869
59	NC_011749	TTCTG	2	10	72019	72028	0 %	60 %	20 %	20 %	218692873
60	NC_011749	GCACT	2	10	75664	75673	20 %	20 %	20 %	40 %	218692877
61	NC_011749	AAAAT	2	10	76882	76891	80 %	20 %	0 %	0 %	218692879
62	NC_011749	GGACT	2	10	77332	77341	20 %	20 %	40 %	20 %	218692880
63	NC_011749	CAGAA	2	10	77395	77404	60 %	0 %	20 %	20 %	218692880
64	NC_011749	GCTTC	2	10	78024	78033	0 %	40 %	20 %	40 %	218692880
65	NC_011749	TCAGA	2	10	80972	80981	40 %	20 %	20 %	20 %	218692883
66	NC_011749	TTCAT	2	10	82009	82018	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011749	TGCAT	2	10	82409	82418	20 %	40 %	20 %	20 %	218692886
68	NC_011749	AGAAT	2	10	82775	82784	60 %	20 %	20 %	0 %	218692886
69	NC_011749	AACTG	2	10	83317	83326	40 %	20 %	20 %	20 %	218692888
70	NC_011749	CATTT	2	10	84370	84379	20 %	60 %	0 %	20 %	218692891
71	NC_011749	TGTCC	2	10	85896	85905	0 %	40 %	20 %	40 %	218692892
72	NC_011749	CACGG	2	10	86313	86322	20 %	0 %	40 %	40 %	218692893
73	NC_011749	CGCTT	2	10	87161	87170	0 %	40 %	20 %	40 %	218692894
74	NC_011749	GAATC	2	10	91107	91116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011749	ATCAC	2	10	91154	91163	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011749	TTCCC	2	10	92816	92825	0 %	40 %	0 %	60 %	218692903
77	NC_011749	GTGAT	2	10	94164	94173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011749	TCTGC	2	10	95148	95157	0 %	40 %	20 %	40 %	218692906
79	NC_011749	TCAGT	2	10	95978	95987	20 %	40 %	20 %	20 %	218692907
80	NC_011749	CGGCG	2	10	100209	100218	0 %	0 %	60 %	40 %	218692911
81	NC_011749	CCCGG	2	10	101469	101478	0 %	0 %	40 %	60 %	218692912
82	NC_011749	ACAGT	2	10	103521	103530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011749	ACGGT	2	10	103761	103770	20 %	20 %	40 %	20 %	218692915
84	NC_011749	GTGCC	2	10	104051	104060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011749	ACCTT	2	10	104224	104233	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011749	GGCAC	2	10	104267	104276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011749	TGGCG	2	10	105155	105164	0 %	20 %	60 %	20 %	218692916
88	NC_011749	CCAGC	2	10	106185	106194	20 %	0 %	20 %	60 %	218692919
89	NC_011749	GCCGG	2	10	106217	106226	0 %	0 %	60 %	40 %	218692919
90	NC_011749	CCCGT	2	10	106830	106839	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_011749	GCCGC	2	10	106880	106889	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_011749	GCATT	2	10	108440	108449	20 %	40 %	20 %	20 %	218692922
93	NC_011749	CACAT	2	10	108504	108513	40 %	20 %	0 %	40 %	218692922
94	NC_011749	GAACA	2	10	109355	109364	60 %	0 %	20 %	20 %	218692922
95	NC_011749	TAACT	2	10	109744	109753	40 %	40 %	0 %	20 %	218692923
96	NC_011749	AAAAG	2	10	110167	110176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011749	GTACG	2	10	111544	111553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011749	AAGGT	2	10	112670	112679	40 %	20 %	40 %	0 %	218692926
99	NC_011749	TGAAC	2	10	114141	114150	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011749	CATCA	2	10	115212	115221	40 %	20 %	0 %	40 %	218692929
101	NC_011749	GGAAG	2	10	115962	115971	40 %	0 %	60 %	0 %	218692930
102	NC_011749	ATGGT	2	10	120274	120283	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011749	AGCTG	2	10	120511	120520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011749	ATTAC	2	10	120992	121001	40 %	40 %	0 %	20 %	218692935
105	NC_011749	TCCTT	2	10	121267	121276	0 %	60 %	0 %	40 %	218692936

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.