MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	TTATG	2	10	1267	1276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011749	GTTAT	2	10	2446	2455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011749	ACTTG	2	10	3971	3980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011749	TAGTT	2	10	4799	4808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011749	ATAGA	2	10	5063	5072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011749	CCCTG	2	10	9047	9056	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011749	GAGTA	2	10	13814	13823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011749	AAATT	2	10	21310	21319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011749	TACAC	2	10	24051	24060	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011749	CGGGG	2	10	50517	50526	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011749	TTCAT	2	10	82009	82018	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011749	GAATC	2	10	91107	91116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011749	ATCAC	2	10	91154	91163	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011749	GTGAT	2	10	94164	94173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011749	ACAGT	2	10	103521	103530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011749	GTGCC	2	10	104051	104060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011749	ACCTT	2	10	104224	104233	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011749	GGCAC	2	10	104267	104276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011749	CCCGT	2	10	106830	106839	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011749	GCCGC	2	10	106880	106889	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011749	AAAAG	2	10	110167	110176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011749	GTACG	2	10	111544	111553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011749	TGAAC	2	10	114141	114150	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011749	ATGGT	2	10	120274	120283	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011749	AGCTG	2	10	120511	120520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.