MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	CAGG	2	8	44	51	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011749	TACC	2	8	192	199	25 %	25 %	0 %	50 %	218692795
3	NC_011749	TGGG	2	8	350	357	0 %	25 %	75 %	0 %	218692795
4	NC_011749	TCAT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	218692795
5	NC_011749	AGTG	2	8	1140	1147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011749	CTGT	2	8	1186	1193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011749	CCAG	2	8	1457	1464	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
8	NC_011749	GGCG	2	8	1730	1737	0 %	0 %	75 %	25 %	218692796
9	NC_011749	CGCA	2	8	1747	1754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
10	NC_011749	CACT	2	8	1908	1915	25 %	25 %	0 %	50 %	218692796
11	NC_011749	TTTG	2	8	2163	2170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011749	CATG	2	8	2465	2472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011749	AAAT	2	8	2570	2577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011749	TTAC	2	8	2590	2597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011749	CTGG	2	8	3119	3126	0 %	25 %	50 %	25 %	218692797
16	NC_011749	ATCT	2	8	3247	3254	25 %	50 %	0 %	25 %	218692797
17	NC_011749	ATTT	2	8	4235	4242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011749	CATC	2	8	4407	4414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011749	ATGA	2	8	4479	4486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011749	AATG	2	8	4566	4573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011749	AGTA	2	8	5088	5095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011749	AAAT	2	8	5344	5351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011749	TTGC	2	8	5831	5838	0 %	50 %	25 %	25 %	218692798
24	NC_011749	CTGG	2	8	5852	5859	0 %	25 %	50 %	25 %	218692798
25	NC_011749	ATCA	2	8	5978	5985	50 %	25 %	0 %	25 %	218692798
26	NC_011749	GGAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	50 %	25 %	218692799
27	NC_011749	ACAG	2	8	6970	6977	50 %	0 %	25 %	25 %	218692799
28	NC_011749	GGAA	2	8	7347	7354	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
29	NC_011749	GGCT	2	8	8070	8077	0 %	25 %	50 %	25 %	218692799
30	NC_011749	GCAA	2	8	8500	8507	50 %	0 %	25 %	25 %	218692800
31	NC_011749	TGGC	2	8	8941	8948	0 %	25 %	50 %	25 %	218692800
32	NC_011749	CAGC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	218692801
33	NC_011749	TCTG	2	8	9816	9823	0 %	50 %	25 %	25 %	218692802
34	NC_011749	CTGA	2	8	10015	10022	25 %	25 %	25 %	25 %	218692802
35	NC_011749	TGAG	2	8	10266	10273	25 %	25 %	50 %	0 %	218692802
36	NC_011749	CAGC	2	8	10761	10768	25 %	0 %	25 %	50 %	218692803
37	NC_011749	GAAT	2	8	11273	11280	50 %	25 %	25 %	0 %	218692803
38	NC_011749	GCGA	2	8	11328	11335	25 %	0 %	50 %	25 %	218692803
39	NC_011749	GGAT	2	8	11708	11715	25 %	25 %	50 %	0 %	218692804
40	NC_011749	GTCA	2	8	11875	11882	25 %	25 %	25 %	25 %	218692804
41	NC_011749	GCCG	2	8	11979	11986	0 %	0 %	50 %	50 %	218692804
42	NC_011749	CCAG	2	8	12967	12974	25 %	0 %	25 %	50 %	218692806
43	NC_011749	CGAG	2	8	13292	13299	25 %	0 %	50 %	25 %	218692807
44	NC_011749	ATAC	2	8	13630	13637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011749	ACCA	2	8	14030	14037	50 %	0 %	0 %	50 %	218692808
46	NC_011749	GCCA	2	8	14168	14175	25 %	0 %	25 %	50 %	218692808
47	NC_011749	CAGC	2	8	15321	15328	25 %	0 %	25 %	50 %	218692808
48	NC_011749	GCCA	2	8	15537	15544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011749	CCTG	2	8	15600	15607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011749	CTTG	2	8	15650	15657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011749	CAGA	2	8	16030	16037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011749	GCCC	2	8	16062	16069	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_011749	GTAA	2	8	16087	16094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011749	CCAC	2	8	16101	16108	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_011749	TTCC	2	8	16266	16273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011749	TCTT	2	8	16343	16350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011749	GGAT	2	8	16964	16971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011749	ACAA	2	8	17434	17441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011749	CATC	2	8	18210	18217	25 %	25 %	0 %	50 %	218692809
60	NC_011749	TATT	2	8	18578	18585	25 %	75 %	0 %	0 %	218692809
61	NC_011749	TGGG	2	8	18978	18985	0 %	25 %	75 %	0 %	218692810
62	NC_011749	TCGA	2	8	20023	20030	25 %	25 %	25 %	25 %	218692810
63	NC_011749	CGCC	2	8	20051	20058	0 %	0 %	25 %	75 %	218692810
64	NC_011749	AATT	2	8	20268	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	218692810
65	NC_011749	ATTT	2	8	20339	20346	25 %	75 %	0 %	0 %	218692810
66	NC_011749	GCCA	2	8	20775	20782	25 %	0 %	25 %	50 %	218692810
67	NC_011749	ATTA	2	8	21235	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011749	GTCA	2	8	22897	22904	25 %	25 %	25 %	25 %	218692812
69	NC_011749	TCTG	2	8	22947	22954	0 %	50 %	25 %	25 %	218692812
70	NC_011749	ATTA	2	8	23059	23066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011749	GAAT	2	8	23082	23089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011749	GCTT	2	8	23222	23229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011749	CGGC	2	8	23308	23315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011749	ACGT	2	8	23376	23383	25 %	25 %	25 %	25 %	218692813
75	NC_011749	CCAG	2	8	23976	23983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011749	GTTT	2	8	24033	24040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011749	GTAC	2	8	24121	24128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011749	ATTT	2	8	24462	24469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011749	ATCT	2	8	24747	24754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011749	AGAA	2	8	25106	25113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011749	TAAA	2	8	25440	25447	75 %	25 %	0 %	0 %	218692815
82	NC_011749	ACAG	2	8	25471	25478	50 %	0 %	25 %	25 %	218692816
83	NC_011749	AGAA	2	8	25494	25501	75 %	0 %	25 %	0 %	218692816
84	NC_011749	AGCA	2	8	25554	25561	50 %	0 %	25 %	25 %	218692816
85	NC_011749	CTTT	2	8	25812	25819	0 %	75 %	0 %	25 %	218692817
86	NC_011749	CGTC	2	8	26564	26571	0 %	25 %	25 %	50 %	218692819
87	NC_011749	CAGC	2	8	26613	26620	25 %	0 %	25 %	50 %	218692819
88	NC_011749	CAGC	2	8	26747	26754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692819
89	NC_011749	CATT	2	8	26881	26888	25 %	50 %	0 %	25 %	218692820
90	NC_011749	ATCC	2	8	27056	27063	25 %	25 %	0 %	50 %	218692820
91	NC_011749	GGAA	2	8	27716	27723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011749	TTAC	2	8	27895	27902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011749	GGGC	2	8	27920	27927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011749	GTCT	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011749	GCAA	2	8	28331	28338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011749	CAGG	2	8	28382	28389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011749	GCTG	2	8	28443	28450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011749	TGGC	2	8	28659	28666	0 %	25 %	50 %	25 %	218692822
99	NC_011749	GCCA	2	8	29575	29582	25 %	0 %	25 %	50 %	218692823
100	NC_011749	CCGT	2	8	30020	30027	0 %	25 %	25 %	50 %	218692825
101	NC_011749	CGCC	2	8	32736	32743	0 %	0 %	25 %	75 %	218692828
102	NC_011749	GCCA	2	8	32968	32975	25 %	0 %	25 %	50 %	218692829
103	NC_011749	CTGA	2	8	33673	33680	25 %	25 %	25 %	25 %	218692829
104	NC_011749	TCAA	2	8	33878	33885	50 %	25 %	0 %	25 %	218692829
105	NC_011749	CCTC	2	8	34061	34068	0 %	25 %	0 %	75 %	218692830
106	NC_011749	ACCA	2	8	34684	34691	50 %	0 %	0 %	50 %	218692830
107	NC_011749	CGCC	2	8	35024	35031	0 %	0 %	25 %	75 %	218692830
108	NC_011749	GCCC	2	8	35111	35118	0 %	0 %	25 %	75 %	218692830
109	NC_011749	TCAT	2	8	35954	35961	25 %	50 %	0 %	25 %	218692831
110	NC_011749	CAGC	2	8	36233	36240	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
111	NC_011749	CCAG	2	8	36403	36410	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
112	NC_011749	CCAG	2	8	36604	36611	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
113	NC_011749	AGCG	2	8	37742	37749	25 %	0 %	50 %	25 %	218692832
114	NC_011749	TCAA	2	8	37953	37960	50 %	25 %	0 %	25 %	218692832
115	NC_011749	AGGC	2	8	38241	38248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011749	GGCA	2	8	38300	38307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011749	GCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	25 %	25 %	218692833
118	NC_011749	GCCA	2	8	38847	38854	25 %	0 %	25 %	50 %	218692833
119	NC_011749	TTCA	2	8	39161	39168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011749	GCCA	2	8	39782	39789	25 %	0 %	25 %	50 %	218692834
121	NC_011749	CAGC	2	8	39818	39825	25 %	0 %	25 %	50 %	218692834
122	NC_011749	TCTG	2	8	40079	40086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011749	CCGC	2	8	40660	40667	0 %	0 %	25 %	75 %	218692837
124	NC_011749	GCTG	2	8	40818	40825	0 %	25 %	50 %	25 %	218692838
125	NC_011749	TGGC	2	8	40951	40958	0 %	25 %	50 %	25 %	218692838
126	NC_011749	CCAA	2	8	41266	41273	50 %	0 %	0 %	50 %	218692839
127	NC_011749	AAAG	2	8	41526	41533	75 %	0 %	25 %	0 %	218692839
128	NC_011749	AACT	2	8	41925	41932	50 %	25 %	0 %	25 %	218692839
129	NC_011749	TAGC	2	8	42530	42537	25 %	25 %	25 %	25 %	218692840
130	NC_011749	ATCA	2	8	42887	42894	50 %	25 %	0 %	25 %	218692841
131	NC_011749	TTGT	2	8	42916	42923	0 %	75 %	25 %	0 %	218692841
132	NC_011749	AATT	2	8	43046	43053	50 %	50 %	0 %	0 %	218692841
133	NC_011749	TGAT	2	8	43055	43062	25 %	50 %	25 %	0 %	218692841
134	NC_011749	TGGT	2	8	43095	43102	0 %	50 %	50 %	0 %	218692841
135	NC_011749	TTGG	2	8	43193	43200	0 %	50 %	50 %	0 %	218692841
136	NC_011749	ATAA	2	8	43430	43437	75 %	25 %	0 %	0 %	218692841
137	NC_011749	ATAG	2	8	43439	43446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011749	TTTG	2	8	43776	43783	0 %	75 %	25 %	0 %	218692842
139	NC_011749	AACC	2	8	43857	43864	50 %	0 %	0 %	50 %	218692842
140	NC_011749	TCCA	2	8	44032	44039	25 %	25 %	0 %	50 %	218692842
141	NC_011749	ATAA	2	8	44105	44112	75 %	25 %	0 %	0 %	218692842
142	NC_011749	TAAA	2	8	44134	44141	75 %	25 %	0 %	0 %	218692842
143	NC_011749	AACC	2	8	44355	44362	50 %	0 %	0 %	50 %	218692842
144	NC_011749	GCAA	2	8	44613	44620	50 %	0 %	25 %	25 %	218692842
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146	NC_011749	GGAA	2	8	45630	45637	50 %	0 %	50 %	0 %	218692844
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.