MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	TACC	2	8	192	199	25 %	25 %	0 %	50 %	218692795
2	NC_011749	TGGG	2	8	350	357	0 %	25 %	75 %	0 %	218692795
3	NC_011749	TCAT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	218692795
4	NC_011749	CCAG	2	8	1457	1464	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
5	NC_011749	GGCG	2	8	1730	1737	0 %	0 %	75 %	25 %	218692796
6	NC_011749	CGCA	2	8	1747	1754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
7	NC_011749	CACT	2	8	1908	1915	25 %	25 %	0 %	50 %	218692796
8	NC_011749	CTGG	2	8	3119	3126	0 %	25 %	50 %	25 %	218692797
9	NC_011749	ATCT	2	8	3247	3254	25 %	50 %	0 %	25 %	218692797
10	NC_011749	TTGC	2	8	5831	5838	0 %	50 %	25 %	25 %	218692798
11	NC_011749	CTGG	2	8	5852	5859	0 %	25 %	50 %	25 %	218692798
12	NC_011749	ATCA	2	8	5978	5985	50 %	25 %	0 %	25 %	218692798
13	NC_011749	GGAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	50 %	25 %	218692799
14	NC_011749	ACAG	2	8	6970	6977	50 %	0 %	25 %	25 %	218692799
15	NC_011749	GGAA	2	8	7347	7354	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
16	NC_011749	GGCT	2	8	8070	8077	0 %	25 %	50 %	25 %	218692799
17	NC_011749	GCAA	2	8	8500	8507	50 %	0 %	25 %	25 %	218692800
18	NC_011749	TGGC	2	8	8941	8948	0 %	25 %	50 %	25 %	218692800
19	NC_011749	CAGC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	218692801
20	NC_011749	TCTG	2	8	9816	9823	0 %	50 %	25 %	25 %	218692802
21	NC_011749	CTGA	2	8	10015	10022	25 %	25 %	25 %	25 %	218692802
22	NC_011749	TGAG	2	8	10266	10273	25 %	25 %	50 %	0 %	218692802
23	NC_011749	CAGC	2	8	10761	10768	25 %	0 %	25 %	50 %	218692803
24	NC_011749	GAAT	2	8	11273	11280	50 %	25 %	25 %	0 %	218692803
25	NC_011749	GCGA	2	8	11328	11335	25 %	0 %	50 %	25 %	218692803
26	NC_011749	GGAT	2	8	11708	11715	25 %	25 %	50 %	0 %	218692804
27	NC_011749	GTCA	2	8	11875	11882	25 %	25 %	25 %	25 %	218692804
28	NC_011749	GCCG	2	8	11979	11986	0 %	0 %	50 %	50 %	218692804
29	NC_011749	CCAG	2	8	12967	12974	25 %	0 %	25 %	50 %	218692806
30	NC_011749	CGAG	2	8	13292	13299	25 %	0 %	50 %	25 %	218692807
31	NC_011749	ACCA	2	8	14030	14037	50 %	0 %	0 %	50 %	218692808
32	NC_011749	GCCA	2	8	14168	14175	25 %	0 %	25 %	50 %	218692808
33	NC_011749	CAGC	2	8	15321	15328	25 %	0 %	25 %	50 %	218692808
34	NC_011749	CATC	2	8	18210	18217	25 %	25 %	0 %	50 %	218692809
35	NC_011749	TATT	2	8	18578	18585	25 %	75 %	0 %	0 %	218692809
36	NC_011749	TGGG	2	8	18978	18985	0 %	25 %	75 %	0 %	218692810
37	NC_011749	TCGA	2	8	20023	20030	25 %	25 %	25 %	25 %	218692810
38	NC_011749	CGCC	2	8	20051	20058	0 %	0 %	25 %	75 %	218692810
39	NC_011749	AATT	2	8	20268	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	218692810
40	NC_011749	ATTT	2	8	20339	20346	25 %	75 %	0 %	0 %	218692810
41	NC_011749	GCCA	2	8	20775	20782	25 %	0 %	25 %	50 %	218692810
42	NC_011749	GTCA	2	8	22897	22904	25 %	25 %	25 %	25 %	218692812
43	NC_011749	TCTG	2	8	22947	22954	0 %	50 %	25 %	25 %	218692812
44	NC_011749	ACGT	2	8	23376	23383	25 %	25 %	25 %	25 %	218692813
45	NC_011749	TAAA	2	8	25440	25447	75 %	25 %	0 %	0 %	218692815
46	NC_011749	ACAG	2	8	25471	25478	50 %	0 %	25 %	25 %	218692816
47	NC_011749	AGAA	2	8	25494	25501	75 %	0 %	25 %	0 %	218692816
48	NC_011749	AGCA	2	8	25554	25561	50 %	0 %	25 %	25 %	218692816
49	NC_011749	CTTT	2	8	25812	25819	0 %	75 %	0 %	25 %	218692817
50	NC_011749	CGTC	2	8	26564	26571	0 %	25 %	25 %	50 %	218692819
51	NC_011749	CAGC	2	8	26613	26620	25 %	0 %	25 %	50 %	218692819
52	NC_011749	CAGC	2	8	26747	26754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692819
53	NC_011749	CATT	2	8	26881	26888	25 %	50 %	0 %	25 %	218692820
54	NC_011749	ATCC	2	8	27056	27063	25 %	25 %	0 %	50 %	218692820
55	NC_011749	TGGC	2	8	28659	28666	0 %	25 %	50 %	25 %	218692822
56	NC_011749	GCCA	2	8	29575	29582	25 %	0 %	25 %	50 %	218692823
57	NC_011749	CCGT	2	8	30020	30027	0 %	25 %	25 %	50 %	218692825
58	NC_011749	CGCC	2	8	32736	32743	0 %	0 %	25 %	75 %	218692828
59	NC_011749	GCCA	2	8	32968	32975	25 %	0 %	25 %	50 %	218692829
60	NC_011749	CTGA	2	8	33673	33680	25 %	25 %	25 %	25 %	218692829
61	NC_011749	TCAA	2	8	33878	33885	50 %	25 %	0 %	25 %	218692829
62	NC_011749	CCTC	2	8	34061	34068	0 %	25 %	0 %	75 %	218692830
63	NC_011749	ACCA	2	8	34684	34691	50 %	0 %	0 %	50 %	218692830
64	NC_011749	CGCC	2	8	35024	35031	0 %	0 %	25 %	75 %	218692830
65	NC_011749	GCCC	2	8	35111	35118	0 %	0 %	25 %	75 %	218692830
66	NC_011749	TCAT	2	8	35954	35961	25 %	50 %	0 %	25 %	218692831
67	NC_011749	CAGC	2	8	36233	36240	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
68	NC_011749	CCAG	2	8	36403	36410	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
69	NC_011749	CCAG	2	8	36604	36611	25 %	0 %	25 %	50 %	218692832
70	NC_011749	AGCG	2	8	37742	37749	25 %	0 %	50 %	25 %	218692832
71	NC_011749	TCAA	2	8	37953	37960	50 %	25 %	0 %	25 %	218692832
72	NC_011749	GCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	25 %	25 %	218692833
73	NC_011749	GCCA	2	8	38847	38854	25 %	0 %	25 %	50 %	218692833
74	NC_011749	GCCA	2	8	39782	39789	25 %	0 %	25 %	50 %	218692834
75	NC_011749	CAGC	2	8	39818	39825	25 %	0 %	25 %	50 %	218692834
76	NC_011749	CCGC	2	8	40660	40667	0 %	0 %	25 %	75 %	218692837
77	NC_011749	GCTG	2	8	40818	40825	0 %	25 %	50 %	25 %	218692838
78	NC_011749	TGGC	2	8	40951	40958	0 %	25 %	50 %	25 %	218692838
79	NC_011749	CCAA	2	8	41266	41273	50 %	0 %	0 %	50 %	218692839
80	NC_011749	AAAG	2	8	41526	41533	75 %	0 %	25 %	0 %	218692839
81	NC_011749	AACT	2	8	41925	41932	50 %	25 %	0 %	25 %	218692839
82	NC_011749	TAGC	2	8	42530	42537	25 %	25 %	25 %	25 %	218692840
83	NC_011749	ATCA	2	8	42887	42894	50 %	25 %	0 %	25 %	218692841
84	NC_011749	TTGT	2	8	42916	42923	0 %	75 %	25 %	0 %	218692841
85	NC_011749	AATT	2	8	43046	43053	50 %	50 %	0 %	0 %	218692841
86	NC_011749	TGAT	2	8	43055	43062	25 %	50 %	25 %	0 %	218692841
87	NC_011749	TGGT	2	8	43095	43102	0 %	50 %	50 %	0 %	218692841
88	NC_011749	TTGG	2	8	43193	43200	0 %	50 %	50 %	0 %	218692841
89	NC_011749	ATAA	2	8	43430	43437	75 %	25 %	0 %	0 %	218692841
90	NC_011749	TTTG	2	8	43776	43783	0 %	75 %	25 %	0 %	218692842
91	NC_011749	AACC	2	8	43857	43864	50 %	0 %	0 %	50 %	218692842
92	NC_011749	TCCA	2	8	44032	44039	25 %	25 %	0 %	50 %	218692842
93	NC_011749	ATAA	2	8	44105	44112	75 %	25 %	0 %	0 %	218692842
94	NC_011749	TAAA	2	8	44134	44141	75 %	25 %	0 %	0 %	218692842
95	NC_011749	AACC	2	8	44355	44362	50 %	0 %	0 %	50 %	218692842
96	NC_011749	GCAA	2	8	44613	44620	50 %	0 %	25 %	25 %	218692842
97	NC_011749	AGCC	2	8	45384	45391	25 %	0 %	25 %	50 %	218692843
98	NC_011749	GGAA	2	8	45630	45637	50 %	0 %	50 %	0 %	218692844
99	NC_011749	CATC	2	8	46016	46023	25 %	25 %	0 %	50 %	218692844
100	NC_011749	TCCC	2	8	46419	46426	0 %	25 %	0 %	75 %	218692845
101	NC_011749	GCCA	2	8	46965	46972	25 %	0 %	25 %	50 %	218692846
102	NC_011749	CAGC	2	8	47098	47105	25 %	0 %	25 %	50 %	218692846
103	NC_011749	GCGG	2	8	47256	47263	0 %	0 %	75 %	25 %	218692846
104	NC_011749	GCCA	2	8	47996	48003	25 %	0 %	25 %	50 %	218692848
105	NC_011749	CAGC	2	8	48129	48136	25 %	0 %	25 %	50 %	218692848
106	NC_011749	GCGG	2	8	48287	48294	0 %	0 %	75 %	25 %	218692848
107	NC_011749	CAGG	2	8	48960	48967	25 %	0 %	50 %	25 %	218692851
108	NC_011749	CAGC	2	8	50034	50041	25 %	0 %	25 %	50 %	218692854
109	NC_011749	TGTT	2	8	51345	51352	0 %	75 %	25 %	0 %	218692855
110	NC_011749	GGTA	2	8	51484	51491	25 %	25 %	50 %	0 %	218692855
111	NC_011749	TTTC	2	8	52212	52219	0 %	75 %	0 %	25 %	218692856
112	NC_011749	GCCT	2	8	52789	52796	0 %	25 %	25 %	50 %	218692857
113	NC_011749	TGGC	2	8	52846	52853	0 %	25 %	50 %	25 %	218692857
114	NC_011749	GAAC	2	8	52884	52891	50 %	0 %	25 %	25 %	218692857
115	NC_011749	TTTA	2	8	53562	53569	25 %	75 %	0 %	0 %	218692859
116	NC_011749	CATT	2	8	53724	53731	25 %	50 %	0 %	25 %	218692859
117	NC_011749	ATAA	2	8	53993	54000	75 %	25 %	0 %	0 %	218692859
118	NC_011749	GGCA	2	8	54744	54751	25 %	0 %	50 %	25 %	218692861
119	NC_011749	ATTC	2	8	55698	55705	25 %	50 %	0 %	25 %	218692862
120	NC_011749	GCTG	2	8	55746	55753	0 %	25 %	50 %	25 %	218692862
121	NC_011749	CCAC	2	8	56531	56538	25 %	0 %	0 %	75 %	218692863
122	NC_011749	CAGC	2	8	57167	57174	25 %	0 %	25 %	50 %	218692863
123	NC_011749	CAGC	2	8	57473	57480	25 %	0 %	25 %	50 %	218692864
124	NC_011749	CCTG	2	8	57715	57722	0 %	25 %	25 %	50 %	218692864
125	NC_011749	ACCG	2	8	59136	59143	25 %	0 %	25 %	50 %	218692864
126	NC_011749	CAGG	2	8	59951	59958	25 %	0 %	50 %	25 %	218692864
127	NC_011749	GCCC	2	8	59971	59978	0 %	0 %	25 %	75 %	218692864
128	NC_011749	TCGC	2	8	60078	60085	0 %	25 %	25 %	50 %	218692864
129	NC_011749	CCGG	2	8	60107	60114	0 %	0 %	50 %	50 %	218692864
130	NC_011749	CGGT	2	8	60273	60280	0 %	25 %	50 %	25 %	218692864
131	NC_011749	CCAG	2	8	60311	60318	25 %	0 %	25 %	50 %	218692864
132	NC_011749	GCGA	2	8	60812	60819	25 %	0 %	50 %	25 %	218692864
133	NC_011749	GACG	2	8	60934	60941	25 %	0 %	50 %	25 %	218692864
134	NC_011749	CGGA	2	8	61051	61058	25 %	0 %	50 %	25 %	218692864
135	NC_011749	TGCG	2	8	61318	61325	0 %	25 %	50 %	25 %	218692864
136	NC_011749	ACTC	2	8	61619	61626	25 %	25 %	0 %	50 %	218692864
137	NC_011749	GTCC	2	8	61841	61848	0 %	25 %	25 %	50 %	218692864
138	NC_011749	CTGC	2	8	62194	62201	0 %	25 %	25 %	50 %	218692864
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.