MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	CTG	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011749	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011749	GCA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011749	GGC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011749	ATA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011749	TAT	2	6	2440	2445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011749	ATC	2	6	2528	2533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011749	GAC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011749	AAT	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011749	GAG	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011749	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011749	ATT	2	6	4028	4033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011749	TGA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011749	ACC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011749	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011749	AGA	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011749	ATA	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011749	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011749	ATG	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011749	TAT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011749	ATG	2	6	4904	4909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011749	TAG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011749	ATA	2	6	5143	5148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011749	TGT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011749	GTT	2	6	5180	5185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011749	ATA	2	6	5210	5215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011749	AAC	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011749	ACC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011749	CTG	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011749	CCT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011749	ATC	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011749	TAA	2	6	6220	6225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011749	GCA	2	6	9070	9075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011749	CGG	2	6	9631	9636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011749	GGC	2	6	9651	9656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011749	ACG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011749	CCA	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011749	CCA	2	6	13414	13419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011749	GAC	2	6	13474	13479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011749	ATG	2	6	13776	13781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011749	GAC	2	6	13793	13798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011749	CTC	2	6	13858	13863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011749	ACT	2	6	15520	15525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011749	GAG	2	6	15622	15627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011749	GCT	2	6	15698	15703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011749	TCC	2	6	15769	15774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011749	GTG	2	6	15802	15807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011749	TTC	2	6	15846	15851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011749	ATC	2	6	15877	15882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011749	TTG	2	6	15991	15996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011749	AAC	2	6	16277	16282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011749	TGA	2	6	16313	16318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011749	GAT	2	6	16392	16397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011749	CAG	2	6	16489	16494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011749	GCG	2	6	16572	16577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011749	GGT	2	6	16626	16631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011749	GCG	2	6	17054	17059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011749	CCG	2	6	17073	17078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011749	GAA	2	6	17109	17114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011749	CTG	2	6	17134	17139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011749	GCT	2	6	17255	17260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011749	AAT	2	6	17313	17318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011749	ACT	2	6	17411	17416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011749	AAT	2	6	17418	17423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011749	ATT	2	6	17504	17509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011749	GCG	2	6	17578	17583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011749	TAA	2	6	21207	21212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011749	CAA	2	6	23108	23113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011749	GAA	2	6	23300	23305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011749	ATT	2	6	24357	24362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011749	ACC	2	6	24433	24438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011749	TAA	2	6	24530	24535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011749	CAA	2	6	24558	24563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011749	CTG	2	6	24691	24696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011749	AAT	2	6	24790	24795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011749	AGC	2	6	24800	24805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011749	TAA	2	6	24840	24845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011749	ATT	2	6	24858	24863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011749	AAG	2	6	24869	24874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011749	TAT	2	6	24948	24953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011749	ATA	2	6	24963	24968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011749	GAA	2	6	25025	25030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011749	CTG	2	6	27495	27500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011749	CAT	2	6	27591	27596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011749	GAA	2	6	27638	27643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011749	ATC	2	6	27670	27675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011749	GTT	2	6	27707	27712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011749	CAA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011749	GAT	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011749	GAA	2	6	28138	28143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011749	CAC	2	6	28182	28187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011749	AGG	2	6	28214	28219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011749	GCA	2	6	28284	28289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011749	CCT	2	6	28361	28366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011749	GTA	2	6	28462	28467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011749	TGG	2	6	29086	29091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011749	TTG	2	6	29859	29864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011749	AGA	2	6	29937	29942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011749	CGT	2	6	30472	30477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011749	CGG	2	6	35451	35456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011749	TCC	2	6	35512	35517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011749	AAC	2	6	36088	36093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011749	ATT	2	6	38077	38082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011749	CAG	2	6	38130	38135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011749	TCA	2	6	38159	38164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011749	TGA	2	6	38170	38175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011749	ATT	2	6	38287	38292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011749	TAA	2	6	39227	39232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011749	GCA	2	6	39250	39255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011749	AAT	2	6	40329	40334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011749	ACA	2	6	40338	40343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011749	TGC	2	6	40405	40410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011749	ATG	2	6	40430	40435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011749	TCT	2	6	43465	43470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011749	CAT	2	6	43529	43534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011749	CAA	2	6	44815	44820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011749	CCA	2	6	46664	46669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011749	CAT	2	6	47488	47493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011749	GCA	2	6	47513	47518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011749	AAG	2	6	47524	47529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011749	TCG	2	6	47689	47694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011749	CAT	2	6	48519	48524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011749	GCA	2	6	48544	48549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011749	ACT	2	6	48639	48644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011749	GGC	2	6	50197	50202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011749	TGT	2	6	50207	50212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011749	CCG	2	6	50235	50240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011749	CGA	2	6	50356	50361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011749	ACA	2	6	50473	50478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011749	GAG	2	6	50542	50547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011749	CGC	2	6	50637	50642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011749	AGT	2	6	50719	50724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011749	GAT	2	6	50916	50921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011749	GTT	2	6	50925	50930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011749	TCC	2	6	50984	50989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011749	ATT	2	6	51002	51007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011749	GAG	2	6	51010	51015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011749	TTG	2	6	51974	51979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011749	TCT	2	6	52009	52014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011749	TCG	2	6	52015	52020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011749	AAG	2	6	52165	52170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_011749	GCG	2	6	118641	118646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_011749	TTA	2	6	118682	118687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.