MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	AC	3	6	10	15	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011749	TG	3	6	432	437	0 %	50 %	50 %	0 %	218692795
3	NC_011749	AG	3	6	730	735	50 %	0 %	50 %	0 %	218692795
4	NC_011749	AG	3	6	1099	1104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011749	TA	3	6	1298	1303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011749	GC	3	6	2150	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011749	CT	3	6	2707	2712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011749	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	218692797
9	NC_011749	AT	3	6	4066	4071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011749	AT	3	6	4118	4123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011749	CA	3	6	4324	4329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011749	AT	3	6	4341	4346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011749	AC	3	6	4397	4402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011749	TG	3	6	4791	4796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011749	AT	3	6	5024	5029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011749	TA	3	6	5121	5126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011749	TA	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011749	AT	3	6	5357	5362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011749	AT	3	6	6256	6261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011749	GA	3	6	6758	6763	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
21	NC_011749	GC	3	6	6912	6917	0 %	0 %	50 %	50 %	218692799
22	NC_011749	CG	3	6	7781	7786	0 %	0 %	50 %	50 %	218692799
23	NC_011749	AC	3	6	7958	7963	50 %	0 %	0 %	50 %	218692799
24	NC_011749	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	218692800
25	NC_011749	TG	3	6	8987	8992	0 %	50 %	50 %	0 %	218692800
26	NC_011749	GA	3	6	10922	10927	50 %	0 %	50 %	0 %	218692803
27	NC_011749	CG	3	6	11036	11041	0 %	0 %	50 %	50 %	218692803
28	NC_011749	GA	4	8	11263	11270	50 %	0 %	50 %	0 %	218692803
29	NC_011749	CT	3	6	12368	12373	0 %	50 %	0 %	50 %	218692805
30	NC_011749	CT	3	6	12378	12383	0 %	50 %	0 %	50 %	218692805
31	NC_011749	TC	3	6	13437	13442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011749	TG	3	6	13614	13619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011749	GC	3	6	16237	16242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011749	GT	3	6	16924	16929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011749	GA	3	6	16931	16936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011749	CG	3	6	17118	17123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011749	TG	3	6	17956	17961	0 %	50 %	50 %	0 %	218692809
38	NC_011749	GT	3	6	18509	18514	0 %	50 %	50 %	0 %	218692809
39	NC_011749	AG	3	6	18884	18889	50 %	0 %	50 %	0 %	218692809
40	NC_011749	CG	3	6	18964	18969	0 %	0 %	50 %	50 %	218692810
41	NC_011749	AG	3	6	19362	19367	50 %	0 %	50 %	0 %	218692810
42	NC_011749	GC	3	6	19744	19749	0 %	0 %	50 %	50 %	218692810
43	NC_011749	GT	3	6	19916	19921	0 %	50 %	50 %	0 %	218692810
44	NC_011749	CG	3	6	19952	19957	0 %	0 %	50 %	50 %	218692810
45	NC_011749	AT	3	6	20434	20439	50 %	50 %	0 %	0 %	218692810
46	NC_011749	AG	3	6	22375	22380	50 %	0 %	50 %	0 %	218692812
47	NC_011749	AC	3	6	22722	22727	50 %	0 %	0 %	50 %	218692812
48	NC_011749	AT	3	6	23040	23045	50 %	50 %	0 %	0 %	218692812
49	NC_011749	GC	3	6	23328	23333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011749	TG	3	6	23387	23392	0 %	50 %	50 %	0 %	218692813
51	NC_011749	GC	3	6	23638	23643	0 %	0 %	50 %	50 %	218692814
52	NC_011749	CA	3	6	23781	23786	50 %	0 %	0 %	50 %	218692814
53	NC_011749	TG	3	6	24268	24273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011749	TC	3	6	24308	24313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011749	AT	3	6	24782	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011749	TA	3	6	25502	25507	50 %	50 %	0 %	0 %	218692816
57	NC_011749	AG	3	6	25679	25684	50 %	0 %	50 %	0 %	218692816
58	NC_011749	AT	3	6	25741	25746	50 %	50 %	0 %	0 %	218692816
59	NC_011749	GC	3	6	26599	26604	0 %	0 %	50 %	50 %	218692819
60	NC_011749	GC	3	6	27747	27752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011749	GA	3	6	29049	29054	50 %	0 %	50 %	0 %	218692822
62	NC_011749	TA	3	6	29522	29527	50 %	50 %	0 %	0 %	218692823
63	NC_011749	GC	4	8	29714	29721	0 %	0 %	50 %	50 %	218692824
64	NC_011749	AT	3	6	30191	30196	50 %	50 %	0 %	0 %	218692825
65	NC_011749	TC	3	6	30460	30465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011749	GC	3	6	30493	30498	0 %	0 %	50 %	50 %	218692826
67	NC_011749	AC	4	8	31187	31194	50 %	0 %	0 %	50 %	218692827
68	NC_011749	CG	3	6	31689	31694	0 %	0 %	50 %	50 %	218692828
69	NC_011749	CG	3	6	31937	31942	0 %	0 %	50 %	50 %	218692828
70	NC_011749	AG	3	6	31989	31994	50 %	0 %	50 %	0 %	218692828
71	NC_011749	CG	4	8	33314	33321	0 %	0 %	50 %	50 %	218692829
72	NC_011749	CT	3	6	33910	33915	0 %	50 %	0 %	50 %	218692829
73	NC_011749	AG	3	6	34605	34610	50 %	0 %	50 %	0 %	218692830
74	NC_011749	CG	3	6	35904	35909	0 %	0 %	50 %	50 %	218692831
75	NC_011749	GC	3	6	36623	36628	0 %	0 %	50 %	50 %	218692832
76	NC_011749	GC	3	6	36976	36981	0 %	0 %	50 %	50 %	218692832
77	NC_011749	GC	3	6	37178	37183	0 %	0 %	50 %	50 %	218692832
78	NC_011749	GC	3	6	37727	37732	0 %	0 %	50 %	50 %	218692832
79	NC_011749	GC	3	6	37811	37816	0 %	0 %	50 %	50 %	218692832
80	NC_011749	AG	3	6	38011	38016	50 %	0 %	50 %	0 %	218692832
81	NC_011749	AC	4	8	38176	38183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011749	CG	3	6	38827	38832	0 %	0 %	50 %	50 %	218692833
83	NC_011749	CT	3	6	40372	40377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011749	CA	3	6	42300	42305	50 %	0 %	0 %	50 %	218692839
85	NC_011749	TC	3	6	42336	42341	0 %	50 %	0 %	50 %	218692840
86	NC_011749	TC	3	6	44293	44298	0 %	50 %	0 %	50 %	218692842
87	NC_011749	AT	3	6	45971	45976	50 %	50 %	0 %	0 %	218692844
88	NC_011749	AT	3	6	47664	47669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011749	AC	3	6	49916	49921	50 %	0 %	0 %	50 %	218692854
90	NC_011749	TA	3	6	50134	50139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011749	GA	3	6	50324	50329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011749	AG	3	6	50889	50894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011749	CA	3	6	53970	53975	50 %	0 %	0 %	50 %	218692859
94	NC_011749	AT	3	6	54011	54016	50 %	50 %	0 %	0 %	218692859
95	NC_011749	CA	3	6	54083	54088	50 %	0 %	0 %	50 %	218692859
96	NC_011749	CA	3	6	54765	54770	50 %	0 %	0 %	50 %	218692861
97	NC_011749	GT	3	6	54894	54899	0 %	50 %	50 %	0 %	218692861
98	NC_011749	CT	3	6	55487	55492	0 %	50 %	0 %	50 %	218692862
99	NC_011749	CT	3	6	55689	55694	0 %	50 %	0 %	50 %	218692862
100	NC_011749	TC	3	6	55707	55712	0 %	50 %	0 %	50 %	218692862
101	NC_011749	AG	3	6	56107	56112	50 %	0 %	50 %	0 %	218692862
102	NC_011749	CT	3	6	57484	57489	0 %	50 %	0 %	50 %	218692864
103	NC_011749	AC	3	6	58349	58354	50 %	0 %	0 %	50 %	218692864
104	NC_011749	GA	3	6	58396	58401	50 %	0 %	50 %	0 %	218692864
105	NC_011749	TG	3	6	59227	59232	0 %	50 %	50 %	0 %	218692864
106	NC_011749	CT	3	6	59348	59353	0 %	50 %	0 %	50 %	218692864
107	NC_011749	TG	3	6	59848	59853	0 %	50 %	50 %	0 %	218692864
108	NC_011749	CT	3	6	60439	60444	0 %	50 %	0 %	50 %	218692864
109	NC_011749	AT	3	6	61629	61634	50 %	50 %	0 %	0 %	218692864
110	NC_011749	GT	3	6	61756	61761	0 %	50 %	50 %	0 %	218692864
111	NC_011749	AG	4	8	62847	62854	50 %	0 %	50 %	0 %	218692865
112	NC_011749	CA	3	6	63264	63269	50 %	0 %	0 %	50 %	218692865
113	NC_011749	GT	3	6	63604	63609	0 %	50 %	50 %	0 %	218692865
114	NC_011749	AT	3	6	64224	64229	50 %	50 %	0 %	0 %	218692865
115	NC_011749	CA	4	8	64987	64994	50 %	0 %	0 %	50 %	218692866
116	NC_011749	GA	3	6	65098	65103	50 %	0 %	50 %	0 %	218692866
117	NC_011749	GA	3	6	66544	66549	50 %	0 %	50 %	0 %	218692868
118	NC_011749	TA	3	6	66572	66577	50 %	50 %	0 %	0 %	218692868
119	NC_011749	GA	3	6	66634	66639	50 %	0 %	50 %	0 %	218692868
120	NC_011749	TG	3	6	68127	68132	0 %	50 %	50 %	0 %	218692869
121	NC_011749	AC	3	6	68311	68316	50 %	0 %	0 %	50 %	218692869
122	NC_011749	TG	3	6	68943	68948	0 %	50 %	50 %	0 %	218692869
123	NC_011749	CA	3	6	69125	69130	50 %	0 %	0 %	50 %	218692869
124	NC_011749	AC	3	6	69927	69932	50 %	0 %	0 %	50 %	218692870
125	NC_011749	TG	3	6	70859	70864	0 %	50 %	50 %	0 %	218692870
126	NC_011749	AT	4	8	71282	71289	50 %	50 %	0 %	0 %	218692871
127	NC_011749	AT	3	6	71424	71429	50 %	50 %	0 %	0 %	218692872
128	NC_011749	GT	3	6	71730	71735	0 %	50 %	50 %	0 %	218692873
129	NC_011749	GA	3	6	72163	72168	50 %	0 %	50 %	0 %	218692873
130	NC_011749	TG	3	6	72498	72503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011749	AG	3	6	72574	72579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011749	AT	3	6	73179	73184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011749	TG	3	6	75028	75033	0 %	50 %	50 %	0 %	218692877
134	NC_011749	TC	3	6	76561	76566	0 %	50 %	0 %	50 %	218692878
135	NC_011749	GT	3	6	76618	76623	0 %	50 %	50 %	0 %	218692878
136	NC_011749	AT	3	6	76827	76832	50 %	50 %	0 %	0 %	218692879
137	NC_011749	AT	3	6	76988	76993	50 %	50 %	0 %	0 %	218692879
138	NC_011749	CT	3	6	79158	79163	0 %	50 %	0 %	50 %	218692883
139	NC_011749	TG	3	6	79477	79482	0 %	50 %	50 %	0 %	218692883
140	NC_011749	CA	3	6	80102	80107	50 %	0 %	0 %	50 %	218692883
141	NC_011749	CT	3	6	80365	80370	0 %	50 %	0 %	50 %	218692883
142	NC_011749	GC	3	6	80371	80376	0 %	0 %	50 %	50 %	218692883
143	NC_011749	AC	3	6	80959	80964	50 %	0 %	0 %	50 %	218692883
144	NC_011749	TG	3	6	81079	81084	0 %	50 %	50 %	0 %	218692883
145	NC_011749	CG	3	6	81395	81400	0 %	0 %	50 %	50 %	218692883
146	NC_011749	AT	3	6	81728	81733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011749	AT	3	6	81999	82004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011749	AT	3	6	82657	82662	50 %	50 %	0 %	0 %	218692886
149	NC_011749	AT	3	6	82753	82758	50 %	50 %	0 %	0 %	218692886
150	NC_011749	CG	3	6	84513	84518	0 %	0 %	50 %	50 %	218692891
151	NC_011749	GC	3	6	85208	85213	0 %	0 %	50 %	50 %	218692892
152	NC_011749	GC	3	6	86271	86276	0 %	0 %	50 %	50 %	218692893
153	NC_011749	AT	3	6	87215	87220	50 %	50 %	0 %	0 %	218692894
154	NC_011749	AG	3	6	87427	87432	50 %	0 %	50 %	0 %	218692894
155	NC_011749	AG	3	6	87900	87905	50 %	0 %	50 %	0 %	218692896
156	NC_011749	GA	3	6	89292	89297	50 %	0 %	50 %	0 %	218692898
157	NC_011749	CT	3	6	89936	89941	0 %	50 %	0 %	50 %	218692900
158	NC_011749	TA	3	6	90260	90265	50 %	50 %	0 %	0 %	218692900
159	NC_011749	CT	3	6	90267	90272	0 %	50 %	0 %	50 %	218692900
160	NC_011749	CA	3	6	90454	90459	50 %	0 %	0 %	50 %	218692900
161	NC_011749	GT	3	6	91364	91369	0 %	50 %	50 %	0 %	218692902
162	NC_011749	CA	4	8	92023	92030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_011749	TA	4	8	92091	92098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011749	CT	4	8	93505	93512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_011749	AC	3	6	94520	94525	50 %	0 %	0 %	50 %	218692905
166	NC_011749	AC	4	8	94531	94538	50 %	0 %	0 %	50 %	218692905
167	NC_011749	AG	3	6	94545	94550	50 %	0 %	50 %	0 %	218692905
168	NC_011749	CA	3	6	94680	94685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_011749	GT	3	6	95892	95897	0 %	50 %	50 %	0 %	218692907
170	NC_011749	CA	3	6	96107	96112	50 %	0 %	0 %	50 %	218692908
171	NC_011749	CG	3	6	97384	97389	0 %	0 %	50 %	50 %	218692908
172	NC_011749	CT	3	6	98060	98065	0 %	50 %	0 %	50 %	218692908
173	NC_011749	TC	3	6	98304	98309	0 %	50 %	0 %	50 %	218692909
174	NC_011749	GC	3	6	98654	98659	0 %	0 %	50 %	50 %	218692910
175	NC_011749	CG	3	6	99648	99653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
176	NC_011749	CG	3	6	99761	99766	0 %	0 %	50 %	50 %	218692911
177	NC_011749	CA	3	6	100040	100045	50 %	0 %	0 %	50 %	218692911
178	NC_011749	GC	3	6	100231	100236	0 %	0 %	50 %	50 %	218692911
179	NC_011749	TC	3	6	101439	101444	0 %	50 %	0 %	50 %	218692912
180	NC_011749	CG	3	6	101614	101619	0 %	0 %	50 %	50 %	218692912
181	NC_011749	GT	3	6	102453	102458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011749	CG	3	6	102884	102889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_011749	GC	3	6	103296	103301	0 %	0 %	50 %	50 %	218692914
184	NC_011749	GT	3	6	103667	103672	0 %	50 %	50 %	0 %	218692915
185	NC_011749	GA	3	6	103956	103961	50 %	0 %	50 %	0 %	218692915
186	NC_011749	CA	3	6	104583	104588	50 %	0 %	0 %	50 %	218692916
187	NC_011749	GT	4	8	105251	105258	0 %	50 %	50 %	0 %	218692917
188	NC_011749	GC	3	6	105512	105517	0 %	0 %	50 %	50 %	218692917
189	NC_011749	AG	3	6	105566	105571	50 %	0 %	50 %	0 %	218692917
190	NC_011749	CA	3	6	105845	105850	50 %	0 %	0 %	50 %	218692918
191	NC_011749	TG	3	6	106108	106113	0 %	50 %	50 %	0 %	218692919
192	NC_011749	CA	3	6	107437	107442	50 %	0 %	0 %	50 %	218692920
193	NC_011749	TG	4	8	108231	108238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011749	TA	3	6	108260	108265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011749	TA	3	6	108858	108863	50 %	50 %	0 %	0 %	218692922
196	NC_011749	CT	3	6	108943	108948	0 %	50 %	0 %	50 %	218692922
197	NC_011749	TA	3	6	109005	109010	50 %	50 %	0 %	0 %	218692922
198	NC_011749	CG	3	6	109098	109103	0 %	0 %	50 %	50 %	218692922
199	NC_011749	TG	3	6	110096	110101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
200	NC_011749	TG	3	6	110976	110981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_011749	CG	3	6	110984	110989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
202	NC_011749	TC	3	6	111211	111216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_011749	CA	3	6	111817	111822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
204	NC_011749	AG	3	6	112003	112008	50 %	0 %	50 %	0 %	218692926
205	NC_011749	TG	3	6	112522	112527	0 %	50 %	50 %	0 %	218692926
206	NC_011749	TG	3	6	112967	112972	0 %	50 %	50 %	0 %	218692926
207	NC_011749	AG	3	6	113685	113690	50 %	0 %	50 %	0 %	218692927
208	NC_011749	GA	3	6	113860	113865	50 %	0 %	50 %	0 %	218692927
209	NC_011749	AT	3	6	114276	114281	50 %	50 %	0 %	0 %	218692928
210	NC_011749	GT	3	6	114640	114645	0 %	50 %	50 %	0 %	218692928
211	NC_011749	AC	3	6	115046	115051	50 %	0 %	0 %	50 %	218692929
212	NC_011749	CA	3	6	115853	115858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
213	NC_011749	GA	3	6	116337	116342	50 %	0 %	50 %	0 %	218692930
214	NC_011749	GC	3	6	116613	116618	0 %	0 %	50 %	50 %	218692931
215	NC_011749	TC	3	6	116658	116663	0 %	50 %	0 %	50 %	218692931
216	NC_011749	GC	3	6	117493	117498	0 %	0 %	50 %	50 %	218692932
217	NC_011749	CT	4	8	118010	118017	0 %	50 %	0 %	50 %	218692933
218	NC_011749	TA	3	6	118305	118310	50 %	50 %	0 %	0 %	218692934
219	NC_011749	GC	3	6	118331	118336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
220	NC_011749	AC	3	6	119606	119611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
221	NC_011749	AT	3	6	120341	120346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_011749	TC	4	8	120389	120396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
223	NC_011749	TC	3	6	120655	120660	0 %	50 %	0 %	50 %	218692935
224	NC_011749	AT	3	6	121948	121953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.