MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 55989 chromosome

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011748	GAAAAT	2	12	10625	10636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011748	TTTCAC	2	12	19611	19622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011748	TATTAA	2	12	21381	21392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011748	AAGGGA	2	12	84751	84762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011748	TCTCCC	2	12	164645	164656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011748	TCACCC	2	12	164696	164707	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011748	GTAGTG	2	12	199645	199656	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011748	TACACG	2	12	266386	266397	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011748	TGTCGC	2	12	267927	267938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011748	TAGAAA	2	12	311403	311414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011748	GTGCAG	2	12	311757	311768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011748	TAAGGG	2	12	326105	326116	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011748	TTTTCT	2	12	336951	336962	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011748	CTATTT	2	12	337987	337998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011748	TTTATT	2	12	369644	369655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011748	TATTGA	2	12	410713	410724	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011748	ACAGGC	2	12	427709	427720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011748	CACGCC	2	12	428136	428147	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011748	GTGATG	2	12	428217	428228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011748	AACAAT	2	12	432483	432494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011748	TATTGA	2	12	435383	435394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011748	TTTTCA	2	12	499790	499801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011748	CAGGCG	2	12	518632	518643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011748	TGCAAA	2	12	628216	628227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011748	GCGCCC	2	12	697303	697314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011748	ATTTTT	2	12	725602	725613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011748	TTTACC	2	12	736513	736524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011748	TTTTCT	2	12	808808	808819	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011748	TGCTAT	2	12	815411	815422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011748	CAATAT	2	12	815486	815497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011748	TCGCCG	2	12	835654	835665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011748	CAGGAG	2	12	835943	835954	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011748	CAGAAA	2	12	893223	893234	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011748	TAACCG	2	12	984237	984248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011748	AAATAA	2	12	1016038	1016049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011748	AAAGAT	2	12	1049846	1049857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011748	TGTCCA	2	12	1070645	1070656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011748	ATAATG	2	12	1094326	1094337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011748	GTTTTT	2	12	1107828	1107839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011748	ATCAGC	2	12	1204100	1204111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011748	CAAAAA	2	12	1231360	1231371	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011748	TTTTGT	2	12	1314545	1314556	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011748	ACGCTT	2	12	1335960	1335971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011748	ACTCGA	2	12	1335980	1335991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011748	CAGGCT	2	12	1336112	1336123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011748	CTTATT	2	12	1387195	1387206	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011748	CAAAAG	2	12	1394096	1394107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011748	CTGATC	2	12	1404574	1404585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011748	GTTTTT	2	12	1420522	1420533	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011748	CTATAA	2	12	1498992	1499003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011748	CAGGCG	2	12	1518694	1518705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011748	ATTAAT	2	12	1636943	1636954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011748	AAAAAC	2	12	1668122	1668133	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011748	ATTAAT	2	12	1668811	1668822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011748	ACCGTT	2	12	1682995	1683006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011748	TGGTTA	2	12	1691825	1691836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011748	TTTCTG	2	12	1732341	1732352	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011748	CAAAAA	2	12	1751506	1751517	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011748	TTAAAT	2	12	1753305	1753316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011748	ATAAAA	2	12	1780429	1780440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011748	TGACAG	2	12	1780820	1780831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011748	AAAAAC	2	12	1789594	1789605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011748	ATACTT	2	12	1889763	1889774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011748	AAAATA	2	12	1903420	1903431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011748	TGTTTT	2	12	1904053	1904064	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011748	AAGACT	2	12	1904313	1904324	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011748	GAACAG	2	12	1952094	1952105	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011748	TATTAC	2	12	2020344	2020355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011748	TTTCTT	2	12	2040332	2040343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011748	ATAACC	2	12	2044276	2044287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011748	ACTGTC	2	12	2088710	2088721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011748	AATTCA	2	12	2136924	2136935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011748	GGTAAT	2	12	2167003	2167014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011748	CAGCGC	2	12	2167491	2167502	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011748	ATACAA	2	12	2177663	2177674	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011748	TCTTAT	2	12	2186386	2186397	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011748	ACAGAC	2	12	2265866	2265877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011748	ATTTTT	2	12	2272638	2272649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011748	GCACAG	2	12	2299503	2299514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011748	CATTAA	2	12	2336316	2336327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011748	TTTTGT	2	12	2353177	2353188	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011748	TCCCCC	2	12	2383031	2383042	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_011748	CGGAAC	2	12	2404702	2404713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011748	ACGCAG	2	12	2449575	2449586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011748	TCTTCC	2	12	2479237	2479248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011748	CCACTA	2	12	2555707	2555718	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011748	TAAATG	2	12	2604500	2604511	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011748	TGTCAC	2	12	2618134	2618145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011748	AGAAAA	2	12	2628426	2628437	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011748	GTTAAC	2	12	2708570	2708581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011748	GTTAAC	2	12	2708634	2708645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011748	CTGATG	2	12	2727383	2727394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011748	GTTATG	2	12	2745224	2745235	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011748	CAAGTG	2	12	2762336	2762347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011748	TGCTGG	2	12	2827916	2827927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011748	GGGGCT	2	12	2828355	2828366	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011748	TCCTTC	2	12	2863148	2863159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011748	TGGACA	2	12	2912777	2912788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011748	CAGTTT	2	12	2927381	2927392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011748	TTTTAC	2	12	2993710	2993721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011748	AGGGAG	2	12	3004814	3004825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011748	ATCTTA	2	12	3070465	3070476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011748	CGGTTT	2	12	3120117	3120128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011748	CGGTTT	2	12	3120239	3120250	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011748	GGGCTG	2	12	3133816	3133827	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011748	GGTTTT	2	12	3135341	3135352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011748	ACAAGA	2	12	3139672	3139683	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011748	AATTTT	2	12	3212228	3212239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011748	ATCGCG	2	12	3265114	3265125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011748	GTAAGG	2	12	3281963	3281974	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011748	GTAAGG	2	12	3282355	3282366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011748	ACTGAG	2	12	3310434	3310445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011748	TTGAAG	2	12	3342366	3342377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011748	ATCCGG	2	12	3431092	3431103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011748	CGTCAC	2	12	3447686	3447697	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011748	TTTCTC	2	12	3447720	3447731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011748	TTTTCG	2	12	3475956	3475967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011748	ATTTAA	2	12	3485381	3485392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011748	TTATAT	2	12	3535479	3535490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011748	CACCCC	2	12	3551973	3551984	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
121	NC_011748	AGTTGT	2	12	3559763	3559774	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011748	CTTTTT	2	12	3564439	3564450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011748	AATGAT	2	12	3565274	3565285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011748	TCTCCC	2	12	3587885	3587896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011748	GTAACC	2	12	3619638	3619649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.