MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	TATCCA	2	12	1900	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218534479
2	NC_011747	GTGTCA	2	12	2098	2109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218534479
3	NC_011747	CTGCCA	2	12	9907	9918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218534488
4	NC_011747	CGGCAG	2	12	9928	9939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218534488
5	NC_011747	AATTGA	2	12	24752	24763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218534505
6	NC_011747	GATATG	2	12	24994	25005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534505
7	NC_011747	TCATTG	2	12	29099	29110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218534509
8	NC_011747	AGTAAT	2	12	29302	29313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218534509
9	NC_011747	GTGATG	2	12	34840	34851	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218534517
10	NC_011747	TCAGCA	2	12	37280	37291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218534519
11	NC_011747	GGCAGA	2	12	37685	37696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218534519
12	NC_011747	CAGTTA	2	12	41355	41366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218534523
13	NC_011747	GGCGCT	2	12	43287	43298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	218534525
14	NC_011747	GTGGCG	2	12	43408	43419	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218534525
15	NC_011747	GCCGGA	2	12	43659	43670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	218534525
16	NC_011747	CACTGG	2	12	45053	45064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218534526
17	NC_011747	TGGCAG	2	12	45729	45740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218534527
18	NC_011747	AGCTAT	2	12	47349	47360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218534530
19	NC_011747	TTGAAA	2	12	50129	50140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218534534
20	NC_011747	TGGAAA	2	12	57431	57442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218534546
21	NC_011747	ATCACC	2	12	59083	59094	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218534546
22	NC_011747	GTCAAC	2	12	66181	66192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218534555
23	NC_011747	TCTGTT	2	12	66440	66451	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218534556
24	NC_011747	GGCAGG	2	12	66734	66745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	218534557
25	NC_011747	ACATCA	2	12	67241	67252	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218534557
26	NC_011747	GCAGGT	2	12	67836	67847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218534557
27	NC_011747	ACAGTT	2	12	68728	68739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218534558
28	NC_011747	TTGGTG	2	12	69874	69885	0 %	50 %	50 %	0 %	218534558
29	NC_011747	TGTAAG	2	12	71105	71116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534559
30	NC_011747	ATGTGG	2	12	77229	77240	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218534562
31	NC_011747	TGGGGC	2	12	77535	77546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	218534562
32	NC_011747	AACACG	2	12	79776	79787	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218534563
33	NC_011747	TGGGGA	2	12	80043	80054	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	218534563
34	NC_011747	AGGAAG	2	12	81031	81042	50 %	0 %	50 %	0 %	218534564
35	NC_011747	TGCTGA	2	12	86614	86625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218534572
36	NC_011747	ATTTCA	2	12	93224	93235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218534583
37	NC_011747	TTAATT	2	12	100166	100177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218534588
38	NC_011747	TCAAAG	2	12	101256	101267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218534588
39	NC_011747	GTTCAT	2	12	103587	103598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218534590
40	NC_011747	CAGTGT	2	12	104038	104049	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218534590
41	NC_011747	TCCAGT	2	12	107061	107072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218534591
42	NC_011747	ATGGGC	2	12	116683	116694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218534600
43	NC_011747	CTGACT	2	12	117230	117241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218534601
44	NC_011747	AGCTAT	2	12	122196	122207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218534605
45	NC_011747	CCAGTC	2	12	123968	123979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218534606
46	NC_011747	GAATGT	2	12	131542	131553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218534612

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.