MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	CACAC	2	10	653	662	40 %	0 %	0 %	60 %	218534478
2	NC_011747	ACATA	2	10	916	925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011747	CAGCT	2	10	1032	1041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011747	TGAAC	2	10	3745	3754	40 %	20 %	20 %	20 %	218534483
5	NC_011747	GGTCT	2	10	3921	3930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011747	CTCTG	2	10	3952	3961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011747	ATCAC	2	10	4454	4463	40 %	20 %	0 %	40 %	218534484
8	NC_011747	TTCTT	2	10	5116	5125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011747	CCAGC	2	10	5852	5861	20 %	0 %	20 %	60 %	218534486
10	NC_011747	CCCTG	2	10	7891	7900	0 %	20 %	20 %	60 %	218534487
11	NC_011747	CGCAG	2	10	10383	10392	20 %	0 %	40 %	40 %	218534488
12	NC_011747	TTCGC	2	10	11740	11749	0 %	40 %	20 %	40 %	218534490
13	NC_011747	GAGAA	2	10	16834	16843	60 %	0 %	40 %	0 %	218534495
14	NC_011747	ATCAC	2	10	18633	18642	40 %	20 %	0 %	40 %	218534497
15	NC_011747	GCAAA	2	10	20248	20257	60 %	0 %	20 %	20 %	218534499
16	NC_011747	GTGAT	2	10	20690	20699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011747	CTTCA	2	10	21179	21188	20 %	40 %	0 %	40 %	218534501
18	NC_011747	TGCCG	2	10	21449	21458	0 %	20 %	40 %	40 %	218534501
19	NC_011747	CCTTA	2	10	22016	22025	20 %	40 %	0 %	40 %	218534502
20	NC_011747	AGGAT	2	10	22783	22792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011747	TTTAT	2	10	24903	24912	20 %	80 %	0 %	0 %	218534505
22	NC_011747	GTGTG	2	10	25951	25960	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011747	CTGTC	2	10	26608	26617	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011747	TCAGT	2	10	27040	27049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011747	CAGGA	2	10	27187	27196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011747	CCTTC	2	10	28893	28902	0 %	40 %	0 %	60 %	218534509
27	NC_011747	CCGCC	2	10	31144	31153	0 %	0 %	20 %	80 %	218534511
28	NC_011747	GCGAC	2	10	33059	33068	20 %	0 %	40 %	40 %	218534514
29	NC_011747	TACGA	2	10	33705	33714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011747	GGCAC	2	10	34043	34052	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011747	GGAAG	2	10	35238	35247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011747	GGCGG	2	10	35418	35427	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011747	CCGGG	2	10	36639	36648	0 %	0 %	60 %	40 %	218534519
34	NC_011747	CTGCC	2	10	37648	37657	0 %	20 %	20 %	60 %	218534519
35	NC_011747	GGCGG	2	10	38675	38684	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011747	GGATG	2	10	40555	40564	20 %	20 %	60 %	0 %	218534523
37	NC_011747	CCGCC	2	10	44665	44674	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_011747	ACTGA	2	10	44713	44722	40 %	20 %	20 %	20 %	218534526
39	NC_011747	ATCAC	2	10	46531	46540	40 %	20 %	0 %	40 %	218534529
40	NC_011747	GGCGG	2	10	46651	46660	0 %	0 %	80 %	20 %	218534529
41	NC_011747	TTTAT	2	10	49609	49618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011747	CAGGG	2	10	51165	51174	20 %	0 %	60 %	20 %	218534535
43	NC_011747	CCGTG	2	10	53330	53339	0 %	20 %	40 %	40 %	218534539
44	NC_011747	GCCCG	2	10	53845	53854	0 %	0 %	40 %	60 %	218534540
45	NC_011747	AGAGC	2	10	54681	54690	40 %	0 %	40 %	20 %	218534540
46	NC_011747	AAATG	2	10	55273	55282	60 %	20 %	20 %	0 %	218534541
47	NC_011747	TCAGT	2	10	56220	56229	20 %	40 %	20 %	20 %	218534544
48	NC_011747	TCTGA	2	10	57592	57601	20 %	40 %	20 %	20 %	218534546
49	NC_011747	TACCG	2	10	59050	59059	20 %	20 %	20 %	40 %	218534546
50	NC_011747	GAAGC	2	10	60540	60549	40 %	0 %	40 %	20 %	218534548
51	NC_011747	TGTTC	2	10	61167	61176	0 %	60 %	20 %	20 %	218534549
52	NC_011747	AGTCC	2	10	61232	61241	20 %	20 %	20 %	40 %	218534549
53	NC_011747	GTGAA	2	10	62730	62739	40 %	20 %	40 %	0 %	218534551
54	NC_011747	GATTT	2	10	65008	65017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011747	TTTCT	2	10	65086	65095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011747	GCTGG	2	10	68132	68141	0 %	20 %	60 %	20 %	218534558
57	NC_011747	GCGCA	2	10	69731	69740	20 %	0 %	40 %	40 %	218534558
58	NC_011747	CACGG	2	10	72891	72900	20 %	0 %	40 %	40 %	218534561
59	NC_011747	GTGCT	2	10	73342	73351	0 %	40 %	40 %	20 %	218534561
60	NC_011747	GACCT	2	10	74714	74723	20 %	20 %	20 %	40 %	218534562
61	NC_011747	CGCCC	2	10	78623	78632	0 %	0 %	20 %	80 %	218534562
62	NC_011747	ACCGG	2	10	78892	78901	20 %	0 %	40 %	40 %	218534562
63	NC_011747	ACCTG	2	10	79501	79510	20 %	20 %	20 %	40 %	218534562
64	NC_011747	CTGGT	2	10	79839	79848	0 %	40 %	40 %	20 %	218534563
65	NC_011747	GAACG	2	10	80290	80299	40 %	0 %	40 %	20 %	218534563
66	NC_011747	TAAAG	2	10	82417	82426	60 %	20 %	20 %	0 %	218534567
67	NC_011747	ACTTT	2	10	82427	82436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011747	CCTGT	2	10	83915	83924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011747	GCCCC	2	10	84071	84080	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_011747	CTGAA	2	10	84524	84533	40 %	20 %	20 %	20 %	218534569
71	NC_011747	GCCTG	2	10	85934	85943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011747	TCAGT	2	10	86886	86895	20 %	40 %	20 %	20 %	218534572
73	NC_011747	AGAAA	2	10	87432	87441	80 %	0 %	20 %	0 %	218534572
74	NC_011747	CGGCC	2	10	89098	89107	0 %	0 %	40 %	60 %	218534575
75	NC_011747	CAGGT	2	10	91478	91487	20 %	20 %	40 %	20 %	218534580
76	NC_011747	GATAA	2	10	92072	92081	60 %	20 %	20 %	0 %	218534581
77	NC_011747	TTCCA	2	10	92486	92495	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011747	CTGAA	2	10	96583	96592	40 %	20 %	20 %	20 %	218534586
79	NC_011747	GGTTG	2	10	99892	99901	0 %	40 %	60 %	0 %	218534588
80	NC_011747	TCAAC	2	10	103094	103103	40 %	20 %	0 %	40 %	218534590
81	NC_011747	AACAG	2	10	105426	105435	60 %	0 %	20 %	20 %	218534591
82	NC_011747	CCGTC	2	10	107098	107107	0 %	20 %	20 %	60 %	218534591
83	NC_011747	GCGCA	2	10	107732	107741	20 %	0 %	40 %	40 %	218534591
84	NC_011747	CAGGT	2	10	110298	110307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011747	GCACT	2	10	114203	114212	20 %	20 %	20 %	40 %	218534598
86	NC_011747	AGGGT	2	10	115168	115177	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011747	GGAAA	2	10	118018	118027	60 %	0 %	40 %	0 %	218534602
88	NC_011747	CTGCT	2	10	120912	120921	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011747	CAGAA	2	10	125399	125408	60 %	0 %	20 %	20 %	218534607
90	NC_011747	GTTAT	2	10	128653	128662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011747	TAAAG	2	10	128690	128699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011747	AATAA	2	10	128993	129002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011747	AAACA	2	10	129747	129756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011747	CTGGA	2	10	130019	130028	20 %	20 %	40 %	20 %	218534611
95	NC_011747	GAAAT	2	10	132830	132839	60 %	20 %	20 %	0 %	218534613

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.