MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	ACATA	2	10	916	925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011747	CAGCT	2	10	1032	1041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011747	GGTCT	2	10	3921	3930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011747	CTCTG	2	10	3952	3961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011747	TTCTT	2	10	5116	5125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011747	GTGAT	2	10	20690	20699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011747	AGGAT	2	10	22783	22792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011747	GTGTG	2	10	25951	25960	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011747	CTGTC	2	10	26608	26617	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011747	TCAGT	2	10	27040	27049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011747	CAGGA	2	10	27187	27196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011747	TACGA	2	10	33705	33714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011747	GGCAC	2	10	34043	34052	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011747	GGAAG	2	10	35238	35247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011747	GGCGG	2	10	35418	35427	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011747	GGCGG	2	10	38675	38684	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011747	CCGCC	2	10	44665	44674	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_011747	TTTAT	2	10	49609	49618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011747	GATTT	2	10	65008	65017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011747	TTTCT	2	10	65086	65095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011747	ACTTT	2	10	82427	82436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011747	CCTGT	2	10	83915	83924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011747	GCCCC	2	10	84071	84080	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_011747	GCCTG	2	10	85934	85943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011747	TTCCA	2	10	92486	92495	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011747	CAGGT	2	10	110298	110307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011747	AGGGT	2	10	115168	115177	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011747	CTGCT	2	10	120912	120921	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011747	GTTAT	2	10	128653	128662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011747	TAAAG	2	10	128690	128699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011747	AATAA	2	10	128993	129002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011747	AAACA	2	10	129747	129756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.