MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	CAAA	2	8	23	30	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011747	AGTG	2	8	278	285	25 %	25 %	50 %	0 %	218534478
3	NC_011747	GTGC	2	8	438	445	0 %	25 %	50 %	25 %	218534478
4	NC_011747	CGCC	2	8	456	463	0 %	0 %	25 %	75 %	218534478
5	NC_011747	CTGG	2	8	729	736	0 %	25 %	50 %	25 %	218534478
6	NC_011747	CGGG	2	8	824	831	0 %	0 %	75 %	25 %	218534478
7	NC_011747	ACAG	2	8	1042	1049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011747	CACT	2	8	1088	1095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011747	GACT	2	8	1240	1247	25 %	25 %	25 %	25 %	218534479
10	NC_011747	GAAT	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	218534479
11	NC_011747	CCCA	2	8	1878	1885	25 %	0 %	0 %	75 %	218534479
12	NC_011747	ACTG	2	8	2239	2246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011747	ACTT	2	8	2312	2319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011747	TCAT	2	8	2463	2470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011747	TGTC	2	8	2659	2666	0 %	50 %	25 %	25 %	218534480
16	NC_011747	ACGG	2	8	2972	2979	25 %	0 %	50 %	25 %	218534481
17	NC_011747	GCCA	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	218534481
18	NC_011747	CGTC	2	8	3186	3193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011747	GCTG	2	8	3649	3656	0 %	25 %	50 %	25 %	218534483
20	NC_011747	TCAA	2	8	4018	4025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011747	GCCA	2	8	4257	4264	25 %	0 %	25 %	50 %	218534484
22	NC_011747	CAGC	2	8	4390	4397	25 %	0 %	25 %	50 %	218534484
23	NC_011747	ATTT	2	8	5087	5094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011747	CAGT	2	8	5688	5695	25 %	25 %	25 %	25 %	218534486
25	NC_011747	TGTT	2	8	6486	6493	0 %	75 %	25 %	0 %	218534486
26	NC_011747	GACC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	218534486
27	NC_011747	CAAG	2	8	6838	6845	50 %	0 %	25 %	25 %	218534486
28	NC_011747	ACGC	2	8	7166	7173	25 %	0 %	25 %	50 %	218534486
29	NC_011747	GCGG	2	8	7192	7199	0 %	0 %	75 %	25 %	218534486
30	NC_011747	GGGC	2	8	7594	7601	0 %	0 %	75 %	25 %	218534487
31	NC_011747	CCAG	2	8	7928	7935	25 %	0 %	25 %	50 %	218534487
32	NC_011747	ACCA	2	8	8282	8289	50 %	0 %	0 %	50 %	218534487
33	NC_011747	CTGG	2	8	8435	8442	0 %	25 %	50 %	25 %	218534487
34	NC_011747	CAGC	2	8	9508	9515	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
35	NC_011747	GTCG	2	8	9658	9665	0 %	25 %	50 %	25 %	218534488
36	NC_011747	GCCC	2	8	9777	9784	0 %	0 %	25 %	75 %	218534488
37	NC_011747	CTGA	2	8	9973	9980	25 %	25 %	25 %	25 %	218534488
38	NC_011747	GCCA	2	8	10076	10083	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
39	NC_011747	AGCC	2	8	10412	10419	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
40	NC_011747	GACC	2	8	10589	10596	25 %	0 %	25 %	50 %	218534489
41	NC_011747	CAGC	2	8	10785	10792	25 %	0 %	25 %	50 %	218534489
42	NC_011747	ACCA	2	8	10827	10834	50 %	0 %	0 %	50 %	218534489
43	NC_011747	AAAT	2	8	11173	11180	75 %	25 %	0 %	0 %	218534489
44	NC_011747	CAGC	2	8	11708	11715	25 %	0 %	25 %	50 %	218534490
45	NC_011747	TAAA	2	8	11929	11936	75 %	25 %	0 %	0 %	218534490
46	NC_011747	AAAC	2	8	12225	12232	75 %	0 %	0 %	25 %	218534490
47	NC_011747	CAGA	2	8	12383	12390	50 %	0 %	25 %	25 %	218534490
48	NC_011747	ACGG	2	8	12393	12400	25 %	0 %	50 %	25 %	218534490
49	NC_011747	ATTG	2	8	12599	12606	25 %	50 %	25 %	0 %	218534490
50	NC_011747	CAGG	2	8	12749	12756	25 %	0 %	50 %	25 %	218534490
51	NC_011747	AATT	2	8	13342	13349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011747	GTCT	2	8	13528	13535	0 %	50 %	25 %	25 %	218534491
53	NC_011747	TGCC	2	8	14043	14050	0 %	25 %	25 %	50 %	218534491
54	NC_011747	GGCT	2	8	14418	14425	0 %	25 %	50 %	25 %	218534491
55	NC_011747	TATT	2	8	15455	15462	25 %	75 %	0 %	0 %	218534493
56	NC_011747	CCAA	2	8	16029	16036	50 %	0 %	0 %	50 %	218534494
57	NC_011747	TCCA	2	8	16072	16079	25 %	25 %	0 %	50 %	218534494
58	NC_011747	ACAA	2	8	16343	16350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011747	TTAA	2	8	16351	16358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011747	TGCG	2	8	16632	16639	0 %	25 %	50 %	25 %	218534495
61	NC_011747	TACC	2	8	16857	16864	25 %	25 %	0 %	50 %	218534495
62	NC_011747	CTTG	2	8	17172	17179	0 %	50 %	25 %	25 %	218534495
63	NC_011747	TGGG	2	8	17497	17504	0 %	25 %	75 %	0 %	218534496
64	NC_011747	CAGA	2	8	17694	17701	50 %	0 %	25 %	25 %	218534496
65	NC_011747	GAGT	2	8	18041	18048	25 %	25 %	50 %	0 %	218534496
66	NC_011747	TCTT	2	8	18299	18306	0 %	75 %	0 %	25 %	218534496
67	NC_011747	CTGA	2	8	18865	18872	25 %	25 %	25 %	25 %	218534497
68	NC_011747	CCAT	2	8	19464	19471	25 %	25 %	0 %	50 %	218534498
69	NC_011747	GCTG	2	8	20756	20763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011747	TGGC	2	8	20889	20896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011747	TATG	2	8	22412	22419	25 %	50 %	25 %	0 %	218534503
72	NC_011747	CCAC	2	8	22664	22671	25 %	0 %	0 %	75 %	218534503
73	NC_011747	AGAC	2	8	22765	22772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011747	TTTA	2	8	23395	23402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011747	TCCT	2	8	25509	25516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011747	CATC	2	8	25556	25563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011747	AACT	2	8	25876	25883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011747	AACA	2	8	26019	26026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011747	AGCA	2	8	26112	26119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011747	CAGC	2	8	27213	27220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011747	GCTG	2	8	27756	27763	0 %	25 %	50 %	25 %	218534508
82	NC_011747	TGGC	2	8	27889	27896	0 %	25 %	50 %	25 %	218534508
83	NC_011747	TGGA	2	8	29329	29336	25 %	25 %	50 %	0 %	218534509
84	NC_011747	TGGT	2	8	29962	29969	0 %	50 %	50 %	0 %	218534510
85	NC_011747	GAAT	2	8	30071	30078	50 %	25 %	25 %	0 %	218534510
86	NC_011747	GCTG	2	8	30098	30105	0 %	25 %	50 %	25 %	218534510
87	NC_011747	TAGA	2	8	30448	30455	50 %	25 %	25 %	0 %	218534510
88	NC_011747	TAAC	2	8	30594	30601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011747	TGCC	2	8	31070	31077	0 %	25 %	25 %	50 %	218534511
90	NC_011747	AGTG	2	8	31078	31085	25 %	25 %	50 %	0 %	218534511
91	NC_011747	GCAA	2	8	31432	31439	50 %	0 %	25 %	25 %	218534512
92	NC_011747	ATTT	2	8	31701	31708	25 %	75 %	0 %	0 %	218534513
93	NC_011747	CCTT	2	8	31775	31782	0 %	50 %	0 %	50 %	218534513
94	NC_011747	GGTG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011747	CTGA	2	8	33479	33486	25 %	25 %	25 %	25 %	218534514
96	NC_011747	TCAA	2	8	33723	33730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011747	GTCT	2	8	34140	34147	0 %	50 %	25 %	25 %	218534516
98	NC_011747	ACGG	2	8	34523	34530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011747	TGCC	2	8	35640	35647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011747	ACTG	2	8	35709	35716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011747	ATTT	2	8	35941	35948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011747	ATTT	2	8	35967	35974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011747	GTCA	2	8	35980	35987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011747	AGTA	2	8	36161	36168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011747	CGCT	2	8	36697	36704	0 %	25 %	25 %	50 %	218534519
106	NC_011747	CCCG	2	8	36809	36816	0 %	0 %	25 %	75 %	218534519
107	NC_011747	GAAG	2	8	37185	37192	50 %	0 %	50 %	0 %	218534519
108	NC_011747	CAGT	2	8	37852	37859	25 %	25 %	25 %	25 %	218534520
109	NC_011747	GTCT	2	8	38285	38292	0 %	50 %	25 %	25 %	218534520
110	NC_011747	CTGT	2	8	38626	38633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011747	CAGA	2	8	39369	39376	50 %	0 %	25 %	25 %	218534521
112	NC_011747	GACT	2	8	39757	39764	25 %	25 %	25 %	25 %	218534521
113	NC_011747	TAAG	2	8	40038	40045	50 %	25 %	25 %	0 %	218534522
114	NC_011747	CTAC	2	8	41072	41079	25 %	25 %	0 %	50 %	218534523
115	NC_011747	TCAG	2	8	42202	42209	25 %	25 %	25 %	25 %	218534524
116	NC_011747	TGCC	2	8	42299	42306	0 %	25 %	25 %	50 %	218534524
117	NC_011747	CCTG	2	8	42933	42940	0 %	25 %	25 %	50 %	218534525
118	NC_011747	GAAC	2	8	43704	43711	50 %	0 %	25 %	25 %	218534525
119	NC_011747	ACGC	2	8	44001	44008	25 %	0 %	25 %	50 %	218534525
120	NC_011747	GAAG	2	8	44169	44176	50 %	0 %	50 %	0 %	218534525
121	NC_011747	TCAG	2	8	44270	44277	25 %	25 %	25 %	25 %	218534525
122	NC_011747	CTGG	2	8	44579	44586	0 %	25 %	50 %	25 %	218534525
123	NC_011747	GGCG	2	8	45193	45200	0 %	0 %	75 %	25 %	218534527
124	NC_011747	GAGG	2	8	45536	45543	25 %	0 %	75 %	0 %	218534527
125	NC_011747	TTCA	2	8	45604	45611	25 %	50 %	0 %	25 %	218534527
126	NC_011747	AGTG	2	8	45920	45927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011747	GGCG	2	8	46304	46311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011747	ACTG	2	8	46945	46952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011747	CTGA	2	8	47298	47305	25 %	25 %	25 %	25 %	218534530
130	NC_011747	GGGA	2	8	47533	47540	25 %	0 %	75 %	0 %	218534531
131	NC_011747	GAAA	2	8	48105	48112	75 %	0 %	25 %	0 %	218534531
132	NC_011747	ATTT	2	8	48137	48144	25 %	75 %	0 %	0 %	218534531
133	NC_011747	CTGC	2	8	49143	49150	0 %	25 %	25 %	50 %	218534532
134	NC_011747	CAGA	2	8	49172	49179	50 %	0 %	25 %	25 %	218534532
135	NC_011747	ACTC	2	8	49263	49270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011747	ATTA	2	8	50098	50105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011747	ATTT	2	8	50329	50336	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
138	NC_011747	TTTA	2	8	50849	50856	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
139	NC_011747	TTAT	2	8	50857	50864	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
140	NC_011747	CAGA	2	8	51290	51297	50 %	0 %	25 %	25 %	218534535
141	NC_011747	TATT	2	8	51754	51761	25 %	75 %	0 %	0 %	218534536
142	NC_011747	ACCA	2	8	51857	51864	50 %	0 %	0 %	50 %	218534537
143	NC_011747	CTGG	2	8	52663	52670	0 %	25 %	50 %	25 %	218534538
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145	NC_011747	CAGC	2	8	53345	53352	25 %	0 %	25 %	50 %	218534539
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.