MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	CAAA	2	8	23	30	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011747	ACAG	2	8	1042	1049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011747	CACT	2	8	1088	1095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011747	ACTG	2	8	2239	2246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011747	ACTT	2	8	2312	2319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011747	TCAT	2	8	2463	2470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011747	CGTC	2	8	3186	3193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011747	TCAA	2	8	4018	4025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011747	ATTT	2	8	5087	5094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011747	AATT	2	8	13342	13349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011747	ACAA	2	8	16343	16350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011747	TTAA	2	8	16351	16358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011747	GCTG	2	8	20756	20763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011747	TGGC	2	8	20889	20896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011747	AGAC	2	8	22765	22772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011747	TTTA	2	8	23395	23402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011747	TCCT	2	8	25509	25516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011747	CATC	2	8	25556	25563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011747	AACT	2	8	25876	25883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011747	AACA	2	8	26019	26026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011747	AGCA	2	8	26112	26119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011747	CAGC	2	8	27213	27220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011747	TAAC	2	8	30594	30601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011747	GGTG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011747	TCAA	2	8	33723	33730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011747	ACGG	2	8	34523	34530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011747	TGCC	2	8	35640	35647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011747	ACTG	2	8	35709	35716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011747	ATTT	2	8	35941	35948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011747	ATTT	2	8	35967	35974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011747	GTCA	2	8	35980	35987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011747	AGTA	2	8	36161	36168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011747	CTGT	2	8	38626	38633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011747	AGTG	2	8	45920	45927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011747	GGCG	2	8	46304	46311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011747	ACTG	2	8	46945	46952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011747	ACTC	2	8	49263	49270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011747	ATTA	2	8	50098	50105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011747	ACTG	2	8	65170	65177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011747	GAAA	2	8	72138	72145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011747	AAAT	2	8	72148	72155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011747	AAAT	2	8	72179	72186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011747	GACT	2	8	72293	72300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011747	AGGG	2	8	81247	81254	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011747	TGGC	2	8	82479	82486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011747	CATT	2	8	83885	83892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011747	GACA	2	8	83926	83933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011747	AACC	2	8	83997	84004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011747	CCCT	2	8	84048	84055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_011747	CTTT	2	8	88367	88374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011747	TTAT	2	8	89670	89677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011747	AAGA	2	8	92423	92430	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011747	AAAT	2	8	95992	95999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011747	ATAA	2	8	96065	96072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011747	TCAT	2	8	96203	96210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011747	GGCA	2	8	96335	96342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011747	GCCA	2	8	96842	96849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011747	CAGC	2	8	96930	96937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011747	CTTT	2	8	96950	96957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011747	CCCT	2	8	97513	97520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011747	CTAT	2	8	99173	99180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011747	GAAA	2	8	99491	99498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011747	ATTA	2	8	99742	99749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011747	TCAG	2	8	109483	109490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011747	GTAA	2	8	109715	109722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011747	TGTT	2	8	109743	109750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011747	CTTA	2	8	111695	111702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011747	TGAT	2	8	112047	112054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011747	CCAG	2	8	112111	112118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011747	TGGT	2	8	112121	112128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011747	AAAT	2	8	112179	112186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011747	GGTA	2	8	112890	112897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011747	ATGT	2	8	113194	113201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011747	TGAA	2	8	115079	115086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011747	AAGA	2	8	115209	115216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011747	TGAC	2	8	115510	115517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011747	CTAA	2	8	115840	115847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011747	GCAG	2	8	117098	117105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011747	AAGT	2	8	117525	117532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011747	AGAT	2	8	117557	117564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011747	GGGA	2	8	120298	120305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011747	TAAT	2	8	125792	125799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011747	ATGG	2	8	125897	125904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011747	TCAT	2	8	126442	126449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011747	GCAG	2	8	126572	126579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011747	TACA	2	8	128895	128902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011747	TAAA	2	8	128970	128977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011747	GGAA	2	8	129088	129095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011747	ATCA	2	8	129207	129214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011747	AAAC	2	8	129736	129743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011747	TAAA	2	8	129782	129789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011747	AAAC	2	8	129804	129811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011747	ATTT	2	8	131179	131186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011747	GTAA	2	8	133316	133323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011747	TTTC	2	8	133476	133483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011747	TTGT	2	8	133517	133524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011747	TGTT	2	8	133621	133628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.