MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	AGTG	2	8	278	285	25 %	25 %	50 %	0 %	218534478
2	NC_011747	GTGC	2	8	438	445	0 %	25 %	50 %	25 %	218534478
3	NC_011747	CGCC	2	8	456	463	0 %	0 %	25 %	75 %	218534478
4	NC_011747	CTGG	2	8	729	736	0 %	25 %	50 %	25 %	218534478
5	NC_011747	CGGG	2	8	824	831	0 %	0 %	75 %	25 %	218534478
6	NC_011747	GACT	2	8	1240	1247	25 %	25 %	25 %	25 %	218534479
7	NC_011747	GAAT	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	218534479
8	NC_011747	CCCA	2	8	1878	1885	25 %	0 %	0 %	75 %	218534479
9	NC_011747	TGTC	2	8	2659	2666	0 %	50 %	25 %	25 %	218534480
10	NC_011747	ACGG	2	8	2972	2979	25 %	0 %	50 %	25 %	218534481
11	NC_011747	GCCA	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	218534481
12	NC_011747	GCTG	2	8	3649	3656	0 %	25 %	50 %	25 %	218534483
13	NC_011747	GCCA	2	8	4257	4264	25 %	0 %	25 %	50 %	218534484
14	NC_011747	CAGC	2	8	4390	4397	25 %	0 %	25 %	50 %	218534484
15	NC_011747	CAGT	2	8	5688	5695	25 %	25 %	25 %	25 %	218534486
16	NC_011747	TGTT	2	8	6486	6493	0 %	75 %	25 %	0 %	218534486
17	NC_011747	GACC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	218534486
18	NC_011747	CAAG	2	8	6838	6845	50 %	0 %	25 %	25 %	218534486
19	NC_011747	ACGC	2	8	7166	7173	25 %	0 %	25 %	50 %	218534486
20	NC_011747	GCGG	2	8	7192	7199	0 %	0 %	75 %	25 %	218534486
21	NC_011747	GGGC	2	8	7594	7601	0 %	0 %	75 %	25 %	218534487
22	NC_011747	CCAG	2	8	7928	7935	25 %	0 %	25 %	50 %	218534487
23	NC_011747	ACCA	2	8	8282	8289	50 %	0 %	0 %	50 %	218534487
24	NC_011747	CTGG	2	8	8435	8442	0 %	25 %	50 %	25 %	218534487
25	NC_011747	CAGC	2	8	9508	9515	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
26	NC_011747	GTCG	2	8	9658	9665	0 %	25 %	50 %	25 %	218534488
27	NC_011747	GCCC	2	8	9777	9784	0 %	0 %	25 %	75 %	218534488
28	NC_011747	CTGA	2	8	9973	9980	25 %	25 %	25 %	25 %	218534488
29	NC_011747	GCCA	2	8	10076	10083	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
30	NC_011747	AGCC	2	8	10412	10419	25 %	0 %	25 %	50 %	218534488
31	NC_011747	GACC	2	8	10589	10596	25 %	0 %	25 %	50 %	218534489
32	NC_011747	CAGC	2	8	10785	10792	25 %	0 %	25 %	50 %	218534489
33	NC_011747	ACCA	2	8	10827	10834	50 %	0 %	0 %	50 %	218534489
34	NC_011747	AAAT	2	8	11173	11180	75 %	25 %	0 %	0 %	218534489
35	NC_011747	CAGC	2	8	11708	11715	25 %	0 %	25 %	50 %	218534490
36	NC_011747	TAAA	2	8	11929	11936	75 %	25 %	0 %	0 %	218534490
37	NC_011747	AAAC	2	8	12225	12232	75 %	0 %	0 %	25 %	218534490
38	NC_011747	CAGA	2	8	12383	12390	50 %	0 %	25 %	25 %	218534490
39	NC_011747	ACGG	2	8	12393	12400	25 %	0 %	50 %	25 %	218534490
40	NC_011747	ATTG	2	8	12599	12606	25 %	50 %	25 %	0 %	218534490
41	NC_011747	CAGG	2	8	12749	12756	25 %	0 %	50 %	25 %	218534490
42	NC_011747	GTCT	2	8	13528	13535	0 %	50 %	25 %	25 %	218534491
43	NC_011747	TGCC	2	8	14043	14050	0 %	25 %	25 %	50 %	218534491
44	NC_011747	GGCT	2	8	14418	14425	0 %	25 %	50 %	25 %	218534491
45	NC_011747	TATT	2	8	15455	15462	25 %	75 %	0 %	0 %	218534493
46	NC_011747	CCAA	2	8	16029	16036	50 %	0 %	0 %	50 %	218534494
47	NC_011747	TCCA	2	8	16072	16079	25 %	25 %	0 %	50 %	218534494
48	NC_011747	TGCG	2	8	16632	16639	0 %	25 %	50 %	25 %	218534495
49	NC_011747	TACC	2	8	16857	16864	25 %	25 %	0 %	50 %	218534495
50	NC_011747	CTTG	2	8	17172	17179	0 %	50 %	25 %	25 %	218534495
51	NC_011747	TGGG	2	8	17497	17504	0 %	25 %	75 %	0 %	218534496
52	NC_011747	CAGA	2	8	17694	17701	50 %	0 %	25 %	25 %	218534496
53	NC_011747	GAGT	2	8	18041	18048	25 %	25 %	50 %	0 %	218534496
54	NC_011747	TCTT	2	8	18299	18306	0 %	75 %	0 %	25 %	218534496
55	NC_011747	CTGA	2	8	18865	18872	25 %	25 %	25 %	25 %	218534497
56	NC_011747	CCAT	2	8	19464	19471	25 %	25 %	0 %	50 %	218534498
57	NC_011747	TATG	2	8	22412	22419	25 %	50 %	25 %	0 %	218534503
58	NC_011747	CCAC	2	8	22664	22671	25 %	0 %	0 %	75 %	218534503
59	NC_011747	GCTG	2	8	27756	27763	0 %	25 %	50 %	25 %	218534508
60	NC_011747	TGGC	2	8	27889	27896	0 %	25 %	50 %	25 %	218534508
61	NC_011747	TGGA	2	8	29329	29336	25 %	25 %	50 %	0 %	218534509
62	NC_011747	TGGT	2	8	29962	29969	0 %	50 %	50 %	0 %	218534510
63	NC_011747	GAAT	2	8	30071	30078	50 %	25 %	25 %	0 %	218534510
64	NC_011747	GCTG	2	8	30098	30105	0 %	25 %	50 %	25 %	218534510
65	NC_011747	TAGA	2	8	30448	30455	50 %	25 %	25 %	0 %	218534510
66	NC_011747	TGCC	2	8	31070	31077	0 %	25 %	25 %	50 %	218534511
67	NC_011747	AGTG	2	8	31078	31085	25 %	25 %	50 %	0 %	218534511
68	NC_011747	GCAA	2	8	31432	31439	50 %	0 %	25 %	25 %	218534512
69	NC_011747	ATTT	2	8	31701	31708	25 %	75 %	0 %	0 %	218534513
70	NC_011747	CCTT	2	8	31775	31782	0 %	50 %	0 %	50 %	218534513
71	NC_011747	CTGA	2	8	33479	33486	25 %	25 %	25 %	25 %	218534514
72	NC_011747	GTCT	2	8	34140	34147	0 %	50 %	25 %	25 %	218534516
73	NC_011747	CGCT	2	8	36697	36704	0 %	25 %	25 %	50 %	218534519
74	NC_011747	CCCG	2	8	36809	36816	0 %	0 %	25 %	75 %	218534519
75	NC_011747	GAAG	2	8	37185	37192	50 %	0 %	50 %	0 %	218534519
76	NC_011747	CAGT	2	8	37852	37859	25 %	25 %	25 %	25 %	218534520
77	NC_011747	GTCT	2	8	38285	38292	0 %	50 %	25 %	25 %	218534520
78	NC_011747	CAGA	2	8	39369	39376	50 %	0 %	25 %	25 %	218534521
79	NC_011747	GACT	2	8	39757	39764	25 %	25 %	25 %	25 %	218534521
80	NC_011747	TAAG	2	8	40038	40045	50 %	25 %	25 %	0 %	218534522
81	NC_011747	CTAC	2	8	41072	41079	25 %	25 %	0 %	50 %	218534523
82	NC_011747	TCAG	2	8	42202	42209	25 %	25 %	25 %	25 %	218534524
83	NC_011747	TGCC	2	8	42299	42306	0 %	25 %	25 %	50 %	218534524
84	NC_011747	CCTG	2	8	42933	42940	0 %	25 %	25 %	50 %	218534525
85	NC_011747	GAAC	2	8	43704	43711	50 %	0 %	25 %	25 %	218534525
86	NC_011747	ACGC	2	8	44001	44008	25 %	0 %	25 %	50 %	218534525
87	NC_011747	GAAG	2	8	44169	44176	50 %	0 %	50 %	0 %	218534525
88	NC_011747	TCAG	2	8	44270	44277	25 %	25 %	25 %	25 %	218534525
89	NC_011747	CTGG	2	8	44579	44586	0 %	25 %	50 %	25 %	218534525
90	NC_011747	GGCG	2	8	45193	45200	0 %	0 %	75 %	25 %	218534527
91	NC_011747	GAGG	2	8	45536	45543	25 %	0 %	75 %	0 %	218534527
92	NC_011747	TTCA	2	8	45604	45611	25 %	50 %	0 %	25 %	218534527
93	NC_011747	CTGA	2	8	47298	47305	25 %	25 %	25 %	25 %	218534530
94	NC_011747	GGGA	2	8	47533	47540	25 %	0 %	75 %	0 %	218534531
95	NC_011747	GAAA	2	8	48105	48112	75 %	0 %	25 %	0 %	218534531
96	NC_011747	ATTT	2	8	48137	48144	25 %	75 %	0 %	0 %	218534531
97	NC_011747	CTGC	2	8	49143	49150	0 %	25 %	25 %	50 %	218534532
98	NC_011747	CAGA	2	8	49172	49179	50 %	0 %	25 %	25 %	218534532
99	NC_011747	ATTT	2	8	50329	50336	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
100	NC_011747	TTTA	2	8	50849	50856	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
101	NC_011747	TTAT	2	8	50857	50864	25 %	75 %	0 %	0 %	218534534
102	NC_011747	CAGA	2	8	51290	51297	50 %	0 %	25 %	25 %	218534535
103	NC_011747	TATT	2	8	51754	51761	25 %	75 %	0 %	0 %	218534536
104	NC_011747	ACCA	2	8	51857	51864	50 %	0 %	0 %	50 %	218534537
105	NC_011747	CTGG	2	8	52663	52670	0 %	25 %	50 %	25 %	218534538
106	NC_011747	CCGT	2	8	53131	53138	0 %	25 %	25 %	50 %	218534539
107	NC_011747	CAGC	2	8	53345	53352	25 %	0 %	25 %	50 %	218534539
108	NC_011747	GCCA	2	8	53355	53362	25 %	0 %	25 %	50 %	218534539
109	NC_011747	TCTG	2	8	53515	53522	0 %	50 %	25 %	25 %	218534540
110	NC_011747	AACA	2	8	53705	53712	75 %	0 %	0 %	25 %	218534540
111	NC_011747	TGCC	2	8	53832	53839	0 %	25 %	25 %	50 %	218534540
112	NC_011747	ACGC	2	8	54673	54680	25 %	0 %	25 %	50 %	218534540
113	NC_011747	AGGG	2	8	54822	54829	25 %	0 %	75 %	0 %	218534540
114	NC_011747	TGTT	2	8	54970	54977	0 %	75 %	25 %	0 %	218534541
115	NC_011747	ATGT	2	8	55221	55228	25 %	50 %	25 %	0 %	218534541
116	NC_011747	GAAG	2	8	55313	55320	50 %	0 %	50 %	0 %	218534541
117	NC_011747	AACA	2	8	55388	55395	75 %	0 %	0 %	25 %	218534541
118	NC_011747	ATGC	2	8	55483	55490	25 %	25 %	25 %	25 %	218534542
119	NC_011747	TTTC	2	8	55881	55888	0 %	75 %	0 %	25 %	218534544
120	NC_011747	TCCG	2	8	56116	56123	0 %	25 %	25 %	50 %	218534544
121	NC_011747	ATTA	2	8	56378	56385	50 %	50 %	0 %	0 %	218534544
122	NC_011747	GTGA	2	8	56521	56528	25 %	25 %	50 %	0 %	218534545
123	NC_011747	AAAT	2	8	56597	56604	75 %	25 %	0 %	0 %	218534545
124	NC_011747	AGTC	2	8	56742	56749	25 %	25 %	25 %	25 %	218534545
125	NC_011747	ATGA	2	8	57070	57077	50 %	25 %	25 %	0 %	218534546
126	NC_011747	TGGT	2	8	57215	57222	0 %	50 %	50 %	0 %	218534546
127	NC_011747	TCCG	2	8	57915	57922	0 %	25 %	25 %	50 %	218534546
128	NC_011747	CACC	2	8	58274	58281	25 %	0 %	0 %	75 %	218534546
129	NC_011747	GGAT	2	8	58449	58456	25 %	25 %	50 %	0 %	218534546
130	NC_011747	CCGT	2	8	58887	58894	0 %	25 %	25 %	50 %	218534546
131	NC_011747	TTCC	2	8	59292	59299	0 %	50 %	0 %	50 %	218534546
132	NC_011747	CTGG	2	8	59490	59497	0 %	25 %	50 %	25 %	218534546
133	NC_011747	AGCC	2	8	59780	59787	25 %	0 %	25 %	50 %	218534547
134	NC_011747	CGTC	2	8	60174	60181	0 %	25 %	25 %	50 %	218534548
135	NC_011747	AGTC	2	8	60690	60697	25 %	25 %	25 %	25 %	218534549
136	NC_011747	GACG	2	8	60813	60820	25 %	0 %	50 %	25 %	218534549
137	NC_011747	GGAC	2	8	61049	61056	25 %	0 %	50 %	25 %	218534549
138	NC_011747	TCAT	2	8	62456	62463	25 %	50 %	0 %	25 %	218534551
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.