MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	CT	3	6	1500	1505	0 %	50 %	0 %	50 %	218534479
2	NC_011747	AT	3	6	1677	1682	50 %	50 %	0 %	0 %	218534479
3	NC_011747	CA	3	6	1798	1803	50 %	0 %	0 %	50 %	218534479
4	NC_011747	TG	3	6	2738	2743	0 %	50 %	50 %	0 %	218534480
5	NC_011747	AG	3	6	2889	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	218534481
6	NC_011747	CA	3	6	3556	3561	50 %	0 %	0 %	50 %	218534483
7	NC_011747	TG	3	6	6738	6743	0 %	50 %	50 %	0 %	218534486
8	NC_011747	AT	3	6	8133	8138	50 %	50 %	0 %	0 %	218534487
9	NC_011747	CA	3	6	8369	8374	50 %	0 %	0 %	50 %	218534487
10	NC_011747	TA	3	6	9427	9432	50 %	50 %	0 %	0 %	218534488
11	NC_011747	GA	3	6	9850	9855	50 %	0 %	50 %	0 %	218534488
12	NC_011747	CG	3	6	11036	11041	0 %	0 %	50 %	50 %	218534489
13	NC_011747	GA	3	6	13006	13011	50 %	0 %	50 %	0 %	218534490
14	NC_011747	AG	3	6	13810	13815	50 %	0 %	50 %	0 %	218534491
15	NC_011747	CA	3	6	14436	14441	50 %	0 %	0 %	50 %	218534491
16	NC_011747	AT	3	6	15054	15059	50 %	50 %	0 %	0 %	218534492
17	NC_011747	GC	3	6	15810	15815	0 %	0 %	50 %	50 %	218534494
18	NC_011747	GC	3	6	16707	16712	0 %	0 %	50 %	50 %	218534495
19	NC_011747	AG	3	6	16846	16851	50 %	0 %	50 %	0 %	218534495
20	NC_011747	GA	3	6	17869	17874	50 %	0 %	50 %	0 %	218534496
21	NC_011747	AT	3	6	18124	18129	50 %	50 %	0 %	0 %	218534496
22	NC_011747	AT	3	6	18262	18267	50 %	50 %	0 %	0 %	218534496
23	NC_011747	CG	3	6	18554	18559	0 %	0 %	50 %	50 %	218534497
24	NC_011747	TG	3	6	19061	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	218534497
25	NC_011747	GC	3	6	19254	19259	0 %	0 %	50 %	50 %	218534498
26	NC_011747	AG	3	6	21162	21167	50 %	0 %	50 %	0 %	218534501
27	NC_011747	AT	3	6	21648	21653	50 %	50 %	0 %	0 %	218534501
28	NC_011747	AT	3	6	21687	21692	50 %	50 %	0 %	0 %	218534501
29	NC_011747	GA	3	6	22482	22487	50 %	0 %	50 %	0 %	218534503
30	NC_011747	TA	3	6	22911	22916	50 %	50 %	0 %	0 %	218534504
31	NC_011747	TA	4	8	24134	24141	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
32	NC_011747	TA	3	6	24174	24179	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
33	NC_011747	AT	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
34	NC_011747	AT	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
35	NC_011747	TA	3	6	24618	24623	50 %	50 %	0 %	0 %	218534505
36	NC_011747	TC	3	6	25112	25117	0 %	50 %	0 %	50 %	218534505
37	NC_011747	GC	3	6	29114	29119	0 %	0 %	50 %	50 %	218534509
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39	NC_011747	AG	3	6	30479	30484	50 %	0 %	50 %	0 %	218534510
40	NC_011747	TG	3	6	31084	31089	0 %	50 %	50 %	0 %	218534511
41	NC_011747	TC	3	6	31560	31565	0 %	50 %	0 %	50 %	218534512
42	NC_011747	CA	3	6	31691	31696	50 %	0 %	0 %	50 %	218534513
43	NC_011747	TG	4	8	32096	32103	0 %	50 %	50 %	0 %	218534513
44	NC_011747	TA	3	6	33327	33332	50 %	50 %	0 %	0 %	218534514
45	NC_011747	GT	4	8	33976	33983	0 %	50 %	50 %	0 %	218534515
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48	NC_011747	GA	3	6	36673	36678	50 %	0 %	50 %	0 %	218534519
49	NC_011747	GC	3	6	37882	37887	0 %	0 %	50 %	50 %	218534520
50	NC_011747	TG	3	6	38073	38078	0 %	50 %	50 %	0 %	218534520
51	NC_011747	CG	3	6	38352	38357	0 %	0 %	50 %	50 %	218534520
52	NC_011747	GC	3	6	39439	39444	0 %	0 %	50 %	50 %	218534521
53	NC_011747	GA	3	6	39800	39805	50 %	0 %	50 %	0 %	218534521
54	NC_011747	AG	3	6	40044	40049	50 %	0 %	50 %	0 %	218534522
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60	NC_011747	TG	3	6	44588	44593	0 %	50 %	50 %	0 %	218534525
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62	NC_011747	TG	3	6	45373	45378	0 %	50 %	50 %	0 %	218534527
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68	NC_011747	AT	3	6	50748	50753	50 %	50 %	0 %	0 %	218534534
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70	NC_011747	AT	3	6	52432	52437	50 %	50 %	0 %	0 %	218534538
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73	NC_011747	CG	3	6	55134	55139	0 %	0 %	50 %	50 %	218534541
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109	NC_011747	CT	3	6	86420	86425	0 %	50 %	0 %	50 %	218534572
110	NC_011747	AC	3	6	86457	86462	50 %	0 %	0 %	50 %	218534572
111	NC_011747	GA	3	6	86539	86544	50 %	0 %	50 %	0 %	218534572
112	NC_011747	AG	3	6	86596	86601	50 %	0 %	50 %	0 %	218534572
113	NC_011747	AG	3	6	87542	87547	50 %	0 %	50 %	0 %	218534572
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124	NC_011747	AT	3	6	92238	92243	50 %	50 %	0 %	0 %	218534582
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.