MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ED1a chromosome

Total Repeats: 1997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011745	GGCG	2	8	7682	7689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011745	CTGT	2	8	8835	8842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011745	GAAT	2	8	10281	10288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011745	ATTC	2	8	11672	11679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011745	AGTG	2	8	11814	11821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011745	GACA	2	8	15445	15452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011745	ATTT	2	8	15562	15569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011745	ATTA	2	8	15639	15646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011745	AATG	2	8	15909	15916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011745	TCCC	2	8	29867	29874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_011745	TGGC	2	8	29908	29915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011745	CATG	2	8	31077	31084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011745	AGTG	2	8	31227	31234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011745	CCAG	2	8	36375	36382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011745	CTGA	2	8	39512	39519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011745	ATTT	2	8	43589	43596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011745	GTTT	2	8	43606	43613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011745	TGTT	2	8	51301	51308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011745	TCCA	2	8	70862	70869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011745	AAGA	2	8	72039	72046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011745	TTAT	2	8	72081	72088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011745	GGCA	2	8	72304	72311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011745	ATTC	2	8	72452	72459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011745	CCAG	2	8	85204	85211	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011745	ATTA	2	8	85488	85495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011745	AAGC	2	8	85819	85826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011745	AAGC	2	8	87248	87255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011745	GTTG	2	8	87336	87343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011745	TGGA	2	8	87461	87468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011745	ATTA	2	8	87598	87605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011745	TCTG	2	8	87738	87745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011745	AGGC	2	8	87808	87815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011745	CCCG	2	8	91341	91348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011745	TTAA	2	8	91349	91356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011745	AACA	2	8	91445	91452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011745	TTGG	2	8	119751	119758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011745	CCGC	2	8	119903	119910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011745	CTGC	2	8	124020	124027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011745	AATA	2	8	124081	124088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011745	CATT	2	8	127876	127883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011745	TCAA	2	8	128073	128080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011745	GATA	2	8	129088	129095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011745	CGGC	2	8	133696	133703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011745	AATT	2	8	147156	147163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011745	GAAT	2	8	147221	147228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011745	GGTA	2	8	155696	155703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011745	AATT	2	8	162208	162215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011745	TTTG	2	8	162992	162999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011745	CATT	2	8	163017	163024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011745	TTTA	2	8	163173	163180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011745	TTAC	2	8	166771	166778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011745	CTTT	2	8	173234	173241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011745	GGAT	2	8	190009	190016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011745	GAAA	2	8	196763	196770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011745	ATAA	2	8	197510	197517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011745	AGTT	2	8	202675	202682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011745	AAGG	2	8	214427	214434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011745	GGCT	2	8	220897	220904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011745	ATCA	2	8	227474	227481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011745	CCGG	2	8	229634	229641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011745	GTAG	2	8	229933	229940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011745	TAAA	2	8	230317	230324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011745	CTGA	2	8	230922	230929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011745	GTAC	2	8	231006	231013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011745	CGTC	2	8	231446	231453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011745	AAAG	2	8	231569	231576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011745	GCTG	2	8	232247	232254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011745	CCTG	2	8	233681	233688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011745	CCGT	2	8	233716	233723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011745	ATTT	2	8	235644	235651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011745	CCTG	2	8	241904	241911	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011745	CCGT	2	8	241939	241946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011745	AAGA	2	8	243104	243111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011745	TAAT	2	8	243152	243159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011745	TTAT	2	8	243201	243208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011745	TTAA	2	8	243296	243303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011745	TGGA	2	8	243913	243920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011745	CGTT	2	8	244001	244008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011745	CAGC	2	8	245000	245007	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011745	CCTT	2	8	263106	263113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011745	TATG	2	8	263314	263321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011745	TAAA	3	12	263328	263339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011745	TTAA	2	8	263340	263347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011745	AAGT	2	8	263414	263421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011745	TGAT	2	8	263429	263436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011745	TGAA	2	8	264441	264448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011745	GTGA	2	8	267572	267579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011745	GGGC	2	8	272275	272282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011745	AATC	2	8	278673	278680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011745	ATTT	2	8	280388	280395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011745	TTCA	2	8	280488	280495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011745	AGTG	2	8	281821	281828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011745	AGTA	2	8	291397	291404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011745	CGTT	2	8	294462	294469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011745	TATT	2	8	297282	297289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011745	TGCT	2	8	299712	299719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011745	CAGA	2	8	299737	299744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011745	AGCC	2	8	299781	299788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011745	TCTG	2	8	299947	299954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011745	ATTT	2	8	300078	300085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011745	ATGA	2	8	300289	300296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011745	CTGT	2	8	300616	300623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011745	ATGA	2	8	301014	301021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011745	AATT	2	8	301855	301862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011745	CAAC	2	8	301984	301991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011745	TTTG	2	8	302049	302056	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011745	GTCA	2	8	302728	302735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011745	AATA	2	8	302842	302849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011745	TCAC	2	8	303018	303025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011745	ATCG	2	8	309646	309653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011745	CAAG	2	8	312330	312337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011745	AATG	2	8	314311	314318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011745	AGGG	2	8	314368	314375	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011745	CTCC	2	8	315877	315884	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_011745	CTGA	2	8	319227	319234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011745	TGCT	2	8	320449	320456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011745	AACA	2	8	321010	321017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011745	GATA	2	8	321234	321241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011745	TGAT	2	8	326839	326846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011745	GTGG	2	8	327368	327375	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011745	TTCC	2	8	327460	327467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011745	CCAG	2	8	328045	328052	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011745	GGCA	2	8	328581	328588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011745	GGTG	2	8	337870	337877	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011745	CATT	2	8	338271	338278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011745	TTTA	2	8	342763	342770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011745	GTCG	2	8	342876	342883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011745	GGCA	2	8	343904	343911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011745	CCTG	2	8	344134	344141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011745	CTGG	2	8	344378	344385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011745	GTAT	2	8	344535	344542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011745	TTAT	2	8	344821	344828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011745	TATT	2	8	344955	344962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011745	GTAA	2	8	345038	345045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011745	AATC	2	8	345084	345091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011745	TATT	2	8	345810	345817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011745	AGTT	2	8	347383	347390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011745	TGCC	2	8	352618	352625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011745	CAAA	2	8	352874	352881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011745	ATTA	2	8	356534	356541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011745	TAAA	2	8	357576	357583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011745	TAAA	2	8	357607	357614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011745	GAAA	2	8	357793	357800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011745	GCAG	2	8	361850	361857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011745	AATG	2	8	369508	369515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011745	GTTA	2	8	376105	376112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011745	CTGA	2	8	377588	377595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011745	GTGG	2	8	377621	377628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011745	TTTA	2	8	379751	379758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011745	GTTG	2	8	380762	380769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011745	TCAT	2	8	385615	385622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_011745	TGTC	2	8	1298990	1298997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_011745	CTGA	2	8	1324154	1324161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_011745	CCAG	2	8	1332174	1332181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_011745	TCCA	2	8	1332379	1332386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_011745	GACA	2	8	1333212	1333219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_011745	ATAA	2	8	1333243	1333250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011745	CAGC	2	8	1333290	1333297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_011745	TAGG	2	8	1353225	1353232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_011745	TGTT	2	8	1353339	1353346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_011745	CGTC	2	8	1376591	1376598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_011745	ACTG	2	8	1377534	1377541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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