MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli ED1a chromosome

Total Repeats: 74536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011745	AAC	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011745	CGG	2	6	52	57	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
3	NC_011745	GAT	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
4	NC_011745	CGC	3	9	268	276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
5	NC_011745	TCG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
6	NC_011745	TTG	2	6	362	367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
7	NC_011745	CTG	2	6	494	499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
8	NC_011745	CCG	2	6	547	552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
9	NC_011745	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
10	NC_011745	ACT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
11	NC_011745	GGC	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
12	NC_011745	TTG	2	6	697	702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
13	NC_011745	GTT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
14	NC_011745	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687879
15	NC_011745	TGA	2	6	931	936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
16	NC_011745	GGC	2	6	1027	1032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
17	NC_011745	GTG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
18	NC_011745	ATC	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
19	NC_011745	AAG	2	6	1182	1187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
20	NC_011745	GGT	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687879
21	NC_011745	TCT	2	6	1334	1339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687879
22	NC_011745	GAT	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
23	NC_011745	TCA	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
24	NC_011745	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
25	NC_011745	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
26	NC_011745	GAA	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687879
27	NC_011745	ATC	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
28	NC_011745	TTG	2	6	1686	1691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
29	NC_011745	GTT	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687879
30	NC_011745	TCG	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
31	NC_011745	TAC	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687879
32	NC_011745	GCG	2	6	1817	1822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687879
33	NC_011745	TGA	2	6	1912	1917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
34	NC_011745	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
35	NC_011745	GAT	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
36	NC_011745	TGC	2	6	2145	2150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687879
37	NC_011745	CGC	2	6	2179	2184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687879
38	NC_011745	CGA	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687879
39	NC_011745	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
40	NC_011745	TGA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687879
41	NC_011745	TAT	2	6	2384	2389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687879
42	NC_011745	GCG	2	6	2562	2567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
43	NC_011745	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
44	NC_011745	CAA	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687880
45	NC_011745	GCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687880
46	NC_011745	GCA	2	6	2905	2910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687880
47	NC_011745	TGG	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687880
48	NC_011745	TGA	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
49	NC_011745	GAA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687880
50	NC_011745	CAT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687880
51	NC_011745	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
52	NC_011745	CGC	2	6	3084	3089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687880
53	NC_011745	TGA	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687880
54	NC_011745	CGG	2	6	3403	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687880
55	NC_011745	TGA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
56	NC_011745	TGA	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
57	NC_011745	GCG	2	6	3663	3668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
58	NC_011745	CGG	2	6	3758	3763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
59	NC_011745	GGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
60	NC_011745	TGA	3	9	4022	4030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
61	NC_011745	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687881
62	NC_011745	AAG	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687881
63	NC_011745	CGG	2	6	4192	4197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687881
64	NC_011745	CTG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
65	NC_011745	TGC	2	6	4241	4246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
66	NC_011745	ACG	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687881
67	NC_011745	AAC	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687881
68	NC_011745	GTT	2	6	4373	4378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687881
69	NC_011745	CCG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687881
70	NC_011745	GAT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
71	NC_011745	CCG	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687881
72	NC_011745	TGC	2	6	4682	4687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687881
73	NC_011745	TGA	3	9	4699	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687881
74	NC_011745	ATC	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687881
75	NC_011745	GAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011745	AAC	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011745	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687882
78	NC_011745	ACA	2	6	5105	5110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687882
79	NC_011745	CCG	2	6	5148	5153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687882
80	NC_011745	CGC	2	6	5158	5163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687882
81	NC_011745	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
82	NC_011745	ATC	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
83	NC_011745	CAT	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687882
84	NC_011745	GTT	2	6	5283	5288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687883
85	NC_011745	GGA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218687883
86	NC_011745	TCA	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687883
87	NC_011745	AAG	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687883
88	NC_011745	AAT	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687883
89	NC_011745	TCA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687883
90	NC_011745	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687883
91	NC_011745	TTC	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687883
92	NC_011745	TGC	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687883
93	NC_011745	TTG	2	6	5594	5599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687883
94	NC_011745	TGA	2	6	5601	5606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687883
95	NC_011745	GCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687883
96	NC_011745	GTG	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687883
97	NC_011745	CAT	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687884
98	NC_011745	GCC	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
99	NC_011745	GTT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687884
100	NC_011745	AGA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687884
101	NC_011745	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687884
102	NC_011745	CGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
103	NC_011745	GCC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218687884
104	NC_011745	AAT	2	6	7003	7008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687884
105	NC_011745	AGA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687884
106	NC_011745	CGG	2	6	7296	7301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687884
107	NC_011745	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218687884
108	NC_011745	TAA	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687884
109	NC_011745	AAG	2	6	7614	7619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011745	CGG	2	6	7746	7751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011745	CGT	2	6	7766	7771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011745	ATC	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011745	ACC	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218687885
114	NC_011745	CAG	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687885
115	NC_011745	CAG	2	6	8034	8039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687885
116	NC_011745	TGC	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687885
117	NC_011745	AAG	2	6	8275	8280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687885
118	NC_011745	CTG	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687885
119	NC_011745	TTG	2	6	8365	8370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687885
120	NC_011745	AGA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687885
121	NC_011745	TAC	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687885
122	NC_011745	CTG	2	6	8574	8579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687885
123	NC_011745	GCA	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687885
124	NC_011745	CTG	2	6	8778	8783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687885
125	NC_011745	TGA	2	6	8899	8904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687886
126	NC_011745	GCG	2	6	8950	8955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687886
127	NC_011745	GAA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687886
128	NC_011745	ATC	2	6	9057	9062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687886
129	NC_011745	TGG	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687886
130	NC_011745	CAC	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218687886
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257	NC_011745	ATG	2	6	17095	17100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687893
258	NC_011745	GGC	2	6	17122	17127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687893
259	NC_011745	CGG	2	6	17186	17191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687893
260	NC_011745	GTC	2	6	17329	17334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218687893
261	NC_011745	TTC	2	6	17368	17373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687893
262	NC_011745	AGC	2	6	17465	17470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687893
263	NC_011745	GTG	2	6	17513	17518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687893
264	NC_011745	GAA	2	6	17596	17601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687893
265	NC_011745	ATT	2	6	17749	17754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687893
266	NC_011745	ATG	2	6	17836	17841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687893
267	NC_011745	GAT	2	6	17959	17964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687893
268	NC_011745	GAT	2	6	18003	18008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687893
269	NC_011745	AAT	2	6	18019	18024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687893
270	NC_011745	GTG	2	6	18187	18192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687893
271	NC_011745	ATA	2	6	18215	18220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011745	TTG	2	6	18356	18361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218687894
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277	NC_011745	CTT	2	6	18723	18728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687894
278	NC_011745	AGA	2	6	18890	18895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218687894
279	NC_011745	GGT	2	6	18908	18913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687894
280	NC_011745	CAT	2	6	19008	19013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218687894
281	NC_011745	GCG	2	6	19040	19045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218687894
282	NC_011745	TTC	2	6	19120	19125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218687894
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285	NC_011745	GCA	2	6	19241	19246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687894
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289	NC_011745	GTG	2	6	19336	19341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218687894
290	NC_011745	AAT	2	6	19350	19355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218687894
291	NC_011745	ATT	2	6	19381	19386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687894
292	NC_011745	ATT	2	6	19592	19597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687894
293	NC_011745	AAT	2	6	19607	19612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_011745	TCA	2	6	19659	19664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_011745	ATT	2	6	19872	19877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687895
299	NC_011745	ATT	2	6	19881	19886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218687895
300	NC_011745	GAT	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218687895
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378	NC_011745	ACG	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218687900
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