MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio splendidus LGP32 chromosome 2

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011744	CATGTT	2	12	333	344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011744	TTTTAG	2	12	76289	76300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011744	GACAGT	2	12	125323	125334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011744	GACAAT	2	12	125335	125346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011744	AGATGT	3	18	130912	130929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011744	TTTCTA	2	12	160642	160653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011744	AGCTTT	2	12	162544	162555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011744	ATGTGA	2	12	189130	189141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011744	AAAACA	2	12	238831	238842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011744	ACTATA	2	12	239702	239713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011744	TATAAA	2	12	254031	254042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011744	TATCTC	4	24	258007	258030	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011744	TATCTC	3	18	258043	258060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011744	TTATTC	2	12	279709	279720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011744	TCAGTA	2	12	293118	293129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011744	TTAGCG	2	12	303751	303762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011744	ATTTAA	2	12	306549	306560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011744	ACTATC	2	12	311772	311783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011744	AAAATC	2	12	325449	325460	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011744	TTGTAT	2	12	350173	350184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011744	AAGCCT	2	12	371060	371071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011744	AAAATT	2	12	373644	373655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011744	TGTTTT	2	12	396881	396892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011744	TTTGGT	2	12	422934	422945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011744	GTTATG	2	12	453725	453736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011744	CCATGA	2	12	496691	496702	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011744	TTTTAT	2	12	520499	520510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011744	AATTTA	2	12	526024	526035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011744	TATTTT	2	12	537013	537024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011744	TATTGC	2	12	550875	550886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011744	GCAAAG	2	12	602914	602925	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011744	TAAATA	2	12	605857	605868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011744	TTTTGA	2	12	654000	654011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011744	TGGATA	2	12	667676	667687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011744	ATTTTG	2	12	691208	691219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011744	GATTTA	2	12	691313	691324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011744	GGTTTA	2	12	696124	696135	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011744	CGTATT	2	12	698843	698854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011744	ATGACT	2	12	705424	705435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011744	GGTATA	3	18	713198	713215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011744	TTCTCT	2	12	718557	718568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011744	AAATGA	2	12	735307	735318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011744	ATTTTC	2	12	735517	735528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011744	TTTTAA	2	12	738626	738637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011744	CATTTA	2	12	745667	745678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011744	AATAGT	2	12	745932	745943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011744	TAATGA	2	12	748296	748307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011744	GCAAAG	2	12	753431	753442	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011744	ATTTAT	2	12	772360	772371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011744	ATTTTA	2	12	796174	796185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011744	TTTTAG	2	12	797287	797298	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011744	ACTGTT	2	12	807551	807562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011744	TAAGTA	2	12	824855	824866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011744	TGATTG	2	12	853575	853586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011744	AACCAA	2	12	857934	857945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011744	AAAACG	2	12	872115	872126	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011744	TTGAAG	2	12	914590	914601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011744	ATCAAA	2	12	962324	962335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011744	AAAGTC	2	12	1001438	1001449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011744	CTCTCA	2	12	1035654	1035665	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011744	CTTTTT	2	12	1038979	1038990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011744	GAAATA	2	12	1094908	1094919	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011744	GTGATG	2	12	1153383	1153394	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011744	CTAAAT	2	12	1176230	1176241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011744	CAAAAA	2	12	1205644	1205655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011744	AAATTC	2	12	1234540	1234551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011744	AAGCAT	2	12	1234605	1234616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011744	ACAAAA	2	12	1236835	1236846	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011744	TCAAAC	2	12	1245405	1245416	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011744	TAATAC	2	12	1255726	1255737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011744	ACAAAA	2	12	1282512	1282523	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011744	TTGCTT	2	12	1293506	1293517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011744	TTGGTT	3	18	1334610	1334627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011744	TTAATA	2	12	1363147	1363158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011744	AGGGAT	2	12	1375217	1375228	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011744	ATTTCA	2	12	1376501	1376512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011744	AGTGTC	2	12	1380343	1380354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011744	ATTCCA	2	12	1390681	1390692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011744	TCATAA	2	12	1411469	1411480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011744	TTACTT	2	12	1418587	1418598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011744	CTAACA	2	12	1437307	1437318	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011744	AAAATA	2	12	1455630	1455641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011744	TTAATT	2	12	1459132	1459143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011744	AAAAAC	2	12	1487775	1487786	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011744	TAAAGA	2	12	1509186	1509197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011744	TTCGGA	2	12	1542062	1542073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011744	CAAATA	2	12	1566824	1566835	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011744	CAGGAA	2	12	1568883	1568894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011744	AAAAGG	2	12	1575060	1575071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011744	CAAAAT	2	12	1578379	1578390	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011744	ACTCTC	2	12	1590674	1590685	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011744	ATCAGC	3	18	1603385	1603402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011744	CTAACC	2	12	1623646	1623657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011744	CAGTGA	2	12	1672650	1672661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011744	TTATAC	2	12	1674995	1675006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.