MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio splendidus LGP32 chromosome 2

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011744	ATTGA	2	10	79	88	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011744	AAGCG	2	10	31605	31614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011744	AAATG	2	10	33927	33936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011744	TAGAT	2	10	38035	38044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011744	TATCT	2	10	39742	39751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011744	AAAGC	2	10	40842	40851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011744	ATAAA	2	10	48596	48605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011744	AAACA	2	10	49374	49383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011744	TAATT	2	10	57347	57356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011744	CTATC	2	10	82541	82550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011744	ATGAT	2	10	86343	86352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011744	TTTTC	2	10	90431	90440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011744	AAGGT	2	10	94626	94635	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011744	AAGGT	2	10	97165	97174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011744	ATTTT	2	10	99898	99907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011744	TCAAA	2	10	101221	101230	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011744	TTTCG	2	10	103424	103433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011744	CTTAT	2	10	122692	122701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011744	GATTA	2	10	126449	126458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011744	TACGA	2	10	129378	129387	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011744	GCATT	2	10	132646	132655	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011744	GTAAT	2	10	138574	138583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011744	GTTTG	2	10	143144	143153	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011744	TCTAT	2	10	157923	157932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011744	TTGAA	2	10	226498	226507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011744	TCGAT	2	10	239679	239688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011744	AATGG	2	10	260248	260257	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011744	TATTT	2	10	264680	264689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011744	TTCAC	2	10	266128	266137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011744	CCCAA	2	10	271040	271049	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_011744	GTTAA	2	10	297164	297173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011744	ATTTG	2	10	305411	305420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011744	TTTAA	2	10	311707	311716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011744	TGCTG	2	10	314871	314880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011744	TAAGG	2	10	316221	316230	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011744	TTTCA	2	10	317488	317497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011744	TTCCT	2	10	320750	320759	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011744	TATGC	2	10	325481	325490	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011744	TTTCT	2	10	326505	326514	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011744	GAAAA	2	10	337709	337718	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011744	CAATG	2	10	344337	344346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011744	CGGAC	2	10	358568	358577	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011744	TTCCG	2	10	360265	360274	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011744	TTGGA	2	10	364183	364192	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011744	AGTGT	2	10	368968	368977	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011744	ATTTA	2	10	408724	408733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011744	AAACC	2	10	417596	417605	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011744	CATGT	2	10	417632	417641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011744	ATTGG	2	10	421555	421564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011744	ATTGG	2	10	425205	425214	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011744	AGTTA	2	10	425707	425716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011744	AAAGG	2	10	435397	435406	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011744	GGAGC	2	10	436856	436865	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011744	GAAAG	2	10	458765	458774	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011744	ATGTC	2	10	461680	461689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011744	TATGA	2	10	462348	462357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011744	TGTTA	2	10	470902	470911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011744	CGTGT	2	10	477916	477925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011744	TATTT	2	10	484762	484771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011744	TTGAT	2	10	493143	493152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011744	TATAA	2	10	501107	501116	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011744	GACCA	2	10	501141	501150	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011744	TAAAC	2	10	504603	504612	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011744	TTCCC	2	10	504650	504659	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_011744	TATGT	2	10	525687	525696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011744	AAATT	2	10	550823	550832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011744	ACGAA	2	10	566721	566730	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011744	GAAAA	2	10	598102	598111	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011744	ATTAA	2	10	602825	602834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011744	TTATT	2	10	604188	604197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011744	TGGAA	2	10	604331	604340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011744	ACTTA	2	10	608496	608505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011744	GATTA	2	10	613462	613471	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011744	TGGTT	2	10	621398	621407	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011744	AGGAA	2	10	621564	621573	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011744	ATTGA	2	10	642405	642414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011744	GCTGT	2	10	676755	676764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011744	GATTA	2	10	690059	690068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011744	AAATA	2	10	694153	694162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011744	TGTAA	2	10	697238	697247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011744	TGAAC	2	10	698646	698655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011744	GATGA	2	10	701448	701457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011744	CAAAA	2	10	701720	701729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011744	GAGTT	2	10	705458	705467	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011744	TAAGG	2	10	712658	712667	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011744	ATTTT	2	10	712831	712840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011744	TTTGC	2	10	735432	735441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011744	TTGTT	2	10	739623	739632	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011744	AGTTA	2	10	741229	741238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011744	GAATA	2	10	741348	741357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011744	ATAAG	2	10	745721	745730	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011744	AATCA	2	10	772251	772260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011744	GAAAT	2	10	782067	782076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011744	AATAT	2	10	792677	792686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011744	AATTA	2	10	805384	805393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011744	ATTGA	2	10	807323	807332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011744	GTTTT	2	10	809123	809132	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011744	TCACC	2	10	819834	819843	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_011744	GTTAA	2	10	833812	833821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011744	GCCTA	2	10	835988	835997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011744	AATTC	2	10	838853	838862	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011744	ACTGC	2	10	855926	855935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_011744	ACTAA	2	10	858024	858033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011744	GGTTA	2	10	858034	858043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011744	CGTGT	2	10	863107	863116	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011744	TTTTA	2	10	864494	864503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011744	ACTCT	2	10	874582	874591	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011744	ATTAA	2	10	879046	879055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011744	ATACC	2	10	888531	888540	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011744	ACGTT	2	10	889602	889611	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011744	TTAAA	2	10	895489	895498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011744	AACCA	2	10	904850	904859	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011744	TGAGG	2	10	905423	905432	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011744	GATTA	2	10	905865	905874	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011744	ACGCA	2	10	906560	906569	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011744	AGATT	2	10	911992	912001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011744	CTGCC	2	10	932100	932109	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011744	ACGGA	2	10	985051	985060	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011744	CGTTA	2	10	986879	986888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011744	CAAAC	2	10	989240	989249	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011744	AGGAA	2	10	992956	992965	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011744	AATCC	2	10	998202	998211	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011744	GCTAT	2	10	1000989	1000998	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011744	CACAA	2	10	1003099	1003108	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011744	AGAAT	2	10	1020558	1020567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011744	CGTAA	2	10	1022507	1022516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011744	TGATT	2	10	1039518	1039527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011744	TGCTT	2	10	1054636	1054645	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011744	ATCTT	2	10	1062138	1062147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011744	GCGTT	2	10	1081679	1081688	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011744	TATTT	2	10	1114891	1114900	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011744	ATCAC	2	10	1137836	1137845	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011744	ATTAT	2	10	1148734	1148743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011744	TAAAG	2	10	1161432	1161441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011744	ATTGA	2	10	1220821	1220830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011744	CCTTT	2	10	1225534	1225543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_011744	CTCTA	2	10	1230301	1230310	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011744	AAATT	2	10	1234801	1234810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011744	GCCCA	2	10	1239692	1239701	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_011744	AGATT	2	10	1245558	1245567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011744	AAGTT	2	10	1252046	1252055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011744	GTTTA	2	10	1264487	1264496	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011744	GATTA	2	10	1272328	1272337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011744	TTTTG	2	10	1274770	1274779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011744	CTTTT	2	10	1293487	1293496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011744	GTTGG	2	10	1304874	1304883	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_011744	TTTAT	2	10	1623526	1623535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_011744	TTAAG	2	10	1645180	1645189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_011744	CTCTT	2	10	1669862	1669871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_011744	TAAAA	2	10	1674851	1674860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.