MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia fergusonii ATCC 35469 plasmid pEFER

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011743	AGTTC	2	10	465	474	20 %	40 %	20 %	20 %	218561637
2	NC_011743	GAAAA	2	10	3465	3474	80 %	0 %	20 %	0 %	218561641
3	NC_011743	TCAGC	2	10	4141	4150	20 %	20 %	20 %	40 %	218561641
4	NC_011743	CCCCG	2	10	4601	4610	0 %	0 %	20 %	80 %	218561642
5	NC_011743	CTTTC	2	10	5707	5716	0 %	60 %	0 %	40 %	218561642
6	NC_011743	ACGAT	2	10	6745	6754	40 %	20 %	20 %	20 %	218561645
7	NC_011743	GATCA	2	10	9626	9635	40 %	20 %	20 %	20 %	218561651
8	NC_011743	GCAAA	2	10	9668	9677	60 %	0 %	20 %	20 %	218561651
9	NC_011743	CTACC	2	10	12471	12480	20 %	20 %	0 %	60 %	218561655
10	NC_011743	AGAAA	2	10	12753	12762	80 %	0 %	20 %	0 %	218561655
11	NC_011743	TAGCG	2	10	13040	13049	20 %	20 %	40 %	20 %	218561656
12	NC_011743	AGTTG	2	10	13481	13490	20 %	40 %	40 %	0 %	218561656
13	NC_011743	ATCGA	2	10	16560	16569	40 %	20 %	20 %	20 %	218561659
14	NC_011743	GATGA	2	10	19527	19536	40 %	20 %	40 %	0 %	218561660
15	NC_011743	GCAGC	2	10	21561	21570	20 %	0 %	40 %	40 %	218561661
16	NC_011743	GTTGG	2	10	27651	27660	0 %	40 %	60 %	0 %	218561663
17	NC_011743	CGAAG	2	10	27785	27794	40 %	0 %	40 %	20 %	218561663
18	NC_011743	GGAAT	2	10	28230	28239	40 %	20 %	40 %	0 %	218561663
19	NC_011743	CGGCG	2	10	30988	30997	0 %	0 %	60 %	40 %	218561666
20	NC_011743	GACGC	2	10	32620	32629	20 %	0 %	40 %	40 %	218561666
21	NC_011743	TGATC	2	10	35471	35480	20 %	40 %	20 %	20 %	218561669
22	NC_011743	CAATC	2	10	39311	39320	40 %	20 %	0 %	40 %	218561672
23	NC_011743	CTCAA	2	10	40012	40021	40 %	20 %	0 %	40 %	218561673
24	NC_011743	ATTAT	2	10	40660	40669	40 %	60 %	0 %	0 %	218561674
25	NC_011743	GGTAA	2	10	40761	40770	40 %	20 %	40 %	0 %	218561674
26	NC_011743	CCAAG	2	10	42095	42104	40 %	0 %	20 %	40 %	218561675
27	NC_011743	TAGAT	2	10	42366	42375	40 %	40 %	20 %	0 %	218561676
28	NC_011743	AAAGT	2	10	42377	42386	60 %	20 %	20 %	0 %	218561676
29	NC_011743	TTCCT	2	10	43887	43896	0 %	60 %	0 %	40 %	218561678
30	NC_011743	TCCAA	2	10	43954	43963	40 %	20 %	0 %	40 %	218561678
31	NC_011743	GATTG	2	10	46904	46913	20 %	40 %	40 %	0 %	218561681
32	NC_011743	GGTGT	2	10	47112	47121	0 %	40 %	60 %	0 %	218561681
33	NC_011743	ATGTT	2	10	47406	47415	20 %	60 %	20 %	0 %	218561681
34	NC_011743	GCCTT	2	10	48624	48633	0 %	40 %	20 %	40 %	218561682
35	NC_011743	GGGAG	2	10	48856	48865	20 %	0 %	80 %	0 %	218561684
36	NC_011743	GGACA	2	10	50091	50100	40 %	0 %	40 %	20 %	218561686
37	NC_011743	CGCGG	2	10	51557	51566	0 %	0 %	60 %	40 %	218561688
38	NC_011743	GGACG	2	10	51897	51906	20 %	0 %	60 %	20 %	218561689
39	NC_011743	CATCC	2	10	53044	53053	20 %	20 %	0 %	60 %	218561691
40	NC_011743	CTGAA	2	10	53353	53362	40 %	20 %	20 %	20 %	218561691

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.